Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001167594.3

Sequence Length

1807 nt

GC Content

0.5689

AGUCCCCGGGCGCCUCCUGGAGAGCAAGGACGCGGGGGAGCAGAGAUGAUCCGAGCCGCGCCGCCGCCGCUGUUCCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUAGUGUCCUGGGCGUCCCGAGGCGAGGCAGCCCCCGACCAGGACGAGAUCCAGCGCCUCCCCGGGCUGGCCAAGCAGCCGUCUUUCCGCCAGUACUCCGGCUACCUCAAAGGCUCCGGCUCCAAGCACCUCCACUACUGGUUUGUGGAGUCCCAGAAGGAUCCCGAGAACAGCCCUGUGGUGCUUUGGCUCAAUGGGGGUCCCGGCUGCAGCUCACUAGAUGGGCUCCUCACAGAGCAUGGCCCCUUCCUGAUUGCCAAUGUGUUAUACCUGGAGUCCCCAGCUGGGGUGGGCUUCUCCUACUCCGAUGACAAGUUUUAUGCAACUAAUGACACUGAGGUCGCCCAGAGCAAUUUUGAGGCCCUUCAAGAUUUCUUCCGCCUCUUUCCGGAGUACAAGAACAACAAACUUUUCCUGACCGGGGAGAGCUAUGCUGGCAUCUACAUCCCCACCCUGGCCGUGCUGGUCAUGCAGGAUCCCAGCAUGAACCUUCAGGGGCUGGCUGUGGGCAAUGGACUCUCCUCCUAUGAGCAGAAUGACAACUCCCUGGUCUACUUUGCCUACUACCAUGGCCUUCUGGGGAACAGGCUUUGGUCUUCUCUCCAGACCCACUGCUGCUCUCAAAACAAGUGUAACUUCUAUGACAACAAAGACCUGGAAUGCGUGACCAAUCUUCAGGAAGUGGCCCGCAUCGUGGGCAACUCUGGCCUCAACAUCUACAAUCUCUAUGCCCCGUGUGCUGGAGGGGUGCCCAGCCAUUUUAGGUAUGAGAAGGACACUGUUGUGGUCCAGGAUUUGGGCAACAUCUUCACUCGCCUGCCACUCAAGCGGAUGUGGCAUCAGGCACUGCUGCGCUCAGGGGAUAAAGUGCGCAUGGACCCCCCCUGCACCAACACAACAGCUGCUUCCACCUACCUCAACAACCCGUACGUGCGGAAGGCCCUCAACAUCCCGGAGCAGCUGCCACAAUGGGACAUGUGCAACUUUCUGGUAAACUUACAGUACCGCCGUCUCUACCGAAGCAUGAACUCCCAGUAUCUGAAGCUGCUUAGCUCACAGAAAUACCAGAUCCUAUUAUAUAAUGGAGAUGUAGACAUGGCCUGCAAUUUCAUGGGGGAUGAGUGGUUUGUGGAUUCCCUCAACCAGAAGAUGGAGGUGCAGCGCCGGCCCUGGUUAGUGAAGUACGGGGACAGCGGGGAGCAGAUUGCCGGCUUCGUGAAGGAGUUCUCCCACAUCGCCUUUCUCACGAUCAAGGGCGCCGGCCACAUGGUUCCCACCGACAAGCCCCUCGCUGCCUUCACCAUGUUCUCCCGCUUCCUGAACAAGCAGCCAUACUGAUGACCACAGCAACCAGCUCCACGGCCUGAUGCAGCCCCUCCCAGCCUCUCCCGCUAGGAGAGUCCUCUUCUAAGCAAAGUGCCCCUGCAGGCCGGGUUCUGCCGCCAGGACUGCCCCCUUCCCAGAGCCCUGUACAUCCCAGACUGGGCCCAGGGUCUCCCAUAGACAGCCUGGGGGCAAGUUAGCACUUUAUUCCCGCAGCAGUUCCUGAAUGGGGUGGCCUGGCCCCUUCUCUGCUUAAAGAAUGCCCUUUAUGAUGCACUGAUUCCAUCCCAGGAACCCAACAGAGCUCAGGACAGCCCACAGGGAGGUGGUGGACGGACUGUAAUUGAUAGAUUGAUUAUGGAAUUAAAUUGGGUACAGCUUCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-649.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -681.03

