Basic Information

Symbol
DCTN4
RNA class
mRNA
Alias
Dynactin Subunit 4 Dyn4 P62 Dynactin Subunit P62 Dynactin 4 (P62) Dynactin P62 Subunit
Location (GRCh38)
5:150706840-150759095
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016221.4
Sequence length
4116.0 nt
GC content
0.4145

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1116.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1196.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1004.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...((((.((..(((((...(((((((....))))...)))((((.((((.....)))).)))).)))))...)).))))...)))...((((..((((((((((((....(((((...)))))..((.((((((.(((.((((...(((.((((...((((..........))))...))))..)))..)))).))).)))))).)).....(((........)))....(((((((.(((((((((((.(((((((((((((......(((((..(((((.(((((...((((((..(((((.(((((..((((((((((((((.((.......(((........))))))))).)))))..))))).))))).))((((.((((...(((((....)))))....(((((.(((((.((((....(((((.(((((((.(.....(((.........(((((((.....((((((.(((((((((((...(((((((((.(((((.((....)).((((((...........(((((((...(((((.....)))))...)))))))..(((((.((((((..((((((...((((((((...((.(((..((.((((....((((((.((((....)))).)))).))...))).).))..))).))))))))))..(((((...(((((((..((((((........(((.............))).........))))))..))...))))))))))))).)))..))))))..)))))))))))(((((...))))).......))))))).....)))))))......(((((.........)))))..(((....)))..)))))))))))..((((((...............))))))........)))))).....)))))))...))).....((((..((.(((((((((....((((((.....)))))).......(((((((((...(((((((..((..(..((((...((((....)))).))))..))).)))))))))))))))).((((...))))...(((((((((...)))))))))(((.....))).(((((((.(((((((....)))..)))).))).)))).)))))))))))..))))......((((((...)))))).......(((((....))))).......(((((((.(((.....))).))).)))).).))))))).(((......)))..((((((((...))))))))..)))))....)))).))))).))))).)))))))).......(((((((((..((....))..))))).))))..))).)))))).....))))))))))..((((((.(((((((((..(((((((((((((((..(((.((((((((((((((((....)))).......)))(((((....))))).....((((((((((......(((.(((((...((..(.(((...))).)..))...))))).)))))))))))))...((((((((......(((((((((((((.(((..(((........(((((.((.....)))))))........))).....)))....)))))))))))))......(((((((.......))))))))))))))).((..(((...........))))).(((...))).))))))))).)))...((((((......))))))..((((...((((.....(((.(((((((((....))).(((((((((.........)))))..)))).............(((.....)))..........)))))).)))..))))...))))..........((((.((((((((((......))(((((.((((((......(((...((((((.((......))..)))))).))).......))))))...))))).)))))))).)))).....))))))))))).......)))).....(((((((......).))))))...........(((........))))))))))))))))))..(((((.((((((((..((((((....(((((..(((((((((((((.............................))))))..)))))))..((((((((((.......))))...........((((((((((((((..........((((((....(((.((((..(((((..((.....))..))))))))))))))))))))))))).(((.....(((((((((((...((((((((((.....)))))))))).))))......)))))))......)))...)))))))..................(((((((((((....))))).)))))).....))))))....(((((...)))))..((((.(((((((((((((((((.(((..((((((............(((((((....(((((((((.(.(((.((.(((((((((....)))))).......)))...)).))).))))))))))..........(((((..(((((((......)))....))))..))))).