Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001364152.2

Sequence Length

2197 nt

GC Content

0.6036

CUCUUGUUCAGAGGUCCUUCCCCAGGAAGCAGUGGCCACGCUGCAGCUGGAAACCAGAGGGCCUGGCCCCCGGGUGGGGAGCAGGCAUUUGGGAGGGAGGCCAGUCUCCCAUGCUGAGGCUUGGAGGUGGGAACGGGUGUGCCUGUUCUGGGAACUGACUGCGUCGUGCUGAGGACUUGAUGUCUACAUCUCACAGGUGACCAUCGGGAUGAGGAGGAAGAGACCCACAUGAAGAAGUCAGAGUCGGAGGUGGAGGAGGCAGCAGCUAUUAUUGCCCAGCGGCCUGACAACCCAAGGGAGUUCUUCAAGCAGCAGGAAAGAGUCGCAUCGGCCUCUGCGGGCAGCUGUGAUGUACCCUCGCCCUUCAACCAUCGACCAGGCAGCCACCUGGACAGCCACCGGAGGAUGGCGCCCACUCCCAUCCCCACGCGGAGCCCGUCUGACUCCAGCACCGCCUCCACCCCUGUCGCUGAGCAGAUAGAGCGGGCCCUGGAUGAGGUCACCUCCUCGCAGCCUCCACCACUGCCACCGCCACCCCCACCAGCCCAAGAGACCCAGGAGCCCAGCCCCAUCCUAGACAGUGAGGAGACCAGAGCAGCAGCCCCUCAGGCCUGGGCCGGCCCCAUGGAGGAGCCCCCUCAGGCACAGGCGCCUCCCCGGGGGCCAGGCAGCCCUGCAGAGGACUUGAUGUUCAUGGAGUCUGCAGAGCAGGCUGUCCUGGCUGCUCCCGUGGAGCCUGCCACAGCUGACGCCACGGAGAUCCACGAUGCAGCUGACACCAUUGAAACUGACACUGCCACUGCUGACACCACUGUUGCCAACAACGUACCCCCCGCCGCCACCAGCCUCAUUGACCUAUGGCCUGGCAACGGGGAAGGGGCCUCCACACUCCAGGGUGAGCCCAGGGCCCCCACGCCACCCUCGGGUACUGAGGUCACCCUGGCAGAGGUGCCCCUGCUGGAUGAGGUGGCUCCGGAGCCACUGCUGCCAGCAGGCGAAGGCUGUGCCACCCUUCUCAACUUUGAUGAGCUGCCUGAGCCGCCAGCCACCUUCUGUGACCCAGAGGAAGUGGAAGGGGAGUCCCUGGCUGCCCCCCAGACCCCAACUCUGCCCUCAGCCCUUGAGGAGCUGGAGCAAGAGCAGGAGCCGGAGCCCCACCUGCUAACCAAUGGCGAGACCACCCAGAAGGAGGGGACCCAGGCCAGUGAGGGGUACUUCAGUCAAUCACAGGAGGAGGAGUUUGCCCAAUCGGAAGAGCUCUGUGCCAAGGCUCCGCCUCCUGUGUUCUACAACAAGCCUCCAGAGAUCGACAUCACAUGCUGGGAUGCAGACCCAGUUCCAGAAGAGGAGGAGGGCUUCGAGGGUGGUGAUUAGCGGUGGCGCCAGCCCUAGGCUACCCUUGCCAAGGCCGCCCACCUGCAUCAGCCUCUGGCCAGACGGCCCGCCGUGCCUGCAUUCGCAGCAGCUCCGCCUGGCACCCACUCCGGAUUCCGGCCCUGGCUGGGGACUUGGCCGCUUCCCUACCCACAGGGCCUGACUUUUACAGCUUUUCUCUUUUUUUAAAAAGUUGAUAGGAGACUUGUACAGUUGACUGGCUUUCCUCUCGUUGGUAGUUGAGACGCUGUUGCAAAUUCCACCCCUCCUUCCCUGGUCCAGAUUGUAGCUCUUAGUCCUCCCUGCUCAGCUGGCCGGGUUGGAGGCCUCACCCUGCUUGGGGCCUGGCGUGGGGGGAGCUCUGGUGGGAAAAUGUCCCCCACCUCUUUUCCUAGUUUUAUGUUUCUUGGGAAAAUAUCACUUUGUAUUCUCUGUCCAGGGCUUCAGAUAUUUUGCACGAAUUUUAAAACAUGGCAAUAAAUGGCUCGUGGGCUCUGGCUCCCUGGGACCCCCUCCCCGCCCUUCUUUUGACCCCUUCCUGUCUGGCCCAAAGGAAGUAGCAGGCCCAGCUGGGGCCCCUCGGCUACCCCCCGUCUCCUGCCGGGCAGGUCCCAGGUUGGAGGCCCUAGGCGCGGUUCAGGUCAGGGCUAUGGAUGGGGCCCAGGGGCUUUGGUGGCCCCUCCCCAACUCCUUCCUCUUUGCUUGGGUUCCUUUUUCACGUUUAGUAACUGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGGAAAGCACAAACUUCUGUAACGGGUCGUGCUCAUGUCUGUUAAUAAAGAAAUCCAGAUCCCUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-904.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -939.78