Frequency: 0.0000

Diversity: 458.66

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(.((.((((((((((((((((((((.(.(.((((.(((((((.((.......(((.(((....))).)))..))))))).)).))))).))))).)).)))).)....))))).)))).)))(((((.(..(((((.(((..((...((((.((((((((.((((((.((..(((((((.......(((........)))..(((...)))((..(((((((...(((.........)))...)))))))..))..(((((((.(....((((..((...))...))))...).))))))))))))))(((((......(((((((......))))..((((.(((((((((((...(((((((((((.((........(((.(.((((((.((((..(((((((......(((.((((.......)))).)))((((.((....(((.(((((((((....))))))))).))).))))))....)))))))..))))...............((((((((((.((((...)))).((((....(((((((.(.((.((..((((((((.((...)).))))).)))..)).)).).))..)))))...)))).(((.(((....))).))).......))))))))))......(((.........)))..((((((((..((((....))))..)))))))))))))).).))).......)).)))))))(((((.(.(......).).))))).))))...)))...)))))))).)))).((((((((((((..(((((((.(((((....(..((((.(((((..(((.(((((........))))))))....)))))))))..)....))))).)).)))))....((((.............))))(((((((.....)).))))).(((((.((((((((.....(((((((((((((....((((((..((((((.........(((((((((((((.(((...........))).))).(((.(........).))).)))))))))).......(((.(((.(((...((((((((......((((.((((((((((((.......((((((......(((((((.((((....))))..))))..)))...((((((((....))))).)))((((.......))))...))))))))))))).)))))))))((....))...))))))))..(((((.((.((((.((((((((((.(((..((.(((((..(((((((((((...((..(((.(((((((((.(...........).)))...))))))....(((.((((......)))).))).......(((.....))))))..))...))))).))))))))))).))...(((.....))).....)))...))))))......)))).).))).)).)))))....((((((.....))))))...........)))..))).)))))))))..))))))((((.(((((.(((....((.....((((((((.....((((...))))..))))).)))....)).)))))))).)))).....))))))))))))))))))))).)))))..(((((......)))))...(((......))).)))))...))))))).....((((......)))).)))...)))))..)).))))))...)))))))).))))))..)))...........((((((....)))))).)))))..).)))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(,((,((((((((({{{(({,(((,{({(,((((,({(((((.{..,.....(((.(((....})).)))},)),},))})),))})},)}}))})),)},},}}}}.))))).)))).))}(((((.{,,((({,.(((..((...((((.((((((((.((((((.((..(((((((.....,,(((,,....,.||}..{({...,||,{{|(((((((,,,(((.......,,}}|,,.}||}}||,.....|||||||}|}..,||||..}.))}))}..))),...},)))),,,)))))))(((((....,.{{{({((......}}}}..((((.(((((((((((...(((((((((((.(({{{....,(((,({((((((.((((..(((((((......(((.((((.......)))).)))((((.((...,(((.(((((((({....})))))))),)),.))))))....)))))))..))))...............((((((((((,((({...}))).,{{,....(((({|(|(|((.((..((((((((.((...)).))))),,))..)),))|)|))..)}))).,,}}||.(((.(((....))).))).......))))))))))......|||}}}..,,..}))..((((((((..((((....))))..))))))))}))}}}.},}},,,,....}}.))))))),(((,,{.,..,,.,},,.})))}.))))...))),..)))))))).)))).((((((((((((..{((((((.(((((....{..((((.(((((..(((.(((((.{.....}))))))))....)))))))))..}....))))).)).)))))....((((.............)))|(((((((.....)).))))),(((((.((((((((.....(((((((((((((,,..((((((..((((((....,,,..((((((((((({(.{{{.........,,||,.,}),||,.(|.......}.|}}.))))))))))......,((({{{{{(((...,(((((((,....,{({{.{{{({((({({{...,,.,|||{,,.,,,,,{{,((((.((((....))))..))))..}},...,{(({{{{....,}})),}}}||{{....,,,))))}..}}})))))})})).)))))}}))||....,,...))))}}}|..(((((.((.((((.(((({(((((.{((..({.,((((..,(((((((((,....((((((...(((..(((....}}},,}...(((({{.....,,..,)))))))))))....}|})}))}.,}}....,)})).,|||||,,,||...|||||.,,,}},,,,})})},.}|||,....}},.,,..,,}|,,}}}}}),.....)))).).))).)).)))))..,.{{{{{{.....||||}}...}}}}}}..)),..))).,,,))))))..))))))((((.(((((.(((....,,.....((((((((.....((({...})))..))))).)))....,).)))))))).)))).....))))))))))))))))))))).)))))..(((((......)))))...({(......))).)))))...)))))))...,.{(((......)))}.}}}...)))))..)).))))))...)))))))).))))))..))){{{{{,,....||||||,...,,,,,..,})))..}.)))))...