(((((((((((..(((((((((((((.......((((((...((((........((((((((((............(((((...(((((.((((((((.((((((....(((((......(((((((((((((.....((((((......(((((.(((((((((.....(((((((...))))))).)))))))).......(((((..((((((((((....(((......((((((.....)))))).(((...)))..............)))....)))))).......))))..))))).).))))).....))))))))).)))))))))).......)))))....)))))).))))))))((((((((((((.....(((((((.((((((((((((((......)))))))))..........)))))))))))).....((((((((((((((((((((((.((...(((.(.((((((........)))))).)..)))...)).))))).(((((........)))))........((((.(((.........))))))))))).)))))))))).)))))))))))))))(((((.....((((...(((((((..........))))))).....))))......)))))))))))))))..))))))))))..)))).))))))))))))))..((((((..(((((((((......(((......)))........))))))))).))))))....((((....))))...))))).)))))))))))......))))))).(((((.(((((.((((...)))).))))))))))..(((((((((((((..(...((.((......))...)).....)..))))))).))))))....(((((.((...)).))))).))))))..))).)))))...)))))))))).))))))...(((........)))(((((....)))))....((((...((((((.((((...((.(((......((((((((.((((....)))))))))))).....))).))...)))).)))))))))).((((((((..(((((((..........)))))))..))))))))......)))))))))))...))))))))))))).)))))......)).)))).))....)))))...)))........)))))))).)))))))((((.((((.((.((((......)))).))))))))))..((((.((((((.............)))))).))))...........))))))).)))))...))))...(((((((....(((...)))....))))))).((..((((((((.((.((((........))))...((((....(((((.....)))))))))......)).))))))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...((((,((,.(((((...((({(((....,}}}},.}})((((.((((.....)))).)))).)))))...,).))))...)))...((((..((((((((((((..,.(((((,,.|||}|..(,.{{{|{{,{{{.|{({,..(({.((((.,.((((..........))))...)))}..})}..}}}}.)}}.)))))}.}},,...(,,........,}}..,.(((((((.(((((((((((.((((((((((({(......(((((..(((((.(((((...((((((..((({(.(((((..((((((((((((({,((.......(((........)))}))))).)))))..))))).))))).)}|{{{,((((...(((((....})))).}},{((((.(((((.((((....{{{{,.(((((((.{.....(((.........(((((((.....((((((.(((((((((((...(((((((((.(((((.{{,...||.{(((((........,..(((((((...(((((.....}))))...))))))),,(((((.((((((..((((((...((((((((.,,,,.{((..{{,,(({.,..{{{((({({({....}})),)))}.}}.}.})).).}}..)))}),))))))))..(((((...(((((((..((((((...{({{.{{(.,,..........)))...}}},..))))))..))...))))))))))))).)))..))))))..)))))))))))|{({(...)}))).,,.,,,)))))}}.....}))))))|,|,..{((({,.....,..)))))..,{{....,,,..)))))))))))..((((((...............))))))........)))))).....))))))),..))).{,,,((((..((.(((((((((....((((({.....}))))).....{{(((((((((...(((((((..{{..(..((((...((((....)))).))))..)}}.)))))))))))))))),||.,....,},...(((((((({...))))))))){((.....}}}.(((({{{.(((((((....}))..)))).})}.})}}.)))))))))))..))))...}}.((((((...)))))).......(((((....))))).......(((((((,(({....,))).))).)))).}.))))))}.(((......))).{((((((({...}))))))),.}}}},....)))).))))).))))}.))))}}}}.......(((((((({,.{{....))}.))))).))))..))).)))))).....))))))))))..{(((({{(((((((({{((({{(((((((((((,.{{(.((((((((({{,((((....)))).......}}}(((((....))))).....((((((((({.....,(((.(((((...((..(.(({...})).)..})...))))).)))))))))))))...((((((((......(((((((((((((.(((..(((.....,..(((({,((.....)))))))........))).....)))