Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001919.4

Sequence Length

1507 nt

GC Content

0.6131

AUCCCGCGCGUUGCGGUCAAGAUGGCGCUGGUGGCUUCUGUGCGAGUCCCGGCGCGCGUUCUGCUCCGCGCGGGGGCCCGGCUCCCGGGCGCGGCCCUCGGGCGGACGGAGCGGGCGGCCGGCGGCGGAGACGGCGCGCGGCGCUUCGGGAGCCAGCGGGUGCUGGUGGAGCCGGACGCGGGCGCAGGGGUCGCUGUGAUGAAAUUCAAGAACCCCCCAGUGAACAGCCUGAGCCUGGAGUUUCUGACGGAGCUGGUCAUCAGCCUGGAGAAGCUGGAGAAUGACAAGAGCUUCCGCGGUGUCAUUCUGACCUCGGACCGCCCGGGUGUCUUCUCGGCCGGCCUGGACCUGACGGAGAUGUGUGGGAGGAGCCCCGCCCACUACGCUGGGUACUGGAAGGCCGUUCAGGAGCUGUGGCUGCGGUUGUACCAGUCCAACCUGGUGCUGGUCUCCGCCAUCAACGGAGCCUGCCCCGCUGGAGGCUGCCUGGUGGCCCUGACCUGUGACUACCGCAUCCUGGCGGACAACCCCAGGUACUGCAUAGGACUCAAUGAGACCCAGCUGGGCAUCAUCGCCCCUUUCUGGUUGAAAGACACCCUGGAGAACACCAUCGGGCACCGGGCGGCGGAGCGUGCCCUGCAGCUGGGGCUGCUCUUCCCGCCGGCGGAGGCCCUGCAGGUGGGCAUAGUGGACCAGGUGGUCCCGGAGGAGCAGGUGCAGAGCACUGCGCUGUCAGCGAUAGCCCAGUGGAUGGCCAUUCCAGACCAUGCUCGACAGCUGACCAAGGCCAUGAUGCGAAAGGCCACGGCCAGCCGCCUGGUCACGCAGCGCGAUGCGGACGUGCAGAACUUCGUCAGCUUCAUCUCCAAAGACUCCAUCCAGAAGUCCCUGCAGAUGUACUUAGAGAGGCUCAAAGAAGAAAAAGGCUAACGAUUGGGCUGCCACAGGCUUACGGCCACACGUGCCCCUGUGGGUCCCAGGGAGGUCUUAAACAAGGUAUUUUUCAACUUAAAAGUACUGCCAGCGUUUCAUUUUGCUGAUGUUACGUAGAAGUUCCUGUUCCUCAUAGCCCAGUGGCCCAAGGCCCAGCCACACACAAACACACAUGGGUGCCUGUGCCCGUCAGGCAAGGGGAGUUGGAGGGCAGCCUUUUGACUUGGGAUUGUGACUGGCAGGGGAUGCCAUUCUGGACCUGGUGAGGUUGCCACGGAGUGUCUCUGUUCCCAAGGCAGAAUCGUAAGUCAAGUCCCUGGUCAUCCAUUCUGGCCUUUGGACUGCCUGCUCUUAGGUGUAAGGCCAGGUGGUCUUGGCCCCCAUGACCCACACAGAACUCCCCAGGGAAAAGCCCUUUGGUCACUGCCCUUACUCAUCAGGAUGAAGAGCGCACAGUGAAUCAGAGCAACUGGGGGAUCCUGAGCCAGCGGGAGUGGGACUCUGGAGGCAGCUGUGCUGCCAGGGAUCCAAAUGUCCCUUAAGAAGGAUUUUGCAAGAACCAAACUCAUCCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-667.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -689.52

