Basic Information

Symbol
DPF3
RNA class
mRNA
Alias
Double PHD Fingers 3 SMARCG3 BAF45c Cerd4 D4, Zinc And Double PHD Fingers, Family 3 BRG1-Associated Factor 45C Zinc Finger Protein Cer-D4 Zinc Finger Protein DPF3 FLJ14079 Cer-D4 BAF45C CERD4
Location (GRCh38)
14:72609034-72894101
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001280542.3
Sequence length
11413.0 nt
GC content
0.5318

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4372.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4573.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2836.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001280542.3 NCBI
ACAUUGUAGCAAAAUGGCGACUGUCAUUCACAACCCCCUGAAAGCGCUC… 11413 nt 0.5318
NM_001280543.2 NCBI
ACAUUGUAGCAAAAUGGCGACUGUCAUUCACAACCCCCUGAAAGCGCCC… 4199 nt 0.4832
NM_001280544.2 NCBI
AUUCUCGUCUUCACCCCUGGCCACUCCUGGAGUUGAAAACCAGGUUCGC… 4513 nt 0.4862
NM_012074.5 NCBI
ACAUUGUAGCAAAAUGGCGACUGUCAUUCACAACCCCCUGAAAGCGCUC… 4055 nt 0.4824
Summary

This gene encodes a member of the D4 protein family. The encoded protein is a transcription regulator that binds acetylated histones and is a component of the BAF chromatin remodeling complex. Alternate splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2013]

Forensic Context

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