Basic Information

Symbol
ADGRG1
RNA class
mRNA
Alias
Adhesion G Protein-Coupled Receptor G1 TM7LN4 TM7XN1 GPR56 Adhesion G-Protein Coupled Receptor G1 G Protein-Coupled Receptor 56 7-Transmembrane Protein With No EGF-Like N-Terminal Domains-1 Testicular Tissue Protein Li 77 G-Protein Coupled Receptor 56 CDCBM14B CDCBM15A BFPP BPPR
Location (GRCh38)
16:57610652-57665580
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_201525.4
Sequence length
4257.0 nt
GC content
0.5807

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1660.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1734.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 798.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145770.3 NCBI
AGACUGGGUGCCUGUGGCCCUGGGAGGAGGUGGAAGGGGAGGAGCAGGC… 4293 nt 0.5784
NM_001145771.3 NCBI
GCACUAGCUGUCUGCCCUGCCCUGCCGUAGGAGAUGGGCUGGGAGCCUC… 4393 nt 0.5812
NM_001145772.3 NCBI
GCACUAGCUGUCUGCCCUGCCCUGCCGUAGGAGAUGGGCUGGGAGCCUC… 4401 nt 0.5803
NM_001145773.3 NCBI
GCACUAGCUGUCUGCCCUGCCCUGCCGUAGGAGAUGGGCUGGGAGCCUC… 4272 nt 0.5810
NM_001145774.3 NCBI
AGUGAGGGAGCAGUGGCUGGGGUGGCCCAGCUUCAAAGUCUCUGUCCUC… 4381 nt 0.5750
NM_001290142.2 NCBI
ACAAAGAGUUGGCAGAUCACGGAUGGAGGGCAGCAUCUCCCAACAGCCU… 3854 nt 0.5734
NM_001290143.2 NCBI
ACAAAGAGUUGGCAGAUCACGGAUGGAGGGCAGCAUCUCCCAACAGCCU… 4203 nt 0.5774
NM_001290144.2 NCBI
AGUGAGGGAGCAGUGGCUGGGGUGGCCCAGCUUCAAAGUCUCUGUCCUC… 4220 nt 0.5744
NM_001370428.1 NCBI
ACAAAGAGUUGGCAGAUCACGGAUGGAGGGCAGCAUCUCCCAACAGCCU… 4364 nt 0.5779
NM_001370429.1 NCBI
GCACUAGCUGUCUGCCCUGCCCUGCCGUAGGAGAUGGGCUGGGAGCCUC… 4275 nt 0.5815
Showing 1 to 10 of 29 entries
Summary

This gene encodes a member of the G protein-coupled receptor family and regulates brain cortical patterning. The encoded protein binds specifically to transglutaminase 2, a component of tissue and tumor stroma implicated as an inhibitor of tumor progression. Mutations in this gene are associated with a brain malformation known as bilateral frontoparietal polymicrogyria. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2014]

Forensic Context

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