Basic Information

Symbol
CUL3
RNA class
mRNA
Alias
Cullin 3 Cullin-3 CUL-3 KIAA0617 NEDAUS PHA2E
Location (GRCh38)
2:224470150-224585397
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003590.5
Sequence length
6756.0 nt
GC content
0.3758

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1728.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1862.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1853.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001257197.2 NCBI
GAGGACGACGUUCGGCCUGCGCAGUGAGAUGUUUGUCCGUCGCCGCCGC… 6558 nt 0.3765
NM_001257198.2 NCBI
AGACUGGAGCUUGAAAUUAAGAUCAAGUAUUUUCCCUUGUUUAUUUUUU… 6603 nt 0.3498
NM_003590.5 NCBI
GAGGACGACGUUCGGCCUGCGCAGUGAGAUGUUUGUCCGUCGCCGCCGC… 6756 nt 0.3758
Summary

This gene encodes a member of the cullin protein family. The encoded protein plays a critical role in the polyubiquitination and subsequent degradation of specific protein substrates as the core component and scaffold protein of an E3 ubiquitin ligase complex. Complexes including the encoded protein may also play a role in late endosome maturation. Mutations in this gene are a cause of type 2E pseudohypoaldosteronism. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2012]

Forensic Context

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