Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001257198.2
Sequence Length
6603 nt
GC Content
0.3498
AGACUGGAGCUUGAAAUUAAGAUCAAGUAUUUUCCCUUGUUUAUUUUUUUUCUAGCUGUGUCAUUCUGAAUUGCCUGGAAUUUCAAAUUCUCACCCUUUCCCCCACCCACCCUGUUCUAAAUUUUUUCUUGUAGAAAAUUAUUCACAGAGGACUAAAGACUUCUUGUCCUUUGUAUGUAGUAGAUGUUAAGAAUUCACUUCUUUUCAUUUAGUUUUAAUUUGUCUCAUGAUGUAGUUCUCUCAGUAAUCACAGAACCUUCAAGAUGUAUGACCAUGGAUGAAAAAUAUGUAAACAGCAUUUGGGACCUUCUGAAAAAUGCAAUUCAAGAAAUCCAGCGUAAGAAUAACAGUGGUCUUAGUUUUGAGGAGCUCUAUAGAAAUGCAUAUACAAUGGUUUUGCAUAAACAUGGAGAAAAGCUCUACACUGGACUAAGAGAAGUUGUUACCGAACAUCUCAUAAAUAAGGUGCGAGAAGAUGUACUAAAUUCAUUGAAUAACAACUUUCUUCAAACGCUAAAUCAAGCUUGGAAUGAUCAUCAAACAGCUAUGGUGAUGAUUAGAGACAUACUAAUGUACAUGGACCGUGUGUAUGUACAACAAAAUAAUGUGGAGAACGUCUACAAUUUGGGAUUAAUUAUUUUUCGAGAUCAAGUUGUACGUUAUGGGUGUAUUAGGGAUCAUCUACGGCAAACUCUAUUGGAUAUGAUUGCAAGAGAGCGGAAAGGAGAAGUCGUAGACAGAGGCGCAAUAAGAAAUGCUUGCCAGAUGUUAAUGAUUUUAGGUCUCGAAGGAAGAUCAGUCUAUGAAGAAGAUUUUGAGGCUCCUUUUUUGGAAAUGUCUGCAGAAUUUUUUCAGAUGGAAAGCCAGAAAUUUUUAGCAGAAAAUAGUGCUUCAGUAUAUAUAAAGAAAGUAGAAGCUAGAAUUAAUGAAGAAAUAGAACGAGUGAUGCACUGCCUUGACAAAUCAACGGAAGAACCAAUUGUAAAGGUGGUUGAAAGGGAACUCAUUUCCAAGCACAUGAAGACUAUAGUAGAAAUGGAGAAUUCUGGGCUAGUACAUAUGUUGAAAAAUGGAAAGACAGAAGACCUUGGUUGCAUGUACAAGUUAUUUAGUCGUGUGCCAAAUGGUUUGAAAACAAUGUGUGAGUGUAUGAGUUCCUAUUUGAGGGAGCAAGGUAAAGCUCUUGUUUCUGAAGAAGGAGAAGGAAAGAAUCCUGUUGACUAUAUCCAGGGCUUAUUGGAUCUGAAGAGUAGGUUCGAUCGCUUCCUCCUGGAAUCAUUCAACAAUGACCGUCUCUUUAAACAAACUAUUGCGGGUGACUUUGAGUAUUUUCUCAACCUCAACUCCAGGUCUCCUGAAUACCUCUCAUUAUUUAUUGAUGAUAAGCUGAAAAAGGGAGUCAAAGGGCUAACAGAACAAGAAGUAGAAACAAUAUUGGAUAAAGCAAUGGUCCUUUUUAGGUUUAUGCAAGAAAAAGAUGUAUUUGAACGUUAUUAUAAACAACACUUGGCAAGGAGACUUCUCACAAAUAAAAGUGUUUCUGAUGACUCUGAAAAAAACAUGAUAUCUAAGUUAAAGACUGAAUGUGGAUGUCAGUUCACGUCAAAACUGGAAGGAAUGUUUAGGGAUAUGAGCAUCUCAAACACAACGAUGGAUGAAUUCAGGCAACAUCUACAGGCAACUGGUGUAUCUUUAGGUGGUGUUGAUCUUACAGUCCGGGUGCUCACGACAGGAUAUUGGCCCACUCAGUCAGCCACACCAAAGUGCAACAUCCCACCAGCACCAAGACAUGCUUUUGAGAUAUUCAGAAGGUUCUACUUAGCCAAACACAGUGGUCGACAGCUCACACUCCAGCAUCAUAUGGGUUCUGCAGAUCUCAAUGCCACAUUUUAUGGACCAGUUAAAAAGGAAGAUGGAUCUGAAGUUGGUGUUGGAGGUGCACAAGUAACUGGCUCUAAUACACGGAAGCACAUAUUGCAAGUUUCCACUUUCCAGAUGACCAUAUUAAUGCUCUUUAAUAAUAGAGAAAAAUACACAUUUGAGGAAAUUCAGCAAGAGACAGAUAUCCCUGAAAGAGAGCUUGUUAGAGCCCUACAGUCCCUCGCCUGUGGUAAACCAACACAGCGGGUUCUUACAAAAGAACCCAAAUCAAAGGAAAUAGAAAAUGGUCAUAUAUUUACAGUUAAUGAUCAAUUCACAUCCAAACUACACAGAGUCAAGAUUCAAACAGUUGCUGCCAAACAAGGUGAAUCCGACCCAGAGAGGAAAGAAACAAGGCAGAAAGUAGACGACGACAGAAAACAUGAGAUAGAAGCUGCUAUAGUGCGGAUAAUGAAAUCUAGAAAGAAGAUGCAGCACAAUGUUCUAGUAGCGGAGGUAACUCAGCAGUUGAAGGCGCGAUUCUUACCAAGUCCAGUUGUUAUUAAGAAACGUAUUGAAGGACUUAUUGAGAGAGAAUAUUUGGCACGAACACCUGAGGAUCGCAAAGUAUACACAUAUGUAGCAUAAAAUGCGUUCAGAAAUUUGAUUUAUUCUUGGACUGUACUCUUCGCAUGGACUGGGAAGUUCUUUUAAAUCAUUAAAUAUUAAGACGACCAUCUCUUCUAUUAAAUUACAGUACAUGUUCUAGACCAUUGAGAUCAAGCCUUUACUCCCUUUGAGAGUUUCCAACAUCAGUUGAUUGAGCUUCAGGCUUUACAACGUUUAUCCCUGUAGAGAUCAUCUUUACAGUUCCUCGGGAAAAUGUGAAUGUGCUGCGUUUUGUUUUCUUUACUGUAUGAAAACAGGAAAAUAAAAGAGAAAUUUAGAAAAUACAGCUCAUUACAAUAAAAUUGUUGGAUUUCAUUUCCCCAGGUCUUCAGUGUUGAUGUAAAUGUGUUUUGUAGUGUUGCUUAGCACUUUGCGCAUUGUGUAAGUUGGGUAACAAAAAUGGCAAAAGAAAUGCAGAUUUCCCAGUUAUCUUGCUCUGAAGACAUUUCUUUAGCUAGUCUUAUUUAAUUUUAAAGGUUUGAUAAAUAUACAAAGACCCAAGCAUACAAUUUGAGCAUGCUGUAUUCUACCACUUGCACUUACUCAUCUUCUAGCCUUAUGACCAGGAACCUUUGUUUUGGGCUCAAGUACACAUCCUGAUUUGGUUUCUCCCUGUUGUAAUUUGAGAUUUCCCAAAUUAAGUCUUAUAAUGAUUAGGUUUUGUUCUGAGUUAUUUCUAGAGAAAGAAAGUAUUUUAGUAUGUGUAAAUUGUACAAUAAUUUUUUUGCUGUUGUACUCACUGCUAAUAGUGGAUUGUAUAGGGUGGUGUUUUUAUUUCAUUUAUUGUAGACAAAAAUAAUGAAUUUAGUAUACACAUACCCACUAAUUCAAGUAUGUCAGAGCACAAAGUUGGCAGCUGGUUAUAUUUAAUUCAGCCCCUCUGAAAAGCACAUACAGUCUAUACUUUGUUUAUAAAUACCCUAGGUCCUCCCUGCCCCUAAAUAUAUAUUUUGGUGAAGCUGUGGUGCACUAUUAAUUUUCUGUUUCAAAAUGCAAUCUAAAGAUGCAAUAAAUAUGAUGACCUUGAUAGUUUUAAUGAAAUCUUCAAUUCUUGCAGCUGUGUUUUGGAAAGUGAUUAAGCAAUAUUUCUCAAACCUGAUGAUUCUUGGAUAUUUAGCUAUUGUCCUCCAAAGAGUCAUCGUUUCACGUUUUCAAACAUGUGCUUUGUGCUGAAGAUUCUUGUCAGAUAUCCUGUGCUUCCAGAGUAUUUUUAUCUUCAAUUUUAUUUAAUUUUGUUUCAUUUUGUUUUCAUAAGACAAUGUUUCAGAUAUGUAAUGGGGCAAACCACUAUAGAUUUCUGUUGGAUAGAAAAAUGAAAUGUUACUAAUAAGUUUAAAUUGACCCUUCGUUGACUAUCAGUACUGUUGAUACAUUUAUUAGAAUGUAUGUCUCAGAAGAUGGUUUCUGUUUAAAUUUAUGGUCAAGUUACAACAACUGAAUUCUAAUAUGGAUUAAAAACUCCACAUAAAUAUUUUUCCCCAUGCGUCUUGGGUUAUAAUUUUCCUUUUAGACUUGCAAAUAUGCUUUUAUUGCAAUUUUGUCUCCAUCUGUACUGUAGAAUUACAAGCCUUGUGCUCUUUAUCUCUACAUUUUCCACUUCUACAUGAUGCAAUUAAGAUGCCAAUGAAAAGUAUUGUGAACAUUAUUCUCAGGACACUUUUACCAUACUUGAGUAGUACUAAGUCAGGUGUAACAUGGAAAGCUAAGGGUUUCACCUUCUGAUUUUGACAUAAUUGGAAAUUUUCUAUAAUGGUAAGAUGUUUAUAGGAAAGUAAUGGUAGUUCAUGUUUGAGAAUUUUUUUAUUGCUUUCAUUUCCCAGUUAAAUGAUAUUUAACACCUGGGAAAACAGGACAGCUCAGAUUGUCGAGUUAGUAAACAUGAGCGAUGUAAAAACUUUAUUUGAAAUCUCCUAAGUGAGACAUUAAACAUUUUAGUGCUAGUUUAAGCCAUUAAAAGUAAAGUUUAAGUUUACGUCAUUGUCUCAAGUGUGGCUGUAAAAAUCAGAUCUAGAGUUUAGAGACAUACUUGUUAACUUUGGAGCACAGGUUUGAUAUUUAUGCUUCUAAAUACAUUAAAACAUUUCUGAAUUGCAGUUGAAUGGUUGGAGAUUGCUGGCGAUGUGAUGCUGCACUGAAAAAACUGGUCACACAAAAUGUUUAUAUGUUUGACUGCAUAAGUAUUAUUUUAGGUCAUAAAGGUUAUAACAAAAUACAUUUAACAUUGCUUUCUUUUUAGCAAGAGGUCACAGAUGCUAUUUUUUCUCAGUUUUUAAUGCUUUAAUUUGAAAGAAAAAUGCAUCCUAACCAUUCCAUCCUGUUGGUGCAGAGAAAUUUUGGUGAUUUAUUAGAAGACUUUUAAGGAGGGUGGAUACAUAGUUUUUCAACUGCAAAAAUCAUGUCAUCUCUUCAGUAACUGUUAAAGUGUAAUUCUCUGCCUUCAUUAUCAAGUCCAGGACAGUGUUUAUUUUGAA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1602.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1732.85
Frequency: 0.0000
Diversity: 1971.19
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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