Basic Information

Symbol
EDNRA
RNA class
mRNA
Alias
Endothelