Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001190348.2
Sequence Length
1602 nt
GC Content
0.5999
GAGAAGCCCAGGCAGUUGAGGACAGGAGAGAGAAGGCUGCAGACCCAGAGGGAGGGAGGACAGGGAGUCGGAAGGAGGAGGACAGAGGAGGGCACAGAGACGCAGAGCAAGGGCGGCAAGGAGGAGACCCUGGUGGGAGGAAGACACUCUGGAGAGAGAGGGGGCUGGGCAGAGAUGAAGUUCCAGGGGCCCCUGGCCUGCCUCCUGCUGGCCCUCUGCCUGGGCAGUGGGGAGGCUGGCCCCCUGCAGAGCGGAGAGGAAAGCACUGGGACAAAUAUUGGGGAGGCCCUUGGACAUGGCCUGGGAGACGCCCUGAGCGAAGGGGUGGGAAAGGCCAUUGGCAAAGAGGCCGGAGGGGCAGCUGGCUCUAAAGUCAGUGAGGCCCUUGGCCAAGGGACCAGAGAAGCAGUUGGCACUGGAGUCAGGCAGGUUCCAGGCUUUGGCGUAGCAGAUGCUUUGGGCAACAGGGUCGGGGAAGCAGCCCAUGCUCUGGGAAACACUGGGCACGAGAUUGGCAGACAGGCAGAAGAUGUCAUUCGACACGGAGCAGAUGCUGUCCGCGGCUCCUGGCAGGGGGUGCCUGGCCACAAUGGUGCUUGGGAAACUUCUGGAGGCCAUGGCAUCUUUGGCUCUCAAGGUGGCCUUGGAGGCCAGGGCCAGGGCAAUCCUGGAGGUCUGGGGACUCCGUGGGUCCACGGAUACCCCGGAAACUCAGCAGGCAGCUUUGGAAUGAAUCCUCAGGGAGCUCCCUGGGGUCAAGGAGGCAAUGGAGGGCCACCAAACUUUGGGACCAACACUCAGGGAGCUGUGGCCCAGCCUGGCUAUGGUUCAGUGAGAGCCAGCAACCAGAAUGAAGGGUGCACGAAUCCCCCACCAUCUGGCUCAGGUGGAGGCUCCAGCAACUCUGGGGGAGGCAGCGGCUCACAGUCGGGCAGCAGUGGCAGUGGCAGCAAUGGUGACAACAACAAUGGCAGCAGCAGUGGUGGCAGCAGCAGUGGCAGCAGCAGUGGCGGCAGCAGUGGCGGCAGCAGUGGUGGCAGCAGUGGCAACAGUGGUGGCAGCAGAGGUGACAGCGGCAGUGAGUCCUCCUGGGGAUCCAGCACCGGCUCCUCCUCCGGCAACCACGGUGGGAGCGGCGGAGGAAAUGGACAUAAACCCGGGUGUGAAAAGCCAGGGAAUGAAGCCCGCGGGAGCGGGGAAUCUGGGAUUCAGGGCUUCAGAGGACAGGGAGUUUCCAGCAACAUGAGGGAAAUAAGCAAAGAGGGCAAUCGCCUCCUUGGAGGCUCUGGAGACAAUUAUAGGGGGCAAGGGUCGAGCUGGGGCAGUGGAGGAGGUGACGCUGUUGGUGGAGUCAAUACUGUGAACUCUGAGACGUCUCCUGGGAUGUUUAACUUUGACACUUUCUGGAAGAAUUUUAAAUCCAAGCUGGGUUUCAUCAACUGGGAUGCCAUAAACAAGGACCAGAGAAGCUCUCGCAUCCCGUGACCUCCAGACAAGGAGCCACCAGAUUGGAUGGGAGCCCCCACACUCCCUCCUUAAAACACCACCCUCUCAUCACUAAUCUCAGCCCUUGCCCUUGAAAUAAACCUUAGCUGCCCCACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-652.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -679.31
Frequency: 0.0000
Diversity: 423.51
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........(((((((((((.((((((.......(((((...(((((((.(..((((..((..((((((((.((.((.((...((...(.((((.....(.(((((((.((((.((........(((((((............(((((((...((........))...))))).))....(((((((((((((.(..(((((..((((..((((((((((..((((.((((.......)))))))))).)))))).))..))))..))).)).....).))).)))))))))).(((((((......((((((.......))))))....)))))))((((......))))(((((.(.(((((((....)))))))..).)))))(.((((((.(.(.(....((....(((.((((((((.....)))))))))))...))....).).).)))))).)..)))))))......)).)))).))))))).).....((((((((.(...((((...(((((......((((....))))((((.(((...)))))))..((((((....)))))))))))))))...).)))))))).....((((((..((..((((....((((.(((((((((((((((....(((....(((((((...(((((((.(((((((..((((((....))))))..)))))))..)))..))))..)))))))..(((..((((((((....)))))))))))....))).....))))))))).....))))))))))..((((..(((((((((((......)))))))))))..)))).))))))..))))))......)))).)...)))))).)).))))))))...))....))))..)..)))))))....)))))(((((((.(((((.((.((.((....((.((......((....)).....)).))....)).)).)).).((.((....)).)).((.((.((.((....)).)).)).))..((.((.((.((.((....)).)).)).)).))..........)))).))))))))))))).(((.((......)).)))(((((((((..(((...)))..))..)))))))......(((...(((.(((.......))).))).)))...(((((....))))).......(..(((((((((((.((((.......((((((..((...))..)))))).........((((....)))))))).)))))))))))..).......((((((((((((.(((...((...(((((((.((((......(((((((.(((((.....((((((((.((.......)).))).)))))...))))).(((((((((........(((((((...)))))))..(((..((((((((...............((((...)))))))))))))))..)))))).)))...)))))))...(((.(((((........))))))))......))))..)))).)))..))...))).))))))))))))........))))))))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..........(((((((((((.((((((.......(((((...(((((((.(..((((..((..((((((((.((.((.(({..,{,{,{,((,(,,.,.(.(((((((.((((.((........(((((((.{{....,,,,.{.((((....,,}}||,,,{(((,((,{,,.....,.||{{{{{{|||||{({{,(((({{((((..(((,,,,,.,}}||||,||||}}}}.}}))||||||.,.}|}}}}.}}..|))},,||},{,.....,.}}}.}}))|||||}|(((((((......((((((......,))))))....))))))){{{{.....{||||{((((.(.(((((((....)))))))..).)))))}})),,|||.||,,....,{..,,{{{.((({{{||.,,,.})))))))})))},}).}}})...}}))}}.,.)}.)))))))......)).)))).))))))).).....((((((((.(...((((...(((((,.....((((,...}}|,((((,(((...))))))).,{{{{{|,,,,}}}}}))))))))))...).))))))))....,||||{{,,((|,{(({.,||{{((|(|{(({(({{(((({||.,|)))}}}||(((({...||{{(((.(((((((..((((((....))))))..)))))))..)))..||||,.|||||}}..(((..((((((((....)))))))))))..|,}})......{{|||{|,...{{|||||,,,,...||||}}|,,,,||||||}.}}}})))),||||||..,,,))))))||,.||,,,.....}}}))).....))),)).)).))))))))...))....))))..)..)))))))....)))))(((((((.((((,,(,,(,.{,{{.,({,({.{,.{{.({....|,....}}.|..}}.)}.)).)).),||.{|..|.|}.}}.||.||.||.||.,,.)).)).}|,,|..((.((.((.((.((....)).)).)).)).))..}.)}.,..)))).))))))))))))),{,,,{{....{{{,.((((((,((({(..(({...}))..)))).))))))..}}}.,,,...(((.(((.......))).))).,,}...(((((....)))))....,,,{..(((((((((((.((((,..,...((((((..({...})..)))))).........,(((....)))))))).)))))))))))..)..,,.,.((((((((((((.(((.,,((,..(((((((.((((......{((((((.(((((.....((((((((.((.......)).))).)))))...))))).{{(((({{{,|......{((((({...}))))))..{{{.,,(((((((...............((({...)))))))))))))}}.|)))}}}.},),.,))))))}...(((.(((((........))))))))......))))..)))),)})..))...))).))))))))))))...,,...))))))))))).....
Back