Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001242821.2
Sequence Length
795 nt
GC Content
0.5811
GUAGCGGGGCGGCCGGGCGGAUCCAGCGCAGCCGGGAGACAGAUGCGAGGCGGCGGUCAGGUGGGAUGCUAUGGAAUAUGAUGAGAAGCUGGCCCGUUUCCGGCAGGCCCACCUCAACCCCUUCAACAAGCAGUCUGGGCCGAGACAGCAUGAGCAGGGCCCUGGGGAGGAGGUCCCGGACGUCACUCCUGAAGAGGCCCUGCCUGAGCUGCCCCCUGGGGAGCCGGAAUUCCGCUGCCCUGAACGCGUGAUGGAUCUCGGCCUGUCUGAGGACCACUUCUCCCGCCCUGUGGGUCUGUUCCUGGCCUCUGACGUCCAGCAGCUGCGGCAGGCGAUCGAGGAGUGCAAGCAGGUGAUUCUGGAGCUGCCCGAGCAGUCGGAGAAGCAGAAGGAUGCCGUGGUGCGACUCAUCCACCUCCGGCUGAAGCUCCAGGAGCUGAAGGACCCCAAUGAGGAUGAGCCAAACAUCCGAGUGCUCCUUGAGCACCGCUUUUACAAGGAGAAGAGCAAGAGCGUCAAGCAGACCUGUGACAAGUGUAACACCAUCAUCUGGGGGCUCAUUCAGACCUGGUACACCUGCACAGGUGGGCCGAGACCCAGACGAGGAGUGAGGAAUGAGAGAGACCAAAGUUCCUGCCUCCGCUGGGCUCACAUUCAGAUGUGAGCUAUCCAGUGUGGUGGCCACUAGCCAAACAUGGCCAGUCAAAGUUAAAUUAACUAAAUAUGCAUUUCCUCGUUGUACUGUCUACAUUGGACAGGGCUGUUCUGGAUGAGAAAUUAAACUAGUGAAUUACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-321.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -333.54
Frequency: 0.0000
Diversity: 179.62
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((((((((((((...(((.((((((((((..((.(((((.((((((((..(((((((.((((..((((.(((..............)))))))))))..)))))))............((.((.((((......)))).)).)).((((((((((.(((((((.(((...))).)).)))))..)).))))))))(((.(((.(((...))).))))))....)))))))).....)))))..))..)))))).)))))))((((....)))).))))))..(((((((.....((((((.((((((.(..((.((((.(((..(.......)..)))..)))).)).((((((((((.......(((((((((..(((......))).((((((.....)).))))))))))))).))))))))))(((.(((((...((....(((((.......)))))...)).))))).)))...((((((........))))))..).)))))).....(((((((.((.((((...((((...((((((......))))))..)))))))).))))))))))))))))))))))(((((((((((((((((.............))))))(((((((((((((((((((....))))))))...)))))).)).))).(((.((((....)))).)))...(((((...))))).......)).)))))))))...(((((((...)))))))))))))))))...........................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,..((((((((((((((((.,,(((.((((((((((..((.(((((,((((((((..(((((((.((((..((((.,,(.{.,{...}}....})}))))))))..)))))))............{{.((.((((......)))).)).}}.((((((((((.(((((((.(((...))).)).))))).,}).))))))))(((.(((.(((...))).))))))....)))))))).,...)))))..))..))))))}})))))|{|||...,})}}.)))))),,|((((((.....((((((,((,((({(.{((,(({(.(((.,(...,.,{|,.|||..}}}},)}.{(((((((({.,.....{((((((((..{{{...,,.}|},({(({{.,...,,,))))))))))))}.})))))))))(((.(((((.,.{,,,..(((((.......)))))..|)|.))))).)))...((((((.,......))))))..,.||}}},.},..(((((((.((.((((...((((...((((((......})))))..)))))))).)))))))))}})))}}}})))}((((((((({{((((((..,......}...))))))(((|{((((((((((((((....))))))))...)))))).)).))).(((.((((....)))).)))...(((((...))))).......))}}))))))))...(((((((...))))))))))))))))),,|,...................,,,.
Back