Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001168319.2

Sequence Length

2032 nt

GC Content

0.4503

AGACGCGCCUCUGCAUCUGCGCCAGGCGAACGGGUCCUGCGCCUCCUGCAGUCCCAGCUCUCCACCGCCGCGUGCGCCUGCAGACGCUCCGCUCGCUGCCUUCUCUCCUGGCAGGCGCUGCCUUUUCUCCCCGUUAAAAGGGCACUUGGGCUGAAGGAUCGCUUUGAGAUCUGAGGAACCCGCAGCGCUUUGAGGGACCUGAAGCUGUUUUUCUUCGUUUUCCUUUGGGUUCAGUUUGAACGGGAGGUUUUUGAUCCCUUUUUUUCAGAAUGGAUUAUUUGCUCAUGAUUUUCUCUCUGCUGUUUGUGGCUUGCCAAGGAGCUCCAGAAACAGUCUUAGGCGCUGAGCUCAGCGCGGUGGGUGAGAACGGCGGGGAGAAACCCACUCCCAGUCCACCCUGGCGGCUCCGCCGGUCCAAGCGCUGCUCCUGCUCGUCCCUGAUGGAUAAAGAGUGUGUCUACUUCUGCCACCUGGACAUCAUUUGGGUCAACACUCCCGAGCACGUUGUUCCGUAUGGACUUGGAAGCCCUAGGUCCAAGAGAGCCUUGGAGAAUUUACUUCCCACAAAGGCAACAGACCGUGAAAAUAGAUGCCAAUGUGCUAGCCAAAAAGACAAGAAGUGCUGGAAUUUUUGCCAAGCAGGAAAAGAACUCAGGGCUGAAGACAUUAUGGAGAAAGACUGGAAUAAUCAUAAGAAAGGAAAAGACUGUUCCAAGCUUGGGAAAAAGUGUAUUUAUCAGCAGUUAGUGAGAGGAAGAAAAAUCAGAAGAAGUUCAGAGGAACACCUAAGACAAACCAGGUCGGAGACCAUGAGAAACAGCGUCAAAUCAUCUUUUCAUGAUCCCAAGCUGAAAGGCAAGCCCUCCAGAGAGCGUUAUGUGACCCACAACCGAGCACAUUGGUGACAGACCUUCGGGGCCUGUCUGAAGCCAUAGCCUCCACGGAGAGCCCUGUGGCCGACUCUGCACUCUCCACCCUGGCUGGGAUCAGAGCAGGAGCAUCCUCUGCUGGUUCCUGACUGGCAAAGGACCAGCGUCCUCGUUCAAAACAUUCCAAGAAAGGUUAAGGAGUUCCCCCAACCAUCUUCACUGGCUUCCAUCAGUGGUAACUGCUUUGGUCUCUUCUUUCAUCUGGGGAUGACAAUGGACCUCUCAGCAGAAACACACAGUCACAUUCGAAUUCGGGUGGCAUCCUCCGGAGAGAGAGAGAGGAAGGAGAUUCCACACAGGGGUGGAGUUUCUGACGAAGGUCCUAAGGGAGUGUUUGUGUCUGACUCAGGCGCCUGGCACAUUUCAGGGAGAAACUCCAAAGUCCACACAAAGAUUUUCUAAGGAAUGCACAAAUUGAAAACACACUCAAAAGACAAACAUGCAAGUAAAGAAAAAAAAAAGAAAGACUUUUGUUUAAAUUUGUAAAAUGCAAAACUGAAUGAAACUGUUACUACCAUAAAUCAGGAUAUGUUUCAUGAAUAUGAGUCUACCUCACCUAUAUUGCACUCUGGCAGAAGUAUUUCCCACAUUUAAUUAUUGCCUCCCCAAACUCUUCCCACCCCUGCUGCCCCUUCCUCCAUCCCCCAUACUAAAUCCUAGCCUCGUAGAAGUCUGGUCUAAUGUGUCAGCAGUAGAUAUAAUAUUUUCAUGGUAAUCUACUAGCUCUGAUCCAUAAGAAAAAAAAGAUCAUUAAAUCAGGAGAUUCCCUGUCCUUGAUUUUUGGAGACACAAUGGUAUAGGGUUGUUUAUGAAAUAUAUUGAAAAGUAAGUGUUUGUUACGCUUUAAAGCAGUAAAAUUAUUUUCCUUUAUAUAACCGGCUAAUGAAAGAGGUUGGAUUGAAUUUUGAUGUACUUAUUUUUUUAUAGAUAUUUAUAUUCAAACAAUUUAUUCCUUAUAUUUACCAUGUUAAAUAUCUGUUUGGGCAGGCCAUAUUGGUCUAUGUAUUUUUAAAAUAUGUAUUUCUAAAUGAAAUUGAGAACAUGCUUUGUUUUGCCUGUCAAGGUAAUGACUUUAGAAAAUAAAUAUUUUUUUCCUUACUGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-585.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -623.97

