Basic Information

Symbol
CTLA4
RNA class
mRNA
Alias
Cytotoxic T-Lymphocyte Associated Protein 4 CTLA-4 CD152 GSE CD Insulin-Dependent Diabetes Mellitus 12 Cytotoxic T-Lymphocyte Protein 4 Gluten-Sensitive Enteropathy Celiac Disease 3 CELIAC3 IDDM12 Ligand And Transmembrane Spliced Cytotoxic T Lymphocyte Associated Antigen 4 Cytotoxic T Lymphocyte Associated Antigen 4 Short Spliced Form Cytotoxic T-Lymphocyte-Associated Serine Esterase-4 Cytotoxic T-Lymphocyte-Associated Antigen 4 Celiac Disease CD152 Antigen ALPS5 GRD4
Location (GRCh38)
2:203853888-203873965
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005214.5
Sequence length
1997.0 nt
GC content
0.4241

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-598.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -635.48 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 609.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001037631.3 NCBI
GCUUUCUAUUCAAGUGCCUUCUGUGUGUGCACAUGUGUAAUACAUAUCU… 1887 nt 0.4224
NM_005214.5 NCBI
GCUUUCUAUUCAAGUGCCUUCUGUGUGUGCACAUGUGUAAUACAUAUCU… 1997 nt 0.4241
Summary

This gene is a member of the immunoglobulin superfamily and encodes a protein which transmits an inhibitory signal to T cells. The protein contains a V domain, a transmembrane domain, and a cytoplasmic tail. Alternate transcriptional splice variants, encoding different isoforms, have been characterized. The membrane-bound isoform functions as a homodimer interconnected by a disulfide bond, while the soluble isoform functions as a monomer. Mutations in this gene have been associated with insulin-dependent diabetes mellitus, Graves disease, Hashimoto thyroiditis, celiac disease, systemic lupus erythematosus, thyroid-associated orbitopathy, and other autoimmune diseases. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for CTLA4 Gene

Forensic Context

A study in human trauma patients demonstrated that CTLA4 mRNA was significantly downregulated in circulating CD3+ T cells during the injury stage compared to the recovery stage [Rau et al. DOI:10.2147/JIR.S375881].