Basic Information

Symbol
ECHS1
RNA class
mRNA
Alias
Enoyl-CoA Hydratase, Short Chain 1 SCEH Enoyl Coenzyme A Hydratase, Short Chain, 1, Mitochondrial Enoyl-CoA Hydratase, Short Chain, 1, Mitochondrial Enoyl-CoA Hydratase, Mitochondrial Short Chain Enoyl-CoA Hydratase EC 4.2.1.17 MECH1 MECH Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Short-Chain Enoyl-CoA Hydratase Enoyl-CoA Hydratase 1 EC 5.3.3.8 EC 4.2.1 ECHS1D
Location (GRCh38)
10:133362472-133373714
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004092.4
Sequence length
1277.0 nt
GC content
0.5497

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-484.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -504.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 343.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004092.4 NCBI
GGGCGAGGAGUCCAGAGAGCCAUGGCCGCCCUGCGUGUCCUGCUGUCCU… 1277 nt 0.5497
Summary

The protein encoded by this gene functions in the second step of the mitochondrial fatty acid beta-oxidation pathway. It catalyzes the hydration of 2-trans-enoyl-coenzyme A (CoA) intermediates to L-3-hydroxyacyl-CoAs. The gene product is a member of the hydratase/isomerase superfamily. It localizes to the mitochondrial matrix. Transcript variants utilizing alternative transcription initiation sites have been described in the literature. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that a 7-day overfeeding intervention in lean and obese men induced up-regulation of the ECHS1 gene, which is involved in metabolic processes, in abdominal subcutaneous adipose tissue as part of a broader transcriptomic response to an energy surplus [Shea et al. DOI:10.3945/ajcn.2008.25970].