Basic Information

Symbol
DPEP2
RNA class
mRNA
Alias
Dipeptidase 2 EC 3.4.13.19 MBD2
Location (GRCh38)
16:67987392-68000615
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022355.4
Sequence length
1728.0 nt
GC content
0.5718

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-647.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -678.02 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 477.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001324159.2 NCBI
GGAGUGUGGCUGCAGAACCCAGGUGGCAGGGCUUUCCUCAGGCCCCUUA… 1269 nt 0.5548
NM_001369657.1 NCBI
GGUGCCGCCGCUCUCCGCACAUCCUUCGCGGGGCCCUGUGACUUCGUUA… 1759 nt 0.5884
NM_022355.4 NCBI
ACACACUAGUGAAAUCUUGUCUUAGUGUGUCCGGAAUUGGUGGGUUCUU… 1728 nt 0.5718
Summary

DPEP2 belongs to the membrane-bound dipeptidase (EC 3.4.13.19) family. These enzymes hydrolyze a variety of dipeptides, including leukotriene D4, the beta-lactam ring of some antibiotics, and cystinyl-bis-glycine (cys-bis-gly) formed during glutathione degradation (Habib et al., 2003 [PubMed 12738806]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

A study in human leukocytes from severe burn patients identified the DPEP2 as a top sustained increasing gene (SIG) with expression rising from the healthy state through the late recovery phase (>400 hours post-injury), classifying it as a core biomarker for burn recovery [Xu et al. DOI:10.1159/000493451].