Basic Information

Symbol
ADRA1A
RNA class
mRNA
Alias
Adrenoceptor Alpha 1A ADRA1L1 ADRA1C Alpha-1A Adrenergic Receptor Alpha-1C Adrenergic Receptor Alpha-1A Adrenoreceptor Alpha-1A Adrenoceptor Adrenergic, Alpha-1A-, Receptor Alpha-Adrenergic Receptor 1c G Protein Coupled Receptor ALPHA1AAR
Location (GRCh38)
8:26748150-26867278
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000680.4
Sequence length
3770.0 nt
GC content
0.5257

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1324.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1393.40 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 984.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000680.4 NCBI
GAGUUACGUCAGCGAGAGCUGCAAAGUUCCUUGCUAUUCUUUUCUGGUG… 3770 nt 0.5257
NM_001322503.1 NCBI
GUGGACGCGGUCAAACGAUGCCCCGCAGCCUCCUGGGUCUCAGCACAUA… 2168 nt 0.5941
NM_001322504.1 NCBI
GUGGACGCGGUCAAACGAUGCCCCGCAGCCUCCUGGGUCUCAGCACAUA… 1947 nt 0.5840
NM_033302.3 NCBI
GUGGACGCGGUCAAACGAUGCCCCGCAGCCUCCUGGGUCUCAGCACAUA… 4920 nt 0.4744
NM_033303.4 NCBI
GUGGACGCGGUCAAACGAUGCCCCGCAGCCUCCUGGGUCUCAGCACAUA… 2554 nt 0.5803
NM_033304.3 NCBI
GUGGACGCGGUCAAACGAUGCCCCGCAGCCUCCUGGGUCUCAGCACAUA… 2251 nt 0.5780
Summary

Alpha-1-adrenergic receptors (alpha-1-ARs) are members of the G protein-coupled receptor superfamily. They activate mitogenic responses and regulate growth and proliferation of many cells. There are 3 alpha-1-AR subtypes: alpha-1A, -1B and -1D, all of which signal through the Gq/11 family of G-proteins and different subtypes show different patterns of activation. This gene encodes alpha-1A-adrenergic receptor. Alternative splicing of this gene generates four transcript variants, which encode four different isoforms with distinct C-termini but having similar ligand binding properties. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans analyzing peripheral blood mononuclear cells from coronary artery disease (CAD) patients identified ADRA1A as a top hub gene within a protein-protein interaction network, indicating its central role in CAD pathogenesis [He et al. DOI:10.1155/2021/6658115]. This research, which constructed a competitive endogenous RNA regulatory network, positions ADRA1A as a potential peripheral blood biomarker for the condition, offering novel insights for forensic pathology identification of sudden cardiac death.