Basic Information

Symbol
CTNNB1
RNA class
mRNA
Alias
Catenin Beta 1 Beta-Catenin Armadillo CTNNB Catenin (Cadherin-Associated Protein), Beta 1, 88kDa Catenin Beta-1 Catenin (Cadherin-Associated Protein), Beta 1 (88kD) Catenin (Cadherin-Associated Protein), Beta 1 NEDSDV MRD19 EVR7
Location (GRCh38)
3:41194741-41260096
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001904.4
Sequence length
3661.0 nt
GC content
0.4466

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1129.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1202.94 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 963.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001098209.2 NCBI
AAGCCUCUCGGUCUGUGGCAGCAGCGUUGGCCCGGCCCCGGGAGCGGAG… 3356 nt 0.4556
NM_001098210.2 NCBI
AAGCCUCUCGGUCUGUGGCAGCAGCGUUGGCCCGGCCCCGGGAGCGGAG… 3197 nt 0.4551
NM_001330729.2 NCBI
AAGCCUCUCGGUCUGUGGCAGCAGCGUUGGCCCGGCCCCGGGAGCGGAG… 3488 nt 0.4564
NM_001904.4 NCBI
AAGCCUCUCGGUCUGUGGCAGCAGCGUUGGCCCGGCCCCGGGAGCGGAG… 3661 nt 0.4466
Summary

The protein encoded by this gene is part of a complex of proteins that constitute adherens junctions (AJs). AJs are necessary for the creation and maintenance of epithelial cell layers by regulating cell growth and adhesion between cells. The encoded protein also anchors the actin cytoskeleton and may be responsible for transmitting the contact inhibition signal that causes cells to stop dividing once the epithelial sheet is complete. Finally, this protein binds to the product of the APC gene, which is mutated in adenomatous polyposis of the colon. Mutations in this gene are a cause of colorectal cancer (CRC), pilomatrixoma (PTR), medulloblastoma (MDB), and ovarian cancer. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 20 1 6] CIViC Summary for CTNNB1 Gene

Forensic Context

A study in cynomolgus monkeys demonstrated that chronic exposure to methamphetamine or heroin downregulated the CTNNB1 gene in the hippocampus compared to controls, as identified through RNA-Seq and validated by RT-qPCR [Choi et al. DOI:10.30773/pi.2022.0004]. In human corpus cavernosum tissue, comparative single-cell transcriptome analysis identified the CTNNB1 gene as a WNT pathway target with expression significantly higher in the fibroblast subcluster FB1 from patients with erectile dysfunction [Zhao et al. DOI:10.1038/s41467-022-31950-9].