Basic Information

Symbol
CTXN2
RNA class
mRNA
Alias
Cortexin 2 Cortexin-2
Location (GRCh38)
15:48177875-48203758
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001145668.2
Sequence length
2704.0 nt
GC content
0.3924

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-669.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -722.22 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 505.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145668.2 NCBI
GUCUCACCAACAGACACAGACAUUUACACUUCUAGGCCAGGAAAGCGCU… 2704 nt 0.3924
NM_001370415.1 NCBI
GGGGAGCCAUGGGAGCUGGGGUCAGGGCCGCUGUUGCUGCAGUCGGCCC… 2724 nt 0.4027
NM_001370416.1 NCBI
GAAACAGCACCCCUAAUGCUAGCGCCACUGCUGAUGCGGCUGCCAGGCG… 2922 nt 0.3939
Summary

Predicted to be located in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.