Frequency: 0.0000

Diversity: 493.88

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((((.(((....)))..)))))...(((..(((((.....))))).))).((..(((...((((.(.((((((((((((((..(((((.((((((((.(((((((.(((.((((((((((...(((.......)))......((((..(((.((.(((.(((..(((.((...)).)))..))).))).)))))..))))((((((((((((((((((((((((((....((.(((((((((...((((((.((((....)))).))))))...))...((..((((((((((((((((...(((((((..((....))(((.....)))...((((((....)))))))))))))..))))))))))))))))..))))))).)).)).(((((.(((((((..((((((.(((..((..((((((((((.....))))...(((((((((((...........)))))).)))))(((........)))))))).)..))..))).))))))))).)))))))))((((((.....))))))............((((..((((.(..............).))))..))))((((((.............).)))))..(((((((...)))))))..))))))))))..)))))).....))))))))))(((((((.((..............)).)))))))(((((((((..((.(((........))).)).(((((((((.((.........((..((((....))))..)).........((((((...)))).))...............)).)))))))))..)))))))))))))))).)))))))))).))).....((((...))))(((((.....)))))(((((.(((...))).))))).(((((((.((((.....((((((...(((((......))))))))))).....))))(((((..((((((((((.((((.((((((((...)))))))).))))...)).)))).)))).....)))))((((..((((..((.....))..)))).))))...)))))))...((((....))))((((..(((((.(((((.((((((((((((..((....(((....)))....))..))).((((((....))))))..)))).))))))))))))))).))))((((((((((......))))))))))....))))))....)).)))))...)))))))...)))))))))))).........((((...))))((((((........))))))....)))..)).....((((........))))..........((((.((((.((((((((......((((((.(((((...((((((...)))))).....(((((((((((...............)))).)))))))))))).)))))).............(((......)))((((((((((.((((((((..(((.((((.(((((((......((.(((((.((((.....((((.....(((.(((.....(((......))).))).)))(((.(((.(((((((((((((....((((.....))))))))))).))..)))).))).)))....((((((((......((((......))))....)))))))))))).......))))))))).))...........(((((......((((((.....)))))).....)))))...(((((..((...........))..)))))..((((.(((((((...(((((((((..(((((......)))))..)))).))))))))))))..))))(((((((......)))))))..))))))).)))).)))......(((((((((...)))))))))....))))))....)).))).)))))))(((((((((....)))))).)))...............)))))))).))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

..,.,(((((.(((....||},.})))}...(((..(((({.....))))).))).{{..{{{...((((.(.((((((((((((((..(((((.(((((((({(({((((.(((.((((((((((...(((.......)))......((((..(((.((.(((.(((..(((.((...)).)))..))).))).)))))..))))((((((((((((((((((((((((((....,(.{{(((((((...((((((.((({....}))).))))))...))...,{..((((((((((((((((.,.(((((((..((,.{{,,.,....,,})},..((((((....))))))))))))).,))))))))))))))))..},))))).}).,,.,(((({(,,,.|}}}}|((({,((({{,(,..{((((((((.....))}}...||||{{((((,.,,,,{,||,.|||}||,{.,{{(((........)))))|||{|,{||,.|,|.|||||{{||..,,,)))))}|||,{...{{|||||,({{.....}))}||,,.}||||,|,...,,},......}}))))}.})))||||,.....,},},.,.})))))))}.{((((((...)))))))..))))))))))..)))))).....))))))))))(((((((.((..............)).)))))))(((((((((..((.(((........))).)).(((((((((.((.....,....,..{{((..,,|,,,.}}}..||,......((((...)))).||.........,}}...)).)))))))))..))))))))))))))))},)))))))))}))}.,...((((...)))}(((((.....)))))(((((.(({...))}.)))))....(((((((((((....}}),),.,})))))....,|,,,,..((((((((((..(((((((.((((((((((.((((.((((((((...)))))))).))))...)).)))).))))..........,(((..((((..((.....))..)))).)))}((((({......}))))),...,|.{{{{..(((({{(((((.((((((((((,{..{{....{{{....})}....},..))}.((((((....)))))).})))).))))))))))))))).}))),})))))))..)}}}}))))))...,.},.))))))....)).)))))...)))))))...))))))))))))........,((((...}})){(((((........}))))}....))).,||.....{(((........}}}}..........{({,,((((.((((({{,...{,,{,(((({(((({,..((((((...})))))..,,,|(((((({{{{.,,..........,}}|||.)))))}}|||||,{|{,,...})},.......||,.....|||||||||,||||.......,,,,|,|,|||{.{{{{{{{......{{.(((((.((((.....((((,....{{{.{{{.....{((,.....}}},))},)))(((.(((.(((((((((((((.,..({,....,}},},))))))).)),.}))).))).)))....,{{(((((....,.((((......)))),...))))))}))))).......))))))))).)),,,,,}}||||{{||{.,,,,,((((({...,,|||||,...}})}))),..,}}}}},.}..}},,,{(({,,{{..,,..}|.}}}|(((.((({{(((((((((..(((((......)))))..))))}})))}.}))))).))),,,{{{|{{,,..,,))}))}}..))))))).)))),|,,.}}},,|{{|{{{{|...}}}}})))}{{{||,,..},,,,.,,|||{|,,,,,)}|||(((((....)))))}.}}}}}}|}},,.,.....}))))))).))))))).