Basic Information

Symbol
DLK1
RNA class
mRNA
Alias
Delta Like Non-Canonical Notch Ligand 1 PG2 Pref-1 Delta1 FA1 ZOG Protein Delta Homolog 1 DLK-1 DLK Delta-Like 1 Homolog (Drosophila) Delta-Like Homolog (Drosophila) Preadipocyte Factor 1 Delta-Like 1 Homolog Fetal Antigen 1 Secredeltin PREF1
Location (GRCh38)
14:100725705-100738224
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003836.7
Sequence length
4657.0 nt
GC content
0.5514

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1461.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1544.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1072.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001317172.2 NCBI
GGCAGCUCCCCGGCAGCGGCGGUGGAGAGCGCAGCGCGCAGCCCGGUGC… 4438 nt 0.5473
NM_003836.7 NCBI
GGCAGCUCCCCGGCAGCGGCGGUGGAGAGCGCAGCGCGCAGCCCGGUGC… 4657 nt 0.5514
Summary

This gene encodes a transmembrane protein that contains multiple epidermal growth factor repeats that functions as a regulator of cell growth. The encoded protein is involved in the differentiation of several cell types including adipocytes. This gene is located in a region of chromosome 14 frequently showing unparental disomy, and is imprinted and expressed from the paternal allele. A single nucleotide variant in this gene is associated with child and adolescent obesity and shows polar overdominance, where heterozygotes carrying an active paternal allele express the phenotype, while mutant homozygotes are normal. [provided by RefSeq, Nov 2015]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that brief ethanol exposure significantly activated the DLK1 gene in primary cortical astrocytes, alongside a broad transcriptional profile resembling that induced in hepatocytes [Pignataro et al. DOI:10.1002/Brb3.125].