Basic Information

Symbol
ECI1
RNA class
mRNA
Alias
Enoyl-CoA Delta Isomerase 1 DCI Dodecenoyl-Coenzyme A Delta Isomerase (3,2 Trans-Enoyl-Coenzyme A Isomerase) Enoyl-CoA Delta Isomerase 1, Mitochondrial Delta(3),Delta(2)-Enoyl-CoA Isomerase D3,D2-Enoyl-CoA Isomerase Dodecenoyl-CoA Isomerase Dodecenoyl-CoA Delta Isomerase (3,2 Trans-Enoyl-CoA Isomerase) 3,2-Trans-Enoyl-CoA Isomerase, Mitochondrial Epididymis Secretory Sperm Binding Protein 3,2 Trans-Enoyl-Coenzyme A Isomerase 3,2 Trans-Enoyl-CoA Isomerase 3,2-Trans-Enoyl-CoA Isomerase Acetylene-Allene Isomerase EC 5.3.3.8
Location (GRCh38)
16:2239402-2252300
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001919.4
Sequence length
1507.0 nt
GC content
0.6131

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-667.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -689.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 316.43
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001178029.2 NCBI
AUCCCGCGCGUUGCGGUCAAGAUGGCGCUGGUGGCUUCUGUGCGAGUCC… 1456 nt 0.6154
NM_001919.4 NCBI
AUCCCGCGCGUUGCGGUCAAGAUGGCGCUGGUGGCUUCUGUGCGAGUCC… 1507 nt 0.6131
Summary

This gene encodes a member of the hydratase/ isomerase superfamily. The protein encoded is a key mitochondrial enzyme involved in beta-oxidation of unsaturated fatty acids. It catalyzes the transformation of 3 -cis and 3 - trans-enoyl-CoA esters arising during the stepwise degradation of cis-, mono-, and polyunsaturated fatty acids to the 2 - trans-enoyl-CoA intermediates. Alternatively spliced transcript variants have been described. [provided by RefSeq, May 2 010]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the ECI1 is downregulated (-1.62-fold) in right ventricular tissue during monocrotaline-induced pulmonary arterial hypertension and failure, where it is categorized among dysregulated mitochondrial and metabolic genes [Potus et al. DOI:10.3390/ijms19092730]. A study in mice demonstrated that 3,2 trans-enoyl-CoA isomerase (Dci), a gene involved in the β-oxidation of unsaturated fatty acids, was specifically down-regulated following Kupffer cell-specific in vivo exposure to α-particles in the liver [Roudkenar et al. DOI:10.1269/jrr.07078].