Basic Information

Symbol
DMKN
RNA class
mRNA
Alias
Dermokine ZD52F10 Epidermis-Specific Secreted Protein SK30/SK89 UNQ729
Location (GRCh38)
19:35497220-35513693
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_033317.5
Sequence length
1924.0 nt
GC content
0.5925

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-794.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -827.22 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 573.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001035516.4 NCBI
ACAAGCACAUGAACAUGAAGCCGGCCACUGCCUCUGCUCUGCUCCUGCU… 600 nt 0.5717
NM_001126056.3 NCBI
GAGAAGCCCAGGCAGUUGAGGACAGGAGAGAGAAGGCUGCAGACCCAGA… 1891 nt 0.5838
NM_001126057.3 NCBI
GAGAAGCCCAGGCAGUUGAGGACAGGAGAGAGAAGGCUGCAGACCCAGA… 1488 nt 0.6035
NM_001126058.3 NCBI
GAGAAGCCCAGGCAGUUGAGGACAGGAGAGAGAAGGCUGCAGACCCAGA… 1452 nt 0.6047
NM_001126059.4 NCBI
AUUGCGUAGUUCCGAAUACCCUCGGCCACACCUGGCCUUCUCCAUGCUC… 932 nt 0.5494
NM_001190347.2 NCBI
GAGAAGCCCAGGCAGUUGAGGACAGGAGAGAGAAGGCUGCAGACCCAGA… 1843 nt 0.5882
NM_001190348.2 NCBI
GAGAAGCCCAGGCAGUUGAGGACAGGAGAGAGAAGGCUGCAGACCCAGA… 1602 nt 0.5999
NM_001190349.2 NCBI
GAGAAGCCCAGGCAGUUGAGGACAGGAGAGAGAAGGCUGCAGACCCAGA… 1401 nt 0.6053
NM_001308380.2 NCBI
AUUGCGUAGUUCCGAAUACCCUCGGCCACACCUGGCCUUCUCCAUGCUC… 974 nt 0.5524
NM_001308383.2 NCBI
AUUGCGUAGUUCCGAAUACCCUCGGCCACACCUGGCCUUCUCCAUGCUC… 881 nt 0.5471
Showing 1 to 10 of 16 entries
Summary

This gene is upregulated in inflammatory diseases, and it was first observed as expressed in the differentiated layers of skin. The most interesting aspect of this gene is the differential use of promoters and terminators to generate isoforms with unique cellular distributions and domain components. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2010]

Forensic Context

A study in Wistar-albino rats demonstrated that the DMKN exhibits a time-dependent expression pattern following mild traumatic brain injury, with decreased expression at 1 hour post-trauma and a gradual increase thereafter [Colak et al. DOI:10.1016/j.injury.2012.01.021].