Basic Information

Symbol
DPP6
RNA class
mRNA
Alias
Dipeptidyl Peptidase Like 6 DPPX DPL1 A-Type Potassium Channel Modulatory Protein DPP6 Dipeptidyl Aminopeptidase-Like Protein 6 Dipeptidyl Peptidase VI Dipeptidyl-Peptidase 6 Dipeptidyl Peptidase 6 DPP VI Dipeptidyl Aminopeptidase IV-Related Protein Dipeptidyl Aminopeptidase-Related Protein Dipeptidyl Peptidase IV-Related Protein Dipeptidyl Peptidase IV-Like Protein Dipeptidylpeptidase VI Dipeptidylpeptidase 6 MRD33 VF2
Location (GRCh38)
7:153748133-154894285
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_130797.4
Sequence length
4826.0 nt
GC content
0.5346

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1723.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1805.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1238.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001039350.3 NCBI
GCAGUCAGAGCUGCCUCUCGCCCUCGCUAGCUGGGCUCGCAGCCUCUUC… 4561 nt 0.5157
NM_001290252.2 NCBI
ACUCGGGUCCCCUUCCUGCACCCAGCCGCCACUUGCCGGUUGCUAAGCA… 4418 nt 0.5229
NM_001290253.2 NCBI
GGAAUGUGUGCCGGUCUCUAGGUGGUGCCAAAUUCUGGGGCCUAGGCAU… 2032 nt 0.5285
NM_001364497.2 NCBI
AGAGCGCUCGCAUCCCUCAGCUGUAGCUCGUGCAGCCUGUGCUAACGAG… 4605 nt 0.5281
NM_001364498.2 NCBI
AGAGCGCUCGCAUCCCUCAGCUGUAGCUCGUGCAGCCUGUGCUAACGAG… 4601 nt 0.5281
NM_001364499.2 NCBI
AGAGCGCUCGCAUCCCUCAGCUGUAGCUCGUGCAGCCUGUGCUAACGAG… 4611 nt 0.5281
NM_001364500.2 NCBI
AGAGCGCUCGCAUCCCUCAGCUGUAGCUCGUGCAGCCUGUGCUAACGAG… 4698 nt 0.5307
NM_001364502.2 NCBI
ACUCGGGUCCCCUUCCUGCACCCAGCCGCCACUUGCCGGUUGCUAAGCA… 2243 nt 0.4944
NM_001936.5 NCBI
ACUCGGGUCCCCUUCCUGCACCCAGCCGCCACUUGCCGGUUGCUAAGCA… 4553 nt 0.5212
NM_130797.4 NCBI
GGAAUGUGUGCCGGUCUCUAGGUGGUGCCAAAUUCUGGGGCCUAGGCAU… 4826 nt 0.5346
Summary

This gene encodes a single-pass type II membrane protein that is a member of the peptidase S9B family of serine proteases. This protein has no detectable protease activity, most likely due to the absence of the conserved serine residue normally present in the catalytic domain of serine proteases. However, it does bind specific voltage-gated potassium channels and alters their expression and biophysical properties. Variations in this gene may be associated with susceptibility to amyotrophic lateral sclerosis and with idiopathic ventricular fibrillation. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2014]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that selection for ethanol preference significantly altered gene expression networks in the nucleus accumbens shell, identifying the DPP6 as a hub node showing higher intramodular connectivity in the low preference line [Colville et al. DOI:10.1111/Gbb.12367].