Basic Information

Symbol
DLL3
RNA class
mRNA
Alias
Delta Like Canonical Notch Ligand 3 SCDO1 Drosophila Delta Homolog 3 Delta-Like Protein 3 Delta3 Delta (Drosophila)-Like 3 Delta-Like 3 (Drosophila) Delta-Like 3
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_203486.3
Sequence length
2004.0 nt
GC content
0.6742

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-966.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -999.70 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 501.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((...((.......))....))))))..((((((((((.(((.......))).)))....))))...............((((((((((((..(((...((((((.((((((((((((...........((.((((((((((((...(((((((((((((....(((((((((((((.(((...(((..(((((((.((.(((..(((((((((((((((...(((((((((((((((.....((((((((.((.((((...)))).)).))))))))(((..((.(((((..((((((((.((.(((((((((((.(((((...((((....((((......((((((((....))).))))))))).)))).((((((((((..............))))))))))...))))).)))(((.(((((...(((((((((((((((((((((((((.((((.(((.((.....)).)))((((((.((((.((.(((..(.....(((.(((((((.((.(.((((((((..........))))).))).).)).))))))))))..)..))).)).)))).)))))))))).)))))).))))).((((((((((((....(((......)))...))))))))..))))..........((((((....).))))).)))))))).(((((((..((((((((((..((.......))..))).))).))))....)))))))....(((((.........))))).((((((.((..(((((((((((((.(((((((((.(((((..((....))..)))))....))))))))).)))..(((......)))...((((......)))))))))))))).)))))))).))))))))))).)))((....))..)))))))).)).))))))))))))))))))(((((((((..(((......))).)))))))))...)))))))))..(.(((((((.......))))))).)..))....)))).....)))))...))))))..))))....))).))))))))))))))))))).)).).))))))....)))))...)).)).)))))))))))))))).)).......((((.((....)).))))((((((((.(((((((.(((((((((..(((((((.......(((((((.((((.((((((..(((.(((((((((((((.(((((((((......)))))))))))))))))(((((..((((((((((....((((.(.((((((((.(......))))))))).).)).)).....))))))))))....))))).......((.(((....(((((.(((((((((......)))))))))))))))))...)).)))).).)))..)))))).))))...)))))))...((.(((((((...)))))))))..((..((.((........))))..)).(((((((.((.(((((((.(((.((((((((((((.........)))))).)))))).))).))))))).)).)))))))...)))))))..)))))).))).)))))))))))))))..((((((((((((((.((.(((.........((...((((.(....).)))).))((((((..(((((......((((((.((((..((......(((((((((((....))).))))))))......))...)))))))))))))))(((((((....).)))))).))))))))))).)))))....)))))))))))))))...)))))).)))))).((((((((...))))))))((.(((......))).))))))))))))))))).....(((......)))....(((((((((..((((((.....(((((.................)))))....)))))).))))))))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
......((((((...({.......))....))))))..((((({{(((.(((.......))).)))..,,|}}}..,,,..........(((((((((((((((((.((((((((((((((((((((...........{((((((.(((((((({|,(((((,{.(((((({(,(((.((.((((((((.....((.(.((((.....)))).}.))..}.)))).)))).))))).)).)))))).).),)))}}.|,}|}}})))),)))).)}}(((((((((((((((((....)))).(((((((((.(((((.((((((((..((((...((((,{(((((((({.(((((((((.{((({|.,|}|||{((((((.(((((((((((......,,....,))))))))).))))))...}}}}.,}}}}}}}},,})))),}((((((((((.......))))))))))|||||,..,}.))})))))))}))))))..))))...)))).)))).)))))))))}.})))).......)).))))))))))){(({(,,(((((({(.{(({{,,((({{,.,|})|...,})}),,})}))}).)}...}})))(((((({{{.,,))))))))).}}))),,..)))))))))))....((((((((.(((((((.(((.....)))..(((((((..((((((((((...{......,||,.}}}.)))}))))....)))))))(((.(((((.........)))))..)))..))))))).)).))))))...))))))))){((((..{(....||,,}}}}},...((((((((((((((((((.(((...((((((((((((........(((((.((((..(((((......))},))....)))).)))))))))))))))))..(((((((((.((((((((((((((((..(((......))).))))))))),.......((((((((((((((((((((......((((({(({.....(((,,((((.((((((..((((({,(,......)).}),)))}.))))))..))))))))..,|||((,,{}}.}},,,}||((((...(((.(((...((((...)))).(((.((((((((,,({({,(((..{((((((((.(({.{{|,,{,.,.,,)),.}}.}.|||,||||}}}))),))))...))))))))))}(((((.((((((((((......))))))).))).)))))(((((..((((((((((....(((({(.((((((({.,.,,,},))))))))).,.}),)).....))))))))))....)))))....))))))...))))||{{,.(((((((((......))))))))))))),))))).....)))))))))))}})))))))))))))))))))))))))).))))).))))))))))))).,..,({(({{{{....||,..((((((((((...,..,((((({((({((((((((((((.........}))))).)))))).,,,.,)))))))))},|||||....}}||{(((((((....))).)))))))))))))))..((((((((((((((.((.(((.........{{...((({.{....}.)}}),||((((((,{{((((.....,(((((,{((((..((...,{.(((((((((((....))).))))))))...,,.))...)))))))))))))))|{{{{{|....},)))))}.})))))))))).)))))....))))))))}...,.....}},})))))))){{((((((((...)))))))}.|}|,,.,,,..,,)}))))}))))))))))))........,.,||.,,.,}},((((((((({.((((((.....,{{({,................))))}....))))))}))))))))))))....

Transcripts

ID Sequence Length GC content
ACUCCCGAGACCCCCCCACCAGAAGGCCAUGGUCUCCCCACGGAUGUCC… 2341 nt 0.6510
ACUCCCGAGACCCCCCCACCAGAAGGCCAUGGUCUCCCCACGGAUGUCC… 2004 nt 0.6742
Summary

This gene encodes a member of the delta protein ligand family. This family functions as Notch ligands that are characterized by a DSL domain, EGF repeats, and a transmembrane domain. Mutations in this gene cause autosomal recessive spondylocostal dysostosis 1. Two transcript variants encoding distinct isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for DLL3 Gene

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.