Basic Information

Symbol
CTSZ
RNA class
mRNA
Alias
Cathepsin Z Cathepsin X CTSX Cysteine-Type Carboxypeptidase Lysosomal Carboxypeptidase B Carboxypeptidase LB Cathepsin IV Cathepsin B2 Cathepsin Z1 Cathepsin Y Cathepsin P EC 3.4.18.1 Preprocathepsin P
Location (GRCh38)
20:58985686-59008238
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001336.4
Sequence length
1502.0 nt
GC content
0.5819

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-614.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -637.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 397.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001336.4 NCBI
AAAGUGCGGGGUCGGCCGGGUGCUGGGCCGAGGCCGAGGCCGGGGCGGG… 1502 nt 0.5819
Summary

The protein encoded by this gene is a lysosomal cysteine proteinase and member of the peptidase C1 family. It exhibits both carboxy-monopeptidase and carboxy-dipeptidase activities. The encoded protein has also been known as cathepsin X and cathepsin P. This gene is expressed ubiquitously in cancer cell lines and primary tumors and, like other members of this family, may be involved in tumorigenesis. [provided by RefSeq, Oct 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.