Basic Information

Symbol
CYSLTR1
RNA class
mRNA
Alias
Cysteinyl Leukotriene Receptor 1 CYSLT1R CysLT1 Cysteinyl Leukotriene D4 Receptor G-Protein Coupled Receptor HG55 LTD4 Receptor CysLT(1) HMTMF81 CysLTR1 CYSLTR CYSLT1
Location (GRCh38)
X:78271468-78327691
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006639.4
Sequence length
2700.0 nt
GC content
0.3581

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-622.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -675.70 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 641.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001282186.2 NCBI
AGUUUGAAGGCUAAUCUGAAAGAGGAAGAAGAAUCUGUAUAUCUGUAUA… 2613 nt 0.3555
NM_001282187.2 NCBI
AGUUUGAAGGCUAAUCUGAAAGAGGAAGAAGAAUCUGUAUAUCUGUAUA… 2783 nt 0.3618
NM_001282188.2 NCBI
AGUUUGAAGGCUAAUCUGAAAGAGGAAGAAGAAUCUGUAUAUCUGUAUA… 2760 nt 0.3580
NM_006639.4 NCBI
AGUUUGAAGGCUAAUCUGAAAGAGGAAGAAGAAUCUGUAUAUCUGUAUA… 2700 nt 0.3581
Summary

This gene encodes a member of the G-protein coupled receptor 1 family. The encoded protein is a receptor for cysteinyl leukotrienes, and is involved in mediating bronchoconstriction via activation of a phosphatidylinositol-calcium second messenger system. Activation of the encoded receptor results in contraction and proliferation of bronchial smooth muscle cells, eosinophil migration, and damage to the mucus layer in the lung. Upregulation of this gene is associated with asthma and dysregulation may also be implicated in cancer. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2013]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the mRNA for the CYSLTR1 was significantly upregulated in salivary extracellular vesicles from patients with chronic concussion compared to healthy controls and was also higher in these patients than in those with acute traumatic brain injury [Cheng et al. DOI:10.4103/1673-5374.266924].