Basic Information

Symbol
DENND1A
RNA class
mRNA
Alias
DENN Domain Containing 1A KIAA1608 FAM31A Connecdenn 1 DENN Domain-Containing Protein 1A DENN/MADD Domain Containing 1A FLJ21129 Protein FAM31A Connecdenn
Location (GRCh38)
9:123379648-123930152
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001352964.2
Sequence length
5208.0 nt
GC content
0.5901

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2053.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2145.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1301.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001352964.2 NCBI
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NM_001352965.2 NCBI
ACGCGCGCCGGCGACCAUGGCGUUCGCCGGGCUGGAGCGAGUACAUUAA… 5039 nt 0.5908
NM_001352966.2 NCBI
ACGCGCGCCGGCGACCAUGGCGUUCGCCGGGCUGGAGCGAGUACAUUAA… 3571 nt 0.5113
NM_001352967.2 NCBI
ACGCGCGCCGGCGACCAUGGCGUUCGCCGGGCUGGAGCGAGUACAUUAA… 3565 nt 0.5133
NM_001352968.2 NCBI
ACGCGCGCCGGCGACCAUGGCGUUCGCCGGGCUGGAGCGAGUACAUUAA… 2977 nt 0.5354
NM_001393654.1 NCBI
ACGCGCGCCGGCGACCAUGGCGUUCGCCGGGCUGGAGCGAGUACAUUAA… 5154 nt 0.5891
NM_001400446.1 NCBI
ACGCGCGCCGGCGACCAUGGCGUUCGCCGGGCUGGAGCGAGUACAUUAA… 3568 nt 0.5112
NM_001400449.1 NCBI
ACGCGCGCCGGCGACCAUGGCGUUCGCCGGGCUGGAGCGAGUACAUUAA… 5104 nt 0.5907
NM_020946.2 NCBI
ACGCGCGCCGGCGACCAUGGCGUUCGCCGGGCUGGAGCGAGUACAUUAA… 5025 nt 0.5899
NM_024820.3 NCBI
ACGCGCGCCGGCGACCAUGGCGUUCGCCGGGCUGGAGCGAGUACAUUAA… 3615 nt 0.5120
Summary

Clathrin (see MIM 118955)-mediated endocytosis is a major mechanism for internalization of proteins and lipids. Members of the connecdenn family, such as DENND1A, function as guanine nucleotide exchange factors (GEFs) for the early endosomal small GTPase RAB35 (MIM 604199) and bind to clathrin and clathrin adaptor protein-2 (AP2; see MIM 601024). Thus, connecdenns link RAB35 activation with the clathrin machinery (Marat and McPherson, 2010 [PubMed 20154091]).[supplied by OMIM, Nov 2010]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.