Basic Information

Symbol
DBN1
RNA class
mRNA
Alias
Drebrin 1 D0S117E Developmentally-Regulated Brain Protein Drebrin Drebrin E2 Drebrin A Drebrin E
Location (GRCh38)
5:177456607-177474401
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation Sudden unexpected death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001363541.2
Sequence length
3024.0 nt
GC content
0.6091

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1244.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1298.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 780.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001363541.2 NCBI
GCGACGCUGCAGAGGCUCCGAGGCGGCGGCGGCGACUCCCUCUUUCCCU… 3024 nt 0.6091
NM_001364151.2 NCBI
GCGACGCUGCAGAGGCUCCGAGGCGGCGGCGGCGACUCCCUCUUUCCCU… 3021 nt 0.6094
NM_001364152.2 NCBI
CUCUUGUUCAGAGGUCCUUCCCCAGGAAGCAGUGGCCACGCUGCAGCUG… 2197 nt 0.6036
NM_001393630.1 NCBI
GUUUGCUGCCACAUGGCGACCGCGAAGUGACUCCCUUACCGCCGCGGGU… 3169 nt 0.6049
NM_001393631.1 NCBI
GUUUGCUGCCACAUGGCGACCGCGAAGUGACUCCCUUACCGCCGCGGGU… 2890 nt 0.6024
NM_004395.4 NCBI
GCGACGCUGCAGAGGCUCCGAGGCGGCGGCGGCGACUCCCUCUUUCCCU… 2886 nt 0.6098
NM_080881.3 NCBI
GUUUGCUGCCACAUGGCGACCGCGAAGUGACUCCCUUACCGCCGCGGGU… 3031 nt 0.6054
Summary

The protein encoded by this gene is a cytoplasmic actin-binding protein thought to play a role in the process of neuronal growth. It is a member of the drebrin family of proteins that are developmentally regulated in the brain. A decrease in the amount of this protein in the brain has been implicated as a possible contributing factor in the pathogenesis of memory disturbance in Alzheimer's disease. At least two alternative splice variants encoding different protein isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A systematic review of postmortem human brain studies found that the DBN1 mRNA transcript was increased in the anterior cingulate cortex of individuals who died by suicide compared to controls, indicating a specific alteration in oligodendrocyte-related gene expression associated with suicidal behavior [Yamamoto et al. DOI:10.3390/Ijms25115750].