Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_022355.4
Sequence Length
1728 nt
GC Content
0.5718
ACACACUAGUGAAAUCUUGUCUUAGUGUGUCCGGAAUUGGUGGGUUCUUGGUCUCACUGAGUUCUAGAAUGAAGCUGCAGACCCUCGCAGUGAGUGUUACAGCUCUUAAGGCUCUCUGACUGCCACCCCUGCCUGCCUGCCCGGCCCUGCACAACAUGCAGCCCUCCGGCCUCGAGGGUCCCGGCACGUUUGGUCGGUGGCCUCUGCUGAGUCUGCUGCUCCUGCUGCUGCUGCUCCAGCCUGUAACCUGUGCCUACACCACGCCAGGCCCCCCCAGAGCCCUCACCACGCUGGGCGCCCCCAGAGCCCACACCAUGCCGGGCACCUACGCUCCCUCGACCACACUCAGUAGUCCCAGCACCCAGGGCCUGCAAGAGCAGGCACGGGCCCUGAUGCGGGACUUCCCGCUCGUGGACGGCCACAACGACCUGCCCCUGGUCCUAAGGCAGGUUUACCAGAAAGGGCUACAGGAUGUUAACCUGCGCAAUUUCAGCUACGGCCAGACCAGCCUGGACAGGCUUAGAGAUGGCCUCGUGGGCGCCCAGUUCUGGUCAGCCUAUGUGCCAUGCCAGACCCAGGACCGGGAUGCCCUGCGCCUCACCCUGGAGCAGAUUGACCUCAUACGCCGCAUGUGUGCCUCCUAUUCUGAGCUGGAGCUUGUGACCUCGGCUAAAGCUCUGAACGACACUCAGAAAUUGGCCUGCCUCAUCGGUGUAGAGGGUGGCCACUCGCUGGACAAUAGCCUCUCCAUCUUACGUACCUUCUACAUGCUGGGAGUGCGCUACCUGACGCUCACCCACACCUGCAACACACCCUGGGCAGAGAGCUCCGCUAAGGGCGUCCACUCCUUCUACAACAACAUCAGCGGGCUGACUGACUUUGGUGAGAAGGUGGUGGCAGAAAUGAACCGCCUGGGCAUGAUGGUAGACUUAUCCCAUGUCUCAGAUGCUGUGGCACGGCGGGCCCUGGAAGUGUCACAGGCACCUGUGAUCUUCUCCCACUCGGCUGCCCGGGGUGUGUGCAACAGUGCUCGGAAUGUUCCUGAUGACAUCCUGCAGCUUCUGAAGAAGAACGGUGGCGUCGUGAUGGUGUCUUUGUCCAUGGGAGUAAUACAGUGCAACCCAUCAGCCAAUGUGUCCACUGUGGCAGAUCACUUCGACCACAUCAAGGCUGUCAUUGGAUCCAAGUUCAUCGGGAUUGGUGGAGAUUAUGAUGGGGCCGGCAAAUUCCCUCAGGGGCUGGAAGACGUGUCCACAUACCCGGUCCUGAUAGAGGAGUUGCUGAGUCGUGGCUGGAGUGAGGAAGAGCUUCAGGGUGUCCUUCGUGGAAACCUGCUGCGGGUCUUCAGACAAGUGGAAAAGGUACAGGAAGAAAACAAAUGGCAAAGCCCCUUGGAGGACAAGUUCCCGGAUGAGCAGCUGAGCAGUUCCUGCCACUCCGACCUCUCACGUCUGCGUCAGAGACAGAGUCUGACUUCAGGCCAGGAACUCACUGAGAUUCCCAUACACUGGACAGCCAAGUUACCAGCCAAGUGGUCAGUCUCAGAGUCCUCCCCCCACAUGGCCCCAGUCCUUGCAGUUGUGGCCACCUUCCCAGUCCUUAUUCUGUGGCUCUGAUGACCCAGUUAGUCCUGCCAGAUGUCACUGUAGCAAGCCACAGACACCCCACAAAGUUCCCCUGUUGUGCAGGCACAAAUAUUUCCUGAAAUAAAUGUUUUGGACAUAGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-647.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -678.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 477.07
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.((.......)))))))))))((((....(((((((...((((.(((..(((((.(((...((.((((..(((.(((.....))).))).))))))))).)))))..)))..)))).....)))))))...)))).(((((((((((....((((((.......))))))(((((((....((((..((((.(((((..((((..((.((.......)).)).))))..(((((......(((....))).....))))).........((((..........)))).....))))).)))))))))))))))..(((.((((((...(.(((((((((((((((((((..(((.(.((((((....)))))).))))..)))..(((((....)))))..((((....))))...((((((((...........)))))))).....((((..((..((((.......)))).))..))))((((....((((......))))...))))..(..(((((..(((((((..(((....)))...))))))).)))))..).....(((((((((((((..((((.((.......)).)))).....((((.(((((((.(((.(((((.....(((((((.((((((((..(.(....))..)))))).......)))))))))...)))..))..))))))))))))))(((...((((.