Basic Information

Symbol
AFAP1L2
RNA class
mRNA
Alias
Actin Filament Associated Protein 1 Like 2 KIAA1914 XB130 Actin Filament-Associated Protein 1-Like 2 AFAP1-Like Protein 2 Em:AC005383.4 FLJ14564 Actin Filament Associated Protein 1-Like 2 CTB-1144G6.4 CTB-1144G6.6
Location (GRCh38)
10:114293604-114404775
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001001936.3
Sequence length
3722.0 nt
GC content
0.5078

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1249.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1313.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1060.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001001936.3 NCBI
AGAGCAGCGCAGAAGCCGAGCCGCGAGGAGCGCACUCCGUGGCCCCGAU… 3722 nt 0.5078
NM_001287824.2 NCBI
AGAGCAGCGCAGAAGCCGAGCCGCGAGGAGCGCACUCCGUGGCCCCGAU… 3881 nt 0.5120
NM_001351064.2 NCBI
AGAGCAGCGCAGAAGCCGAGCCGCGAGGAGCGCACUCCGUGGCCCCGAU… 3761 nt 0.5076
NM_001351065.2 NCBI
AGAGCAGCGCAGAAGCCGAGCCGCGAGGAGCGCACUCCGUGGCCCCGAU… 3806 nt 0.5095
NM_001351066.2 NCBI
AGAGCAGCGCAGAAGCCGAGCCGCGAGGAGCGCACUCCGUGGCCCCGAU… 3545 nt 0.5018
NM_001351067.2 NCBI
AGAGCAGCGCAGAAGCCGAGCCGCGAGGAGCGCACUCCGUGGCCCCGAU… 3773 nt 0.5086
NM_001351068.2 NCBI
AGAGCAGCGCAGAAGCCGAGCCGCGAGGAGCGCACUCCGUGGCCCCGAU… 3764 nt 0.5077
NM_001351069.2 NCBI
AGAGCAGCGCAGAAGCCGAGCCGCGAGGAGCGCACUCCGUGGCCCCGAU… 3719 nt 0.5077
NM_001351070.2 NCBI
AGAGCAGCGCAGAAGCCGAGCCGCGAGGAGCGCACUCCGUGGCCCCGAU… 3935 nt 0.5136
NM_001351071.2 NCBI
AGAGCAGCGCAGAAGCCGAGCCGCGAGGAGCGCACUCCGUGGCCCCGAU… 4019 nt 0.5151
Showing 1 to 10 of 20 entries
Summary

Enables SH2 domain binding activity; SH3 domain binding activity; and protein tyrosine kinase activator activity. Involved in several processes, including positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway; regulation of gene expression; and regulation of mitotic cell cycle. Located in cytosol and plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human trauma patients demonstrated that the AFAP1L2 mRNA was significantly downregulated in circulating CD3+ T cells during the injury stage compared to the recovery stage [Rau et al. DOI:10.2147/JIR.S375881].