Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001364498.2
Sequence Length
4601 nt
GC Content
0.5281
AGAGCGCUCGCAUCCCUCAGCUGUAGCUCGUGCAGCCUGUGCUAACGAGCCCGGGUGCCGUCCCAGCUCCUCCUCCGCCCACUCCACUGUCUCUCUUUCGCCUGUGCAGUGGUUCCUGGCAAAACCUCUUAUGCCACCUCCCGACCAUCCCGGGAAGAUUUGGCGGCUGGAGCCCUGCGCAGGAGCUCUCUGGGCUGCGGAUUUUACCGCCCCUGCACAGAAGCCUGCAGCGUGGAGGCUCCCCUCGCGCUCGCCCAGACUCGGCUGCAGAAGGAGGACCCACCUCGCGUCUCCCCCGAGGCGCGCACCUCUGUCGCCACCCUCCACGCGCCUAGGAAGUUUUGAAGGUAGAGAAUCUGGGCCCCUCAACUUCCUCUGGACAUGAAUCAAACCGCAGGAGUCUCCAAUAGCGUCAGGUGUCCCCCGGGGAAAGGCCACAAGGAGCUGGUGGGGAGUAACCCUCCGCAGAGGAAUUGGAAAGGAAUAGCAAUUGCACUGCUUGUCAUUCUGGUCAUCUGCUCCUUGAUCGUCACCUCGGUCAUACUUCUGACACCAGCGGAAGAUAAUAGUCUGUCUCAAAAGAAGAAGGUCACUGUAGAAGAUCUCUUCAGUGAAGACUUCAAAAUUCAUGACCCCGAGGCUAAGUGGAUAAGUGAUACAGAAUUCAUCUACAGAGAACAGAAAGGAACAGUGAGACUGUGGAAUGUUGAAACAAAUACUUCUACUGUCUUAAUAGAAGGCAAAAAAAUUGAAUCAUUAAGAGCCAUCAGAUAUGAAAUAUCUCCAGAUAGAGAGUAUGCACUUUUUUCAUACAAUGUGGAACCCAUAUAUCAACACUCGUAUACUGGAUAUUACGUCCUGAGCAAAAUUCCUCAUGGGGAUCCUCAAAGUCUGGACCCACCAGAAGUCAGCAAUGCAAAACUUCAGUAUGCAGGAUGGGGCCCUAAAGGCCAACAGCUGAUAUUUAUUUUUGAAAACAAUAUCUACUACUGUGCACAUGUCGGGAAACAGGCCAUCCGUGUGGUCUCCACUGGCAAGGAAGGUGUGAUUUACAAUGGCCUCAGUGACUGGCUGUAUGAAGAGGAGAUUUUGAAGACACACAUCGCACACUGGUGGUCUCCGGAUGGCACGAGACUCGCCUACGCCGCCAUCAAUGAUUCCCGUGUCCCCAUCAUGGAGCUCCCAACUUACACCGGCUCCAUCUACCCCACCGUGAAGCCCUACCACUAUCCCAAGGCUGGAAGUGAGAACCCCAGCAUUUCCCUACACGUUAUUGGCUUAAAUGGACCCACCCAUGAUCUGGAGAUGAUGCCGCCUGAUGAUCCACGGAUGAGGGAGUACUACAUCACCAUGGUGAAGUGGGCCACCAGCACCAAGGUCGCCGUGACCUGGCUGAACCGGGCGCAGAACGUGUCCAUCCUCACCCUCUGCGACGCCACCACGGGGGUCUGCACGAAGAAACACGAGGAUGAAAGUGAGGCCUGGCUCCACAGACAGAAUGAAGAACCUGUGUUCUCCAAGGAUGGCCGAAAGUUUUUCUUCAUCAGAGCCAUCCCCCAGGGAGGACGAGGGAAAUUCUAUCACAUCACGGUGUCCUCGUCCCAGCCCAACAGCAGCAACGACAACAUCCAGUCCAUCACCUCCGGGGACUGGGACGUGACCAAGAUCCUAGCCUACGAUGAGAAGGGGAAUAAGAUCUACUUCCUGAGCACGGAGGACCUGCCUCGGAGACGACAACUCUACAGUGCCAACACGGUGGGCAACUUCAACAGGCAGUGCCUCUCCUGUGACCUGGUUGAGAACUGCACCUACUUCAGCGCUUCCUUCAGCCAUAGCAUGGACUUCUUCCUGCUCAAGUGCGAAGGUCCUGGUGUUCCUAUGGUGACGGUGCACAACACAACAGAUAAGAAAAAAAUGUUUGACCUAGAAACAAAUGAACAUGUCAAGAAGGCCAUAAAUGACCGACAGAUGCCUAAAGUGGAAUACAGGGACAUUGAGAUUGAUGAUUACAACCUGCCCAUGCAGAUACUGAAGCCAGCAACCUUCACCGACACCACCCACUACCCUCUGCUCCUGGUGGUGGAUGGCACCCCAGGCAGCCAGAGUGUGGCUGAGAAGUUCGAGGUGAGCUGGGAGACGGUGAUGGUGAGCAGCCACGGCGCGGUGGUGGUAAAGUGUGACGGCCGUGGCAGCGGCUUCCAAGGGACCAAGCUCCUGCACGAAGUGAGGCGGCGGCUGGGCUUGCUGGAGGAGAAGGACCAGAUGGAGGCCGUGCGGACGAUGCUGAAGGAGCAGUACAUUGACAGGACGCGCGUGGCCGUGUUUGGGAAGGAUUACGGUGGCUACCUGAGCACCUACAUCCUCCCAGCAAAGGGAGAAAAUCAAGGCCAGACAUUCACCUGCGGCUCUGCUCUCUCUCCAAUAACAGACUUCAAACUCUAUGCCUCUGCGUUUUCCGAGAGGUACUUGGGCCUCCAUGGACUUGACAACAGAGCAUACGAGAUGACCAAGGUAGCCCAUCGAGUCUCCGCGCUGGAAGAACAGCAGUUCCUGAUCAUUCAUCCCACUGCCGAUGAAAAAAUUCAUUUCCAGCACACAGCAGAACUCAUUACACAACUAAUUAGGGGAAAGGCUAAUUACAGCUUACAGAUUUACCCGGACGAAAGCCAUUACUUUACCAGCUCCAGCCUCAAACAGCAUCUGUACCGGUCCAUCAUCAACUUCUUCGUGGAAUGCUUCAGGAUCCAGGACAAACUGCUGACAGUCACAGCGAAAGAGGACGAGGAGGAGGACUAAGCUCAGGUCGCUCUAAGCACAAACGUGGCUCUUUCUACAACCAGAUGCAACCGAGGGAUUUCCCUGCCCUCCCUCUUCCCUCGGAGGGGCGGGGCGGGGCGGGGCCGGGUGUUCCAUAGCAUGUGUGUCUCGGAUGCGGAAGGCAGUUUUGCUUGGGAAACAAGCUCCUUCCCCGGGGUCAUCACUCACGGCCUCCAUGGCACCAGGGACAACGCUGUCCCCGCAGCAGCGCCUCCUCCCGGCGCCCGAGAGACCGGCACGCCACGGCCCCUCCCCCAAGGAACAGAGCAAAGGAUGGUGGCCGCAGGCCCCACGCGAGCCCACAGGACACCGGCCCCUAGAUUCCAGCCACCAAGCGGAAGCAUGAGACCCGCCCACACUAGCCUCUGUGUUCCCGUUAGGGACAUCACACCCUGUCUCACGUCGCAGUGCCAUGGACGCAGCAGUUACAGCACCAUUGUUUUAGCAGUGCGUGUUCAUAUAUGGGCUUGCUACUUCCUGUAAUGAGGACGUUCAACAUGGUGAGGGGCUACAAGAAAACGCUUUUCUGUACAGAGUCUUACUGUAGCUACGCUAAUGGUUAACCUGAUAGAAUUAACUCGUAUUUUUCUAUGGUUUUAACCUGAUGCUCCACUGUCUCCGUCAUGGGGUUGUUUUGCUGUUUGGGGUUGGGCCUUGUUUCCCUUUCCUUUCUCCAGUCCACGUGUAGACUUUGCGCUUGAUGAAGAAGCAGAUCGGAAGUAACUGCUCCCUCCUCAAGGUUGUCUUCAGACGUCUUGGGGACGUUCCUAAACACUGAGGGGGAAGACAGCCAAUAGCACCCAUUAAAAGAAAUACCUAAAUAAAACCUCUCUCCCACUCAGCUAUGCUAGGGCUUGGCUGUAGGUGUGCACUGUCUAUUUACAUCCGUCCUUACAACCAUCCUUGUCCUCCUUGGUACCGUAUCAAGCUCUUUCCCAUGACAUUUGGUUUAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAAAAAAGACAAAGCGUCAACUCCACCCACAGGCCCGCUGUGUGUGCUCGGGCCACGGGAGUCCUGAGGGUUCUGUGGGCCUGCGCGCAUCCCUCUCCCAUCGUGGGGGUGGCUCCGUGACCUUCCUGCCACGAGCAGGAGGUUGAUGAUGUGCUACGUUAGCCUUGUAAGAUACACCCCCACCAAAUGUGCAGCCGGUGUUCCCAGUGUAUAUUUCAUUCUCUUGUAUAUAAAGGAAGCAAUGUGUGUCAGGCCUCUGUGCAGUCAACCCAGCCUCCUCCCGCCAGUGCUAACCCCGUGUUGAGCCUGCAUGCUGACACUGUGGCCGAUCUGGACUCUAGAAGUGCUAGUUUGAAAUAUAUCCAUUACUGUCAUUUCCUUUUGAGCUUGUGGACAAGCUGAAUGUCAGGACUGACUUCGCCAGCUCCCAGCCCUGCGGGGGUGUCCUUGGCAUCCCAUCAGCAGAGGAGAUGCGUCCCUGUUGCAUUUUGGCGUUUGGGGCUUUGGGUUUAUCCACAUGAGCUCUGAACGUCCGUUAUAGUUAGGGUGAUUGGAAGGUCUCCAUCACUGGGUGUUUUAAAGGUGAUUCACCACCAUUUGUGAAAGGACCAACGUGCUGAUAAACAGGACCGAUCCGAGUGCUACAUGACUGUGCGUUUGCUAUUUCAAUGGGCCUGAACGACUACAAAGCCAGCUAGGUCUGGAAGGGGAAGCCAGCUCUGGCCACGACAUCUGGUCGGAGGGAAGUGGGGAUGUGGCAUGGUAGCGUCUGUUCAUCCAUGGAAUAAAACAUUAUUUUACCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1573.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1652.71
Frequency: 0.0000
Diversity: 1327.88
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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