((((((((.((...(.(((((...(((((.(((((.....)))))))))).....((((((.((((......((((.((((((((((((((.(((........((((((.(((((((((((.((.(((..((((........))))..))).)))))))).)))))).........(((((((((.((((.(.....)))))))))((((.(((...))).)))).))))))))))(((((.(((((((....))))))))))))....)))..)))))))))))))))))).(((.((((((.(((((......))))).))).)))..))).........)))))))))).))))).).))))))))).).))))..)))..(((..(((((((.((((((.(((...(((((..((.....))..)))))....)))...)))))).(((((((((....)))))..)))).....)))))))....)))....(((....))).((((.......))))))).)))))))))).....))).))))))))).))))).)))))))))..((((((..(((((((....((((.....(((((((((((.(((((.....((((((((.((.(((((.........(((...)))....(((((((.((((((((((((.((((..((.....)))))))).)))).........(((((.((((((.......))))))..)))))..))))))..((((((((.((((...((((((......))..))))....))))..)))))))).))))))).......(((((.(((.(......)))).))))).)))))..)))))).)))).....))))).)))))(((..(((......)))...)))))))))..)))).)))))))....))))))...)))))))))))......(((.(((.(((((....)))))))).)))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((((((((.((.......})))))))))},,(({{{{,((((({,,,{((({(({..{{{{{{,,,,..{,,((((,.(((.(({{|||}|||,}}}.,}))}}.,,||||}}..}|},.||||....,||},|||.,.||||{((((((.....}}}}|{{,,,.}}},.,)))))),.||||{,{{..((((((((((..(((((.((.(((((..(((.{..(((,.,.{{{{||,..,...(((((((((...((((..,((((((...(((,{......(((((..((((((((...{,((((.,....,,..)))).(((.((((((...(.(((((((((((((((((,(,,{{(,({((((((....}}}})).,)))}}))).,|||||,,..}|}}}..|,||},((((((...((((((((...,.......)))))))).....((((..((..((((.......)))).))..)))).,,...(((((....(((((....}))))..,...))))).,||{(((({((.{{{{{||{{.||,,|||.,,)}})},.)},}})))}).))).}))}|(((.((.......)).)))}.....((((.(((((((.(((.(.((,.,{..(((((((.{(((((((..(.(....))..))))))),.......)))))))...)),..))}.))))))))))))))))))))((((.((((((((.{(...,.(((((..,((((({(((({.....||||}}}|||.....,{{{{|.{{{|,,,...(((,{((((((((((((((.(((....,,..((((({.(((((((((((.({.(((..(((({.....}.))))..))).}))))))).)))))}.........(((((((((.((((.{.....})))))))){(((.(((...))).)))).))))))))))(((((.(((((((....))))))))))))....}))..)))))))))))))))))).,{{.((((((.(((((......))))).))).))),,||,....))}}.)))))))))}.))))).).}}))))))).).)))).......{((..(((((((.{{{{{(,{(({,,(((((..((.....))..)))))....}}}...}})))},{({,.{{{{,,,.}))})}})))).,,..)))))))....))},{{{((({..{|||{(((.....{{{|...,}},}))))))))}..,}.)))}))))))))).))))).))))))))).....,,|..))))))))..)))))....,|,))).))))))...|....))))...)))))))))............(((...)))..,))|}|,|,.}}},,}.)))..))))))).))))).....))))..))))))....}}||{||.((((((.......))))))..})}}).{|||||||.{{(((({{.((({...(((({{,,,...}}..))))....))))..})))))))})}}}}.........{||{{.{{{.,...,..)})),))))}.......,},,,,,..{((((((({|||,{|,,.|{{{..{{{..,...)}}...})))},}))}))))))))...))}}}..)))))},{||||||}||||.,,{..((({(,,.,||||}..}))))))})}}}},...
Back