Basic Information

Symbol
CTBP1
RNA class
mRNA
Alias
C-Terminal Binding Protein 1 BARS Brefeldin A-Ribosylated Substrate C-Terminal-Binding Protein 1 EC 1.1.1.158 EC 1.1.1.- EC 1.1.1 HADDTS CtBP1 CTBP
Location (GRCh38)
4:1211434-1250333
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001012614.2
Sequence length
2488.0 nt
GC content
0.6033

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1024.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1069.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 795.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001012614.2 NCBI
GCCCGCGCGGUCGUCGGAGCGCGGCUCAGCGGCGCGGCGGAGACUCGGC… 2488 nt 0.6033
NM_001328.3 NCBI
GCCCGCGCGGUCGUCGGAGCGCGGCUCAGCGGCGCGGCGGAGACUCGGC… 2293 nt 0.6110
NM_001377186.1 NCBI
GCCCGCGCGGUCGUCGGAGCGCGGCUCAGCGGCGCGGCGGAGACUCGGC… 2296 nt 0.6111
NM_001377187.1 NCBI
GCCCGCGCGGUCGUCGGAGCGCGGCUCAGCGGCGCGGCGGAGACUCGGC… 2491 nt 0.6034
NM_001377188.1 NCBI
GCGCAUGCGCGGGCCGCUGCGUGUGCGCGAGCGCCGCAGUCUGCUCUCC… 2344 nt 0.5896
NM_001377189.1 NCBI
GACACCUGCCAGGUUUCCUCCAGGCCACAGCUCGGCAGCCCGAUCUUAG… 2472 nt 0.5870
NM_001377190.1 NCBI
GGGAGAGUCUGCAGGGGCAGCCCCUGGGUGAGCAGGCCCAGUGCGGCCU… 2618 nt 0.5917
NM_001377191.1 NCBI
GCGCAUGCGCGGGCCGCUGCGUGUGCGCGAGCGCCGCAGUCUGCUCUCC… 2341 nt 0.5895
NM_001377192.1 NCBI
GACACCUGCCAGGUUUCCUCCAGGCCACAGCUCGGCAGCCCGAUCUUAG… 2469 nt 0.5869
NM_001377193.1 NCBI
GGGAGAGUCUGCAGGGGCAGCCCCUGGGUGAGCAGGCCCAGUGCGGCCU… 2615 nt 0.5916
Summary

This gene encodes a protein that binds to the C-terminus of adenovirus E1A proteins. This phosphoprotein is a transcriptional repressor and may play a role during cellular proliferation. This protein and the product of a second closely related gene, CTBP2, can dimerize. Both proteins can also interact with a polycomb group protein complex which participates in regulation of gene expression during development. Alternative splicing of transcripts from this gene results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study across multiple species demonstrated that the CTBP1 is required for the development of acute functional tolerance to ethanol in *Caenorhabditis elegans* [Farris et al. DOI:10.1016/J.Alcohol.2017.11.036].