Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_020946.2
Sequence Length
5025 nt
GC Content
0.5899
ACGCGCGCCGGCGACCAUGGCGUUCGCCGGGCUGGAGCGAGUACAUUAACCCCUGGAGGCGGCGGCGGCGGCGAGGGAGCGAGCCUCGAGCGGGCGGGCCCCAGCCUGAGGGAAGGGAGGAAGGGGCGGGGAGAGCGCCAGAGGGAGGCCGGUCGGCCGCGGGCGGGCGGGCAGCGCAGCGCCGAGCGGGGCCCGCGGGCCCAUGAGGAGGCCUGGGGACCAUGGGCUCCAGGAUCAAGCAGAAUCCAGAGACCACAUUUGAAGUAUAUGUUGAAGUGGCCUAUCCCAGGACAGGUGGCACUCUUUCAGAUCCUGAGGUGCAGAGGCAAUUCCCGGAGGACUACAGUGACCAGGAAGUUCUACAGACUUUGACCAAGUUUUGUUUCCCCUUCUAUGUGGACAGCCUCACAGUUAGCCAAGUUGGCCAGAACUUCACAUUCGUGCUCACUGACAUUGACAGCAAACAGAGAUUCGGGUUCUGCCGCUUAUCUUCAGGAGCGAAGAGCUGCUUCUGUAUCUUAAGCUAUCUCCCCUGGUUCGAGGUAUUUUAUAAGCUGCUUAACAUCCUGGCAGAUUACACGACAAAAAGACAGGAAAAUCAGUGGAAUGAGCUUCUUGAAACUCUGCACAAACUUCCCAUCCCUGACCCAGGAGUGUCUGUCCAUCUCAGCGUGCAUUCUUAUUUUACUGUGCCUGAUACCAGAGAACUUCCCAGCAUACCUGAGAAUAGAAAUCUGACAGAAUAUUUUGUGGCUGUGGAUGUUAACAACAUGUUGCAUCUGUACGCCAGUAUGCUGUACGAACGCCGGAUACUCAUCAUUUGCAGCAAACUCAGCACUCUGACUGCCUGCAUCCACGGGUCUGCGGCGAUGCUCUACCCCAUGUACUGGCAGCACGUGUACAUCCCCGUGCUGCCGCCGCAUCUGCUGGACUACUGCUGUGCUCCCAUGCCCUACCUCAUAGGAAUCCAUUUAAGUUUAAUGGAGAAAGUCAGAAACAUGGCCCUGGAUGAUGUCGUGAUCCUGAAUGUGGACACCAACACCCUGGAAACCCCCUUCGAUGACCUCCAGAGCCUCCCAAACGACGUGAUCUCUUCCCUGAAGAACAGGCUGAAAAAGGUCUCCACAACCACUGGGGAUGGUGUGGCCAGAGCGUUCCUCAAGGCCCAGGCUGCUUUCUUCGGUAGCUACCGAAACGCUCUGAAAAUCGAGCCGGAGGAGCCGAUCACUUUCUGUGAGGAAGCCUUCGUGUCCCACUACCGCUCCGGAGCCAUGAGGCAGUUCCUGCAGAACGCCACACAGCUGCAGCUCUUCAAGCAGUUUAUUGAUGGUCGAUUAGAUCUUCUCAAUUCCGGCGAAGGUUUCAGUGAUGUUUUUGAAGAGGAAAUCAACAUGGGCGAGUACGCUGGCAGUGACAAACUGUACCAUCAGUGGCUCUCCACUGUCCGGAAAGGAAGUGGAGCAAUUCUGAAUACUGUAAAGACCAAAGCAAAUCCGGCCAUGAAGACUGUCUACAAGUUCGCAAAAGAUCAUGCAAAAAUGGGAAUAAAAGAGGUGAAAAACCGCUUGAAGCAAAAGGACAUUGCCGAGAAUGGCUGCGCCCCCACCCCAGAAGAGCAGCUGCCAAAGACUGCACCGUCCCCACUGGUGGAGGCCAAGGACCCCAAGCUCCGAGAAGACCGGCGGCCAAUCACAGUCCACUUUGGACAGGUGCGCCCACCUCGUCCACAUGUUGUUAAGAGACCAAAGAGCAACAUCGCAGUGGAAGGCCGGAGGACGUCUGUGCCGAGCCCUGAGCAGCCGCAGCCGUAUCGGACACUCAGGGAGUCAGACAGCGCGGAAGGCGACGAGGCAGAGAGUCCAGAGCAGCAAGUGCGGAAGUCCACAGGCCCUGUCCCAGCUCCCCCUGACCGGGCUGCCAGCAUCGACCUUCUGGAAGACGUCUUCAGCAACCUGGACAUGGAGGCCGCACUGCAGCCACUGGGCCAGGCCAAGAGCUUAGAGGACCUUCGUGCCCCCAAAGACCUGAGGGAGCAGCCAGGGACCUUUGACUAUCAGAGGCUGGAUCUGGGCGGGAGUGAGAGGAGCCGCGGGGUGACAGUGGCCUUGAAGCUUACCCACCCGUACAACAAGCUCUGGAGCCUGGGCCAGGACGACAUGGCCAUCCCCAGCAAGCCCCCAGCUGCCUCCCCUGAGAAGCCCUCAGCCCUGCUCGGAAACUCCCUGGCCCUGCCUCGAAGGCCCCAGAACCGGGACAGCAUCCUGAACCCCAGUGACAAGGAGGAGGUGCCCACCCCUACUCUGGGCAGCAUCACCAUCCCCCGGCCCCAAGGCAGGAAGACCCCAGAGCUGGGCAUCGUGCCUCCACCGCCCAUUCCCCGCCCGGCCAAGCUCCAGGCUGCCGGCGCCGCACUUGGUGACGUCUCAGAGCGGCUGCAGACGGAUCGGGACAGGCGAGCUGCCCUGAGUCCAGGGCUCCUGCCUGGUGUUGUCCCCCAAGGCCCCACUGAACUGCUCCAGCCGCUCAGCCCUGGCCCCGGGGCUGCAGGCACGAGCAGUGACGCCCUGCUCGCCCUCCUGGACCCGCUCAGCACAGCCUGGUCAGGCAGCACCCUCCCGUCACGCCCCGCCACCCCGAAUGUAGCCACCCCAUUCACCCCCCAAUUCAGCUUCCCCCCUGCAGGGACACCCACCCCAUUCCCACAGCCACCACUCAACCCCUUUGUCCCAUCCAUGCCAGCAGCCCCACCCACCCUGCCCCUGGUCUCCACACCAGCCGGGCCUUUCGGGGCCCCUCCAGCUUCCCUGGGGCCGGCUUUUGCGUCCGGCCUCCUGCUGUCCAGUGCUGGCUUCUGUGCCCCUCACAGGUCUCAGCCCAACCUCUCCGCCCUCUCCAUGCCCAACCUCUUUGGCCAGAUGCCCAUGGGCACCCACACGAGCCCCCUACAGCCGCUGGGUCCCCCAGCAGUUGCCCCGUCGAGGAUCCGAACGUUGCCCCUGGCCCGCUCAAGUGCCAGGGCUGCUGAGACCAAGCAGGGGCUGGCCCUGAGGCCUGGAGACCCCCCGCUUCUGCCUCCCAGGCCCCCUCAAGGCCUGGAGCCAACACUGCAGCCCUCUGCUCCUCAACAGGCCAGAGACCCCUUUGAGGAUUUGUUACAGAAAACCAAGCAAGACGUGAGCCCGAGUCCGGCCCUGGCCCCGGCCCCAGACUCGGUGGAGCAGCUCAGGAAGCAGUGGGAGACCUUCGAGUGAGCCGGGCCCUGAGGGUGGGGGAUGCACCGAGGCCCGAGGGUCCGUCCACUGCUGCGGUUCCGAGGCUCCCCCGCCACUCUCUCUCUGCCCAGGUUCUGCUGGUGGGAAGGGAUGGGACCCCUCUCUGCUGCCCCCUCCUCCCCUCCACACUGCCCAUCUCUGAUGUCUGGCCCUGGGGAAUGGCACCAGUUCCAGCCUGGGAAUCAACCCAGUUCCUGAGUGCCCAUCCCACCCCGCGGUUGCCUCUCCUCGGCACCCUUGAUUGGGUUUUGCACUAAAGAGGUCAGCUGGGCCAAUGAUAUUGCUCCAGACCGAGUCCUACCCACCUUCCCCCGGAAGUGUCCCAAGAGGCUCCGAAGGCCUCCCCUCCGAGCCCAGCUCUCCUGUCUCCUCCACAGCCAGGCCCUGCACGCCCACCUCCUCGGACACAGGUGACAGGGUUACCCUCCAGUUUGAGCUCAUCUGCACGAGACACAGGUAGCUUGGGGUUGAAGUUAGGACUCCUCCUGGGCUGGAGGAUUUACCUGGUGGGGCACUUCCAGACUGUUUCUAGCAAUAUACACACACGUUCUUUCCUGUGUCUUCACCCCAAAACUUCAGUUGAUUCUGACCUGGGAGGAUCUGGGGACCAGGGGGUCUUGGGCUGCCUUGUGAUACACAGCCCCAGCCACCCUGCACGGGGGCUGCGAGCACCAGCAACUUUGAUUUAUAGAAGGAAAAUGGAAACCCCCAUCUGAGUAUUUUGGGAGGAGCCCCCAGCCCUCAUCCAGCUCUGGCACGCUGAUACCUCCAGGUACUCCCCUCACUGUCAAAGCUGGGGCUCAGCCUCUUGUCAUCUGGAGCUUUGUGGGCAAAGCUGAGAAGCUGCAACCCAGAUUUCAACCCAAAAAGGUCAAGCUGAAUGCCUCAGACUGAUGUGGAAGGCAGCUGGCCUUCCUGGGUUGGAACGAGGCAGUGGCCCUGAGCCCCUUCUCCAGGGCCAGGUAGAAAGGACAAACUUGGUCUCUGCCUCGGGGAAGCAGGAGGAGGGCUAGAAGCCAGUCCCUCCCCACCUGCCCAGAGCUCCAGGCCAGCACAGAAAUUCCUGAGGCCAACGUCACCAAAGUUAGAUUGAAUGUUUAUUAUCUUUCUUUUUCCUUUUUACCUUAUUGAUUUGAUGAAUCUUGAAAUGGAUUCAUUUCCAUAAACCAAGUUAAAGUAUGGCCCGACCAUUUAAGAAAACAACCAUCUGAGACACGCAGGAAAUUGUGAGCAUUUCGACCCGAGCUCUCAUUUCCUAUUUGUGAAGGGUCAGACACAGUCUACCCAGGGGUGUCUGGGGGACAAGGGGGUCUCUGGAGAUGUCACCCAGGGAGCCCCCUCUAUGUCUGAGAGGCUGCCACUGCUGCACAUGCUCAGUGAGGCUUGGCGGCCAUCCUGGCACAUGGCUCUUCCUGGGUCAACCGUGACCUGUCUGGCUCAGGAAUGGGCUCUGGCUGCUGGGGGAGCCGUGUCACUCCUGGGCCAUGGGGGCACCUCCUGGGCACUUAGGUGUUUCAGCAUAGAUUCCAGUUUCGCACCCUGGGCAGACCCCCAGGCCCCAUCCGGGAUAGGGCAGAGGAGGUGCUGGCGGCCCCAGGGAAGGAGGGUGUGUACCCCAAGGCCCCCUGGCUGUGCUGAGGGGCUGGGGUGAGCGCUCCAUGUUCACAUGAGCACUGCUGCCUCUUCACUUGUGGGACUUUUUGCAAACCCAAGGAUGAACUUUGUGUGCAUUCAAUAAAAUCAUCUUGGGGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1989.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2079.19
Frequency: 0.0000
Diversity: 1249.11
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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