Basic Information

Symbol
CREB3L4
RNA class
mRNA
Alias
CAMP Responsive Element Binding Protein 3 Like 4 AIbZIP CREB4 ATCE1 HJAL Cyclic AMP-Responsive Element-Binding Protein 4 Attaching To CRE-Like 1 CREB3 Cyclic AMP-Responsive Element-Binding Protein 3-Like Protein 4 CAMP-Responsive Element-Binding Protein 3-Like Protein 4 Transcript Induced In Spermiogenesis Protein 40 Androgen-Induced Basic Leucine Zipper Protein CAMP-Responsive Element-Binding Protein 4 Androgen-Induced BZIP CREB-4 Tisp40 JAL CAMP Responsive Element Binding Protein 1 AIBZIP
Location (GRCh38)
1:153963719-153974364
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001255978.2
Sequence length
1749.0 nt
GC content
0.5346

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-648.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -678.02 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 306.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001255978.2 NCBI
GCCUUUGUUUACAACCCUGCCAUGAUCUCCCUCUUGCAAAAGCGAGGGC… 1749 nt 0.5346
NM_001255979.2 NCBI
GUAGUGUUUGGGGAGGUCAACGGGCUAUGCUGGCUUGACAGGGCUGGGC… 1547 nt 0.5398
NM_001255980.2 NCBI
GCCUUUGUUUACAACCCUGCCAUGAUCUCCCUCUUGCAAAAGCGAGGGC… 1689 nt 0.5323
NM_001255981.2 NCBI
GUAGUGUUUGGGGAGGUCAACGGGCUAUGCUGGCUUGACAGGGCUGGGC… 1487 nt 0.5373
NM_130898.4 NCBI
GCCUUUGUUUACAACCCUGCCAUGAUCUCCCUCUUGCAAAAGCGAGGGC… 1769 nt 0.5336
Summary

This gene encodes a CREB (cAMP responsive element binding) protein with a transmembrane domain which localizes it to the ER membrane. The encoded protein is a transcriptional activator which contains a dimerization domain, and this protein may function in a number of processing pathways including protein processing. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2011]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CREB3L4 mRNA was consistently upregulated in gastric tissues following 6 and 12 Gy X-ray irradiation, identifying it as a potential biomarker for radiation-induced gastric injury [Chen et al. DOI:10.1177/1559325819886766].