Frequency: 0.0000

Diversity: 496.40

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....((((((((((..((((...))))((((((....))))))..((((...)))).((((...))))..((((((((....(((.((((((.(((((......)))))...((..(((((((.((((((((((((....)))))))......((((((...(((((.((.((.(((..(.(((.((((((...((...))...)))))).))).)..))).)))))))))...))))))....((.(((((.((((((.((.((.......))((((.((((((....((....)).((((....(((.(((((...((((((...(((.(((((((((..(((((((((.................))))..(((((......))))))))))..))((.((((((.(......))))))))).))))))).)))..))))))..((...)).......))))).)))))))........))))))))))..((((......)))))).)))))).))))).))....))))).)))..))))..))...)))))).)))...))))))))(((((.(((((((((((.((((((.(((((....((((((((((((((((..(((((.(((((....))....))).)))))...)))))).((((((........((((.....)))).(((.(((.((((.((((..((((.((((.(((((...)))))..))))((((((.((...((........)).))))))))..............))))))))..)))).))).)))..))))))..............(((((((.(((((((....(((((...((((((((((((((..((((((........(((((((((.(((((.((((.............)))).))).)))))))))))..((((.(((((.(((((....((((((((.((((((((((((...)))))..(((((.((...)).)))))(((....))))).))).)).))))))))..((((((((((.....))))))..)))).(((((.(((((.(((((.....))).))....((((((.(.((((((....)).))))).)).))))..(((((((((((((.((..((((.....((.(....((((((.((((((((((......((((((((((((....((((((((((((((((((.(((((((...((..((((.....))))))...))))))).))))))))).......(((((.((((....((((((.......((((((.......))))))...(((((((((((((((((..((((.(((((......(((((.((..(((...(((.......)))..))).)))))))..))))).))))..(((((.(((...((..(((.(((....)))))))).))).)))))..((.....))..((.(((((((..((((((..........))))))....))))))).)).......))))))))))))))))).....)))))).)))).)))))...)))))))))....)))))))))))).........((....))........))))))))))(((((.((((.(((.(((..............)))))))))))))))....((((((((.......)))))))))).)))).(((((....((((((.........))))))....))))).((((((...(((...(.((((((((.(((((.((.....)).))))).....)))))))).)..)))...))))))..).)).....))))..)))))))))))))))..)))))))))).((.((.(((((((((..((..........))..)))))))))..)).)).))))).))))).)))))))).))))))))....)))))))))))))..))))))).)))....)))).)))))))))).)))))..((((((((...(((((((.....))))))))))))..))).......)))))).))))...)))))))))))).....((((((((......................))))))))...))))))).)))(((((.((......(((........)))....)))))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....((((((((((,{({,,,,{|}},((((((....))))))..||||...}}}),{|||,}|}}}|{{((((((((,,.{(({.{(((((.((({((,,,,{|||},..,(((.(({,(((.((((((((((((....)))))))..,,..((((((...(((((.((.((.(((..{.(((.((((((...((...))...)))))).))).}..))).)))))))))...))))))..}}((.(((((.((((((.((,({......,))((((.((((((.,..((....)).{{{({{{.{((.(((((...((((((...(((.(((((((((..(((((((((.................))))..(((((......))))))))))..))((.((((((.(......})))))))).))))))).)))..))))))..({...)).......))))).))))}}..,,....,))))))))))..((((......)))))).)))))).))))).)),},.))))).))}.,)))}...)}}})|||||{|||{.{||||||||{{((({((({(({,.,{.{(((((,(({,,.{{{((((((((..((({((.....)).)))..)))))))...(({,,|{({.((((((((((((((((((((,{,{{(({(.({...,)}.}}})))})}}.}}}))))).)))))),.,|)))).)))),,,)}}.((((((.{{,,.,({....}}.,}.}}))))))............}}}}..,})}..}}})}}.}..}}}||||(,,..}}}},....{{{(({{(((,{{{((({....{{{{{..,||{||||{{|||||..((((((.,....,,(((((((((.({(((,(({{....},,,,,...}))).))).)}))))))))).,|{||.{||((,(((((....((((((({.{{|||||||,{,.}})))))}.({{((.{{...)}.})))){{{....,},,),)||,||,|||||||}.,((,{((((((.....))))))..||||.(((((.(((((.(((((.....))).}}....((((((.(,((((((....)).))))).)),,)))..((((((((((((((((..((((.....||||,...((((((.((((((((((...,,.((((((((((((....((((((((((((((((((.(((((((...{,..((((.....)))),}...))))))).))))))))).......(((((.((((....((((((.......((((((.......))))))...(((((((((((((((((..((((.(((((....,,(((((.((..(((,(.(((.......))).}))).))))))).,))))).)))).,(((((.(((...((..(({{(((....)))))))).))).)))))..({.....))..{(.((((((({.((((((...,....,.)))))).,}.})))))).)}.......))))))))))))))))).....)))))).)))).)))))...)))))))))....))))))))))))..,}|.,..((....))........))))))))))(((((.((((.(((.(((..............)))))))))))))))....((((((((.......)))))))))).)))){(((((....((((((.........))))))...,))))).((((((...(((.{{,{((((((((.,,,((.{..{{{{,..,))))...}})))))))).)}.)))...))))))..|||,.....})))..)))))))))))))))..)))))))))).||,{{.(((((((((..{(,.........))..)))))))))..}}.||||||||,|||||,}||||||,.,,}}}}}}....}))))))}})))),,))))))).))),...))))})))}))))}},})))}..||||||||}..,{|||||,,,,,)))))))})))),.})),..}}},})))))))),}}}....,,}}|||,,...,,{(({((({......................))))))}}...))))))).)))(((((.{(...,,.(((........))).,,.)))))))...