Frequency: 0.0000

Diversity: 316.43

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((.((.(((((.((((...))))(((((.(((((......))))))))))((.(((((((.(((((.((((((((((.((...)).)).)))))))).)))))))))))).))(((((((.(.((((((.((((.(.(((.(((((..((((((....))))))....)))))))).))))).(((((..((.(((......))))).)))))(((((...(((.(((((((...((((((....)))))))))..)))).))).....)))))(((((((((...((....))..))))))))).(((.(((.....)))))))))))).).)))))))....((((((((....(((((((.((....)).))))).))((..(((.(((((((((((((((((.(((((.((((((((.(((((((......)))))))....(((((.......)))))(((((.((.((((.(((((((((((.((((..((((((.......(((.(((((.((....)))))))...)))...((.(((...))).)).....((((......))))(((((.....)))))......(((......)))..((((.((((((((.((((((.(((((......)))))))))))..)))))..)))..)))).)))))))))).......))))))))))))))).)).))))).((((....)))))))).)))).)))))))..))))))))).)))))))))..)).....(((((((.(((..(....((((...(((((.(((.....)))))))).))))(((((.......))))).)..))).))))))).(((((.((..((((.(.....).))))..)).)))))..(((.(((...))).)))........((((....((((((((((((((((..((((......))))..)))))))....((((((..(((..((((.(((((((((......)))))))))..(((((........))))).))))....)))..)))))).......)))))))))((((...)))).))))...((((..(((......)))..)))).))))))))...(((((((((((((.(((...(((((((((.((((.((.((((.((.(((.(.((((((((((((....)))))....))))))).)))).)).)).)).)).)))).)))))))))...))).)).)))...((((((((...((.(((((....)))))))))))))))((((((.(((...))).)).))))....)))))))).(((.....)))(((((((((((..(...(((.(((...))).))).)..))))).))))))))))))).))))(((.(((((.((....)).)).))).)))((((((...))))))((((((......))))))......((((((((.......))))...))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

...((((,...,))))....(((({,{{{({,(({(({,.,,,||||||}}}}((.(((((((.(((((.(((((((({{,((...,),)}.)))))))).)))))))))))).))(((((((.(.((((((.((((.(,(((.(((((..((((((....))))))....))))))))},)))).(((((..{{.(((......)))}}.)))))(((({,..(({.{||,{||}},(((((({..{||,|||||...})))}))).}}}}))),,(((((((((...((....))..))))))))).{((,(((.....)))))))))))).).)))))))((((.{{...(((((((.(((((.((....)).)))))...((..(((.(((((((((((((((((.(((((.((((((((.{{(((((,,,...})))})),,},{((((.......))))|(((((.((.((((.(((((((((((.{(((..{{(((((.{{,,,(((.(((((.((....)))))))...))).,.((.{((.,,}|}.}}.,{..((((......)))){{{{{,.,..))}}}.....,(((......))}..((((.(({(((((.((((((.(((((......)))))))))))..)))))..)))..)))),))})))))}),},}.,,))))))))))))))).)).))))),((((....)))))))).)))).)))))))..))))))))).)))))))))..)).....(((((((.(((..(....((((...(((((.(((.....)))))))).))))(((((.,.....))))).}..))).))))))).)))))))..}}..))))(((((,{(((((,{{....}},(((.(((...))).}}}......((((((..(..{((((...(((((((..((((......))))..)))))))..))))})..))))))......(((((((((......)))))))))..{,((({..{{{{..,..))))..)))).....|(((((({.((((...(((((({(({...}|||{{|,|...............})})}{((({.,.....}}))),.(((((((((((((.(((...(((((((((.((((.((.((((.{({(((.{.((((((((((((....)))))....)))))))})))),}}.)).,).)).)))).)))))))))...))).)).))),..((((((((...((.(((((....}))))})))))))))({((((.(((...))).))}}}}}....}))))))),(((.....))||((((((((((..(...(((.((,...))).))).)..)))))},))))}),.))))))......))))..)))))))),)))))))))))((((((...))))))((((((......))))))......||}|||}},,}))})),...,))))....