Basic Information
Symbol
DEF8
RNA class
mRNA
Alias
Differentially Expressed In FDCP 8 Homolog
FLJ20186
DEF-8
Differentially Expressed In FDCP 8 Homolog (Mouse)
Location (GRCh38)
16:89948127-89968066
Forensic tag(s)
-
MANE select
Transcript ID
NM_001242818.2
Sequence length
3620.0 nt
GC content
0.6000
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1572.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-1635.93 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1020.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GUAGCGGGGCGGCCGGGCGGAUCCAGCGCAGCCGGGAGACAGAUGCGAG… | 3590 nt | 0.5997 | |
| GUAGCGGGGCGGCCGGGCGGAUCCAGCGCAGCCGGGAGACAGAUGCGAG… | 3486 nt | 0.5995 | |
| GUAGCGGGGCGGCCGGGCGGAUCCAGCGCAGCCGGGAGACAGAUGCGAG… | 3620 nt | 0.6000 | |
| GUGCCGAACCCACGGCCAGGCUUCCGUGGCCAGCAGCCCUAGAGGAAUG… | 3524 nt | 0.5951 | |
| GUAGCGGGGCGGCCGGGCGGAUCCAGCGCAGCCGGGAGACAGAUGCGAG… | 3860 nt | 0.5979 | |
| GUAGCGGGGCGGCCGGGCGGAUCCAGCGCAGCCGGGAGACAGAUGCGAG… | 795 nt | 0.5811 | |
| GUAGCGGGGCGGCCGGGCGGAUCCAGCGCAGCCGGGAGACAGAUGCGAG… | 889 nt | 0.5939 | |
| GUAGCGGGGCGGCCGGGCGGAUCCAGCGCAGCCGGGAGACAGAUGCGAG… | 892 nt | 0.5942 | |
| GUAGCGGGGCGGCCGGGCGGAUCCAGCGCAGCCGGGAGACAGAUGCGAG… | 3745 nt | 0.6021 |
Summary
Predicted to enable zinc ion binding activity. Predicted to be involved in lysosome localization; positive regulation of bone resorption; and positive regulation of ruffle assembly. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]
Forensic Context
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