Basic Information

Symbol
DCTN1
RNA class
mRNA
Alias
Dynactin Subunit 1 150 KDa Dynein-Associated Polypeptide DAP-150 DP-150 P135 Dynactin 1 (P150, Glued (Drosophila) Homolog) Dynactin 1 (P150, Glued Homolog, Drosophila) P150 Glued Homolog (Drosophila) P150-Glued HMND14
Location (GRCh38)
2:74361154-74392087
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004082.5
Sequence length
4455.0 nt
GC content
0.5737

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1769.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1843.23 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 879.10
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001135040.3 NCBI
AGAGUGAGACUCAUCAGCUGGCAAGCAGGAUUCUGUGUCUCUGGGUUCA… 4380 nt 0.5733
NM_001135041.3 NCBI
ACUGAGGCUGCCAUCAGCCUAAGCUGGUGAACUGGGCCAGGCACCGCUC… 4079 nt 0.5766
NM_001190836.2 NCBI
GCCGGCCCCGCAGGGUCUUGGGCGUCGGUCGUCGGUGGGGUCGGAGCUG… 4146 nt 0.5733
NM_001190837.2 NCBI
AGAGUGAGACUCAUCAGCUGGCAAGCAGGAUUCUGUGUCUCUGGGUUCA… 4434 nt 0.5737
NM_001378991.1 NCBI
GCCGGCCCCGCAGGGUCUUGGGCGUCGGUCGUCGGUGGGGUCGGAGCUG… 4221 nt 0.5738
NM_001378992.1 NCBI
GCCGGCCCCGCAGGGUCUUGGGCGUCGGUCGUCGGUGGGGUCGGAGCUG… 4203 nt 0.5734
NM_004082.5 NCBI
AGAGUGAGACUCAUCAGCUGGCAAGCAGGAUUCUGUGUCUCUGGGUUCA… 4455 nt 0.5737
NM_023019.4 NCBI
ACUGAGGCUGCCAUCAGCCUAAGCUGGUGAACUGGGCCAGGCACCGCUC… 4094 nt 0.5765
Summary

This gene encodes the largest subunit of dynactin, a macromolecular complex consisting of 10 subunits ranging in size from 22 to 150 kD. Dynactin binds to both microtubules and cytoplasmic dynein. Dynactin is involved in a diverse array of cellular functions, including ER-to-Golgi transport, the centripetal movement of lysosomes and endosomes, spindle formation, chromosome movement, nuclear positioning, and axonogenesis. This subunit interacts with dynein intermediate chain by its domains directly binding to dynein and binds to microtubules via a highly conserved glycine-rich cytoskeleton-associated protein (CAP-Gly) domain in its N-terminus. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms. Mutations in this gene cause distal hereditary motor neuronopathy type VIIB (HMN7B) which is also known as distal spinal and bulbar muscular atrophy (dSBMA). [provided by RefSeq, Oct 2008]

Forensic Context

A study in humans identified the DCTN1 as a member of a circadian clock gene co-expression module that was upregulated in subjects with methamphetamine-associated psychosis and enriched with convergent functional genomic evidence for psychosis and schizophrenia [Breen et al. DOI:10.1038/tp.2016.67]. This module demonstrated significant associations with psychoticism and posterior corpus callosum structure, and the DCTN1 itself was noted to overlap with a previous study validating blood biomarkers for delusions.