....)))))))))))))......(((((((.......))))))))))))))),((,,(({.....,,,,,.))),,.(((...})).))))))))},))),,,|(((((......)))))|{{{(,{{{{((,,,,...,,,.,{{{..,,,...,|||,{,|,,(((((({{(({{..|{({(((||,.},,})},,,,,.{((.....))}....,,.....))))).)))))))...............|,,,,{{{...{{|||,,{,.....)}|||{{.((((((.....,(((...((((((.,,......,,..)))))).))).,.,,..))))))...))))),.))))}...|}}}.....}}}))))))}}..,,,..,},)},...(((((((......)||))))},.|,,{,,,,.{||........})))))))))))))))))..{((({{((((((({..{((({{|,,|{{((({{(((((((((((((....,,.......,,,,...,,,,},...))))))..))))))).,((((((((((.......))))},.........|||||{|{||||{{.,,.,.....((((((....|{|,{(|{.|(((((..((.....))..))))))}),}))))))))))))))).,,,,{{{{(,,,,,|||||,..{{{{{((({(,,,,.}}}}}|||}}.,}})..,|}|))|||},......}}}..,)}}||||,,,...............(((((((((((....))))).))))))..,,,))))}),...{{{{{...|||,,..|||{.((((((((((((((((,.(((..((((({....,,,|,,..,,{{{,{,{{,(((((((((.,.{(({((,{.(((((((....))))))}......,}},..|},|}}||}}|}}}}}}..,,,,{{{|{((({..{{{((((......)))|,,,,}}},,))}},.(((((((((((..(((((((((((.....{{{{((((,(...,((({{{(,({{..(((({(({.,.....,})))}))}.}))))))),((((((((.((((((....(((((..,,..(((((((((((({....{((((((......(((((.{((((((((.....(((((({...}))))))})))))))).......{((({..{{{{((((((....(((......((((((.....)))))).(((...)))..............)))....)))))).......}}}}..}}})}.,.)))))..,,.)))))))))}})))))))))..,,...)))))....)))))).))))))))((((((((((((...,.(((((((.(((((...((((({......})))}||(((....)))}.)))))))))))).....,(((((((((((({((({{{{{{((...,||,{.((((((........)))))).}..|||,{,||,|||}}.,,,..,,,,..,})})}}........((((.(((.........))))))))))}.)))))))))).))}))))))))))))..}.}}}}}}||||...(((((((..........)))))))}}}}}))))}.......,{{((,,,,...,,,,,......}))}),,,.||,|||,||||((({{{(((({.,((((({{{{.{.,..{{{...,..)))..,,}}},}}}))))}),))))))..}}}|}}.,..}})},,}}},,,.)))))))))))..,}}})}}}}},.{((({|{((({.(({{...}))).})))}))))}..,,,,||{{{||||.,}}}}}}}||....,,)),..}}||,,....}}}}))}}}}},||,,..(((((.{{...},.))))).))))))..))).|}}}},..,))))))))).}}}}}},..|||,,,.||||},,{{(((....}))}}..}}|}},.,,{((({{.((({...((.(((....,.(((((((,{((((....))))))))))))...,,))).))...)))).,))}}|||||.((((((((..(((((((..........)))))))..))))))))....,})))),}))))}..,})))))))))))}.)))))......)).))))},}....)))))...)))}.......}))))))).)))))))((((.(((,{((.((((......)))).))))))))))..{(((.((((((........,,,..}))))).))))...........))))))).)))))...))))...(((((((....{((...)))....))))))).,(..((((((((.((.((((........)))),,.,{{{....(((((.....))))),}},......)).))))))))..),

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001135643.2 NCBI
GUCAUCGCCUCCUCCCUCCCCAAGAUGGCGUCCUUGCUGCAGUCGGACC… 4137 nt 0.4141
NM_001135644.2 NCBI
GAUUUAUUGCGAGGAUGGAGGGAGGCGCAGGCGUUCUCAUUCAUAGUUC… 4349 nt 0.4146
NM_016221.4 NCBI
GUCAUCGCCUCCUCCCUCCCCAAGAUGGCGUCCUUGCUGCAGUCGGACC… 4116 nt 0.4145
Summary

Located in centrosome. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that Dynactin 4 (Dctn4) gene expression was commonly up-regulated in liver tissue following Kupffer cell-specific and endothelial cell-specific exposures to α-particles, as part of a broader inflammatory response characterized by altered gene expression profiles [Roudkenar et al. DOI:10.1269/jrr.07078].