Basic Information

Symbol
CYP26B1
RNA class
mRNA
Alias
Cytochrome P450 Family 26 Subfamily B Member 1 P450RAI-2 Cytochrome P450, Family 26, Subfamily B, Polypeptide 1 Cytochrome P450 Family 26 Subfamily A Member 1 Cytochrome P450 Retinoic Acid-Inactivating 2 Retinoic Acid-Metabolizing Cytochrome Cytochrome P450 26B1 P450RAI2 CYP26A2 Cytochrome P450, Subfamily XXVIB, Polypeptide 1 Cytochrome P450 Retinoid Metabolizing Protein Cytochrome P450 26A2 Cytochrome P450RAI-2 EC 1.14.13.- RHFCA
Location (GRCh38)
2:72129238-72147862
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_019885.4
Sequence length
4556.0 nt
GC content
0.5621

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1829.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1906.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1187.10
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001277742.2 NCBI
ACAGCCAAUCCCCCGAGCGGCCGCCAACAUGCUCUUUGAGGGCUUGGAU… 4331 nt 0.5590
NM_019885.4 NCBI
ACAGCCAAUCCCCCGAGCGGCCGCCAACAUGCUCUUUGAGGGCUUGGAU… 4556 nt 0.5621
Summary

This gene encodes a member of the cytochrome P450 superfamily. The cytochrome P450 proteins are monooxygenases which catalyze many reactions involved in drug metabolism and synthesis of cholesterol, steroids and other lipids. The encoded protein is localized to the endoplasmic reticulum, and functions as a critical regulator of all-trans retinoic acid levels by the specific inactivation of all-trans retinoic acid to hydroxylated forms. Mutations in this gene are associated with radiohumeral fusions and other skeletal and craniofacial anomalies, and increased levels of the encoded protein are associated with atherosclerotic lesions. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Apr 2013]

Forensic Context

A study in mice and rats demonstrated that a topographic transcriptomic analysis of the nucleus accumbens shell identified the retinoic acid signaling pathway as a key target, with the CYP26B1 being a core component of this pathway [Crofton et al. DOI:10.1016/J.Neuropharm.2020.108398].