Basic Information
Symbol
EDN1
RNA class
mRNA
Alias
Endothelin 1
ET1
Preproendothelin-1
Endothelin-1
PPET1
ARCND3
HDLCQ7
QME
Location (GRCh38)
6:12287459-12297194
Forensic tag(s)
Other applications
MANE select
Transcript ID
NM_001955.5
Sequence length
2035.0 nt
GC content
0.4506
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-587.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-626.23 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
566.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AGACGCGCCUCUGCAUCUGCGCCAGGCGAACGGGUCCUGCGCCUCCUGC… | 2032 nt | 0.4503 | |
| AAUGGUAUGACUUUUUUUCUGGAGUCCCCUCUUCUGAUUCUUGAACUCC… | 1877 nt | 0.4358 | |
| ACUUCUCCACCUGAAGGCUGGGCGUUGCUGGAACCUGCAGGGGCAGCCU… | 1823 nt | 0.4361 | |
| AGGCAGCGCUGUGCUCAGGGGCCAUUUUGAACAGUGAAACCACCAACAA… | 2161 nt | 0.4345 | |
| AGACGCGCCUCUGCAUCUGCGCCAGGCGAACGGGUCCUGCGCCUCCUGC… | 2035 nt | 0.4506 |
Summary
This gene encodes a preproprotein that is proteolytically processed to generate a secreted peptide that belongs to the endothelin/sarafotoxin family. This peptide is a potent vasoconstrictor and its cognate receptors are therapeutic targets in the treatment of pulmonary arterial hypertension. Aberrant expression of this gene may promote tumorigenesis. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2015]
Forensic Context
A study in humans demonstrated that the EDN1 is a potent vasoconstrictor whose expression is upregulated in fibroblasts treated with the WNT pathway activator SKL2001, representing a pathological state [Zhao et al. DOI:10.1038/s41467-022-31950-9]. In a rat model of radiation-induced lung injury, the EDN1 was identified as an orthologous gene associated with inflammatory processes [Shi et al. DOI:10.17305/bb.2024.10357].