Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_019885.4
Sequence Length
4556 nt
GC Content
0.5621
ACAGCCAAUCCCCCGAGCGGCCGCCAACAUGCUCUUUGAGGGCUUGGAUCUGGUGUCGGCGCUGGCCACCCUCGCCGCGUGCCUGGUGUCCGUGACGCUGCUGCUGGCCGUGUCGCAGCAGCUGUGGCAGCUGCGCUGGGCCGCCACUCGCGACAAGAGCUGCAAGCUGCCCAUCCCCAAGGGAUCCAUGGGCUUCCCGCUCAUCGGAGAGACCGGCCACUGGCUGCUGCAGGGUUCUGGCUUCCAGUCGUCGCGGAGGGAGAAGUAUGGCAACGUGUUCAAGACGCAUUUGUUGGGGCGGCCGCUGAUACGCGUGACCGGCGCGGAGAACGUGCGCAAGAUCCUCAUGGGCGAGCACCACCUCGUGAGCACCGAGUGGCCUCGCAGCACCCGCAUGUUGCUGGGCCCCAACACGGUGUCCAAUUCCAUUGGCGACAUCCACCGCAACAAGCGCAAGGUCUUCUCCAAGAUCUUCAGCCACGAGGCCCUGGAGAGUUACCUGCCCAAGAUCCAGCUGGUGAUCCAGGACACACUGCGCGCCUGGAGCAGCCACCCCGAGGCCAUCAACGUGUACCAGGAGGCGCAGAAGCUGACCUUCCGCAUGGCCAUCCGGGUGCUGCUGGGCUUCAGCAUCCCUGAGGAGGACCUUGGGCACCUCUUUGAGGUCUACCAGCAGUUUGUGGACAAUGUCUUCUCCCUGCCUGUCGACCUGCCCUUCAGUGGCUACCGGCGGGGCAUUCAGGCUCGGCAGAUCCUGCAGAAGGGGCUGGAGAAGGCCAUCCGGGAGAAGCUGCAGUGCACACAGGGCAAGGACUACUUGGACGCCCUGGACCUCCUCAUUGAGAGCAGCAAGGAGCACGGGAAGGAGAUGACCAUGCAGGAGCUGAAGGACGGGACCCUGGAGCUGAUCUUUGCGGCCUAUGCCACCACGGCCAGCGCCAGCACCUCACUCAUCAUGCAGCUGCUGAAGCACCCCACUGUGCUGGAGAAGCUGCGGGAUGAGCUGCGGGCUCAUGGCAUCCUGCACAGUGGCGGCUGCCCCUGCGAGGGCACACUGCGCCUGGACACGCUCAGUGGGCUGCGCUACCUGGACUGCGUCAUCAAGGAGGUCAUGCGCCUGUUCACGCCCAUUUCCGGCGGCUACCGCACUGUGCUGCAGACCUUCGAGCUUGAUGGUUUCCAGAUCCCCAAAGGCUGGAGUGUCAUGUAUAGCAUCCGGGACACCCAUGACACAGCGCCCGUGUUCAAAGACGUGAACGUGUUCGACCCCGAUCGCUUCAGCCAGGCGCGGAGCGAGGACAAGGAUGGCCGCUUCCAUUACCUCCCGUUCGGUGGCGGUGUCCGGACCUGCCUGGGCAAGCACCUGGCCAAGCUGUUCCUGAAGGUGCUGGCGGUGGAGCUGGCUAGCACCAGCCGCUUUGAGCUGGCCACACGGACCUUCCCCCGCAUCACCUUGGUCCCCGUCCUGCACCCCGUGGAUGGCCUCAGCGUCAAGUUCUUUGGCCUGGACUCCAACCAGAACGAGAUCCUGCCGGAGACGGAGGCCAUGCUGAGCGCCACAGUCUAACCCAAGACCCACCCGCCUCAGCCCAGCCCAGGCAGCGGGGUGGUGGUUGUGGGAGGUAGAAACCUGUGUGUGGGAGGGGGCCGGAACGGGGAGGGCGAGUGGCCCCCAUACUUGCCCUCCCUUGCUCCCCCUCCCUGGCAAACCCUACCCAAAGCCAGUGGGCCCCAUUCCUAGGGCUGGGCUCCCCUUCUGGCUCCAGCUUCCCUCCAGCCACUCCCCAUUUACCAUCAGCUCAGCCCCUGGGAAGGGCGUGGCAGGGGCUCUGCAUGCCCGUGACAGUGUUAGGUGUCAGCGCGUGCUACAGUGUUUUUGUGAUGUUCUGAACUGCUCCCUUCCCUCCGUUCCUUUCGGACCCUUUUAGCUGGGGUUGGGGGACGGGAAGAGCCGUGCCCCCUUGGGCGCACUCUUCAGCGUCUCCUCCUCCUGCGCCCCCACUGCGUCUGCCCAGGAACAGCAUCCUGGGUAGCAGAACAGGAGUCAACCUUGGCGGGGCGGGGGCUGCGUCCAACCUGGAGAUUGCCCUUCCCUAUGCCACGGUUCCCACCCUCCCUCACCAGUUUGGACAAUUUGAAAUUACCUAUUGCUGCUACUUGUUCUGUCCUCUGACCUUGGGGCAAAGGAGCCCCAGGCCCUGUCUCCCCAGCAUCCUCCCUGGUGGCCCUGGGCAGGUGCACUGACACCCCCACCUUCCCAUCCCCUGCUGAACCAGGCCCUGUUACACACAGCCGCCUAAGGCCCGCGGCUCAUGUGCUGCCCGCCCCCAUAUUUAUUCACUGAUAGAGAAUCUUGGGGAUGCUGGGGUCUGGAGUGAACAUCUCCUCCCCUUCAUGCCCUAGCCUGUGUUCUAGCUGUCCUGGCGAGACUUCUGUGAGUGAAGAGGAAGGGGUCUCUGGUCAAACCCAGCCCCCAGGGCCUAGGGUUGAAAGCCUUCCCCGGCUCCGGGCAUUAUUUGGGUUUAAUCUCGGAGCCUCACUCCUGGACUGAAGUCCGGUGCCUCUGCCUUAUCCCUGGUGGAGAUGGAAUGUGGCCCAUUGCCUCCUCCCUCUCCUGUCAAAAACCCUGAUCAGGUAGAUUUGGAGGCGGCCACGAUUUCCUGUUUGGCCCCUGUUCACCCCAGUGCACUGGCCCUGACUCCAGGCGUGAGUAUGGGGAAGGAUACGGGUUCUUCUGACGGGGAGCAAGGGCCUCCGUCUUCCCUUCCUUAACUCUCCCCCUUUGCCCUCCGCCCUGAAAAAGGUGUCCUUGAAGUCCCUUCCACCUCUAUGCCACUGUCUGCUUAGCCCAGCUCAGGGGUGGGGAAGAGGCGAAAGCGUGGGGGAGGUGAGCGCAGCGGCAGUUCUGCCUCGGAGCUGAUUGCAGGGCCCUGUGUGGUCUCCGGACAGCUGCGGGAAGGCUGCCGCAGCUGAAGCUGAAGAGGCGGCUACGUGCGGUUUGUCAGGGGGAUUGGGUUGAAAACUGGCCAGUCGGGAUGACUGGGUGAAAGAGGAGUAGCUCCUGCCACUGGCGUUUUGAGUGUUGGCAAUUUGGGAUGCCUCCUGGGGAAGGUUUCCGGGCGUUUGGUGAGUCUCUAGAUUUUUCCUUGCUUUCUGUGUUUAUUGGUUUUUGAUGUUGUAAAAGCAAUGAAUCCCCUUUACAAGAAAAUCGAAAACACAGAAGAAUGAAGGACAUGCCAGUCCCCGAUCGCUGCUGUGAGCACCUCAGUGGCUCCCUCAGACCAGAUCCCGUAGGCAGCCCCACAGACCGACCCUGACCCCACUCACAGCCACCCUGAAGAUAGACUAUAGGAACGGGCCCAUACCACACAGACUGCUCUCCAAUCCCUGAGUCUCAGAUGUUUCAUUUAUUUCCUACUUUUCCACUACUAAAAAACAGUGUGGAAUAGACAUUAUUGGCAAAAUUGCUCAUCCCUAAUCCUGAAAAACAGGCCAGAAUGGGUAAAGACUUGUCAAAGCUUGCAACAUAGCUACAUGGUGCACCCGGACCUGUACCCCCUCCCCCCAACACAAAACCAGUGUCUGGGAGGUUCAUUUUCCUUUAAACUGAUCCAGCUGGCCCUGAACCAAUUGUUUUUGACUGAGUAUCUAGGAGAGCAGUAAGUGGAACUUCAGACAAGCCCACUGGGUCUGGUCCAGGUGAGGGGCAGGGGGCAUGGGGCUGGGAGGUCUCAGGGGCCUUCCCUGGGGGUGGCCAGCCUGGUAGGGGGCAGAGAAGGAAAAGCUGAGGGGGGUCCCUGUGAGGGAGGAAAGAAGGAUCAUUUGCCCCGCUGGGUCUCAAAGGCAGUGAGAAGAGAGCUGAAGAAAGCUCUGGCUGGCUGACAGGAUCCCUGUGUUGUAAUUGGUCCCUCCUUUCAGCUCUCUAGUGAGAUGCCCGUGUCUGUGCGUGUGCGUGUGUGUUUCAUACAGCUAGCAUUAGAUGGGUGAUGUUUCUUACUUAUCAUCCCUAACUAUUGCAACUUGACCUUAAAAAGACAAAACCCCACAAAACUCUUCCUGCCACGGGCUUGCAGAUUGAAGCACUUUCGAUGUUGGGCGCUGGCGUUUGUGUUCUGGGCACCACCGUGACCCUGCCCAGAUGGCUAUAAUAUUAUUUUAUACACAAACCUUUUUUUUCAUAAAUGUUAUAAUUUUGUGUCUGUCUUUAUAAACUAUUAUAAGUACUAUUUUUGUUAUAAUUCAAAAUAGAUAUUUAGUAUAAAGUUUUUGCUGUUAAAUAUUUGUUAUUUAGUAAAAUAUGAAUUUUGCUCUAUUGUAAACAUGGUUCAAAAUAUUAAUAUGUUUUUAUCACAGUCGUUUUAAUAUUGAAAAAGCACUUGUGUGUUUUGUUUUGAUAUGAAACUGGUACCGUGUGAGUGUUUUUGCUGUCGUGGUUUUAAUCUGUAUAUAAUAUUCCAUGUUGCAUAUUAAAAACAUGAAUGUUGUGCAUUUUGUGAUUUUGGAAAUACUCAAUGUGGCUCUUCUAUAGGCUUCUAGAAUAAACCGUGGGGACCCGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1829.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1906.58
Frequency: 0.0000
Diversity: 1187.10
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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