Basic Information

Symbol
DYRK1A
RNA class
mRNA
Alias
Dual Specificity Tyrosine Phosphorylation Regulated Kinase 1A DYRK MNBH Dual Specificity Tyrosine-(Y)-Phosphorylation Regulated Kinase 1A Dual Specificity Tyrosine-Phosphorylation-Regulated Kinase 1A Dual Specificity YAK1-Related Kinase Protein Kinase Minibrain Homolog DYRK1 HP86 MNB Dual-Specificity Tyrosine-(Y)-Phosphorylation Regulated Kinase 1A Serine/Threonine-Specific Protein Kinase Mnb Protein Kinase Homolog Hp86 Serine/Threonine Kinase MNB MNB/DYRK Protein Kinase EC 2.7.11.23 EC 2.7.12.1 EC 2.7.12 MRD7 HMNB
Location (GRCh38)
21:37365573-37526358
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001347721.2
Sequence length
17024.0 nt
GC content
0.4453

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-5604.98 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -5912.41 kcal/mol
Frequency: 2.32194e-217
Diversity: 4280.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001347721.2 NCBI
GACCGGGUCGGUCCGUCGCCAUUUUGUUGGUUGGUUUUUUUUUAAACCC… 17024 nt 0.4453
NM_001347722.2 NCBI
GGCAUUUUCCGGCUAGGAGGCCCGCCAGCCCUUCGAAGAACCGGCUCCA… 16281 nt 0.4325
NM_001347723.2 NCBI
GACCGGGUCGGUCCGUCGCCAUUUUGUUGGUUGGUUUUUUUUUAAACCC… 16938 nt 0.4451
NM_001396.5 NCBI
AUACUUGGGUUUUCAAGCCUCGGGAGCUCACCCAGCAAUACAUAGCUAG… 16457 nt 0.4308
NM_101395.2 NCBI
GGGAGCGCGGCGCGGGAGCCCGAGGCUGAGACUCACCGGAGGAAGCGGC… 5517 nt 0.4274
NM_130436.2 NCBI
AAAAAUAACUCAUAUUGUCUCUGAGGUUCUUUUCCAGUGAAGUGUUUAG… 6580 nt 0.3997
NM_130438.2 NCBI
UGUUAUAGUUUUGCCGCUGGACUCUUCCCUCCCUUCCCCCACCCCAUCA… 5088 nt 0.4127
Summary

This gene encodes a member of the Dual-specificity tyrosine phosphorylation-regulated kinase ( DYRK ) family. This member contains a nuclear targeting signal sequence, a protein kinase domain, a leucine zipper motif, and a highly conservative 13-consecutive-histidine repeat. It catalyzes its autophosphorylation on serine/threonine and tyrosine residues. It may play a significant role in a signaling pathway regulating cell proliferation and may be involved in brain development. This gene is a homolog of Drosophila mnb (minibrain) gene and rat Dyrk gene. It is localized in the Down syndrome critical region of chromosome 21, and is considered to be a strong candidate gene for learning defects associated with Down syndrome. Alternative splicing of this gene generates several transcript variants differing from each other either in the 5' UTR or in the 3' coding region. These variants encode at least five different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the DYRK1A was identified by homology but showed an asphyxia-independent expression pattern in comparative RT-PCR validation, with no significant differential expression observed between hypoxic and control brain tissue groups [Ikematsu et al. DOI:10.1016/J.Forsciint.2006.08.015].