Basic Information

Symbol
CTSA
RNA class
mRNA
Alias
Cathepsin A Lysosomal Protective Protein Carboxypeptidase C PPGB Carboxypeptidase Y-Like Kininase Protective Protein Cathepsin A Lysosomal Carboxypeptidase A Carboxypeptidase-L Urinary Kininase EC 3.4.16.5 Deamidase PPCA GSL Protective Protein For Beta-Galactosidase (Galactosialidosis) Protective Protein For Beta-Galactosidase Beta-Galactosidase Protective Protein Beta-Galactosidase 2 Carboxypeptidase L EC 3.4.16 GLB2 NGBE
Location (GRCh38)
20:45890144-45898949
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000308.4
Sequence length
1858.0 nt
GC content
0.5678

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-664.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -696.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 434.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000308.4 NCBI
AGUCCCCGGGCGCCUCCUGGAGAGCAAGGACGCGGGGGAGCAGAGAUGA… 1858 nt 0.5678
NM_001127695.3 NCBI
AGUCCCCGGGCGCCUCCUGGAGAGCAAGGACGCGGGGGAGCAGAGGUGA… 1904 nt 0.5720
NM_001167594.3 NCBI
AGUCCCCGGGCGCCUCCUGGAGAGCAAGGACGCGGGGGAGCAGAGAUGA… 1807 nt 0.5689
Summary

This gene encodes a member of the peptidase S10 family of serine carboxypeptidases. Alternative splicing results in multiple transcript variants, at least one of which encodes a preproprotein that is proteolytically processed to generate two chains that comprise the heterodimeric active enzyme. This enzyme possesses deamidase, esterase and carboxypeptidase activities and acts as a scaffold in the lysosomal multienzyme complex. Mutations in this gene are associated with galactosialidosis. [provided by RefSeq, Nov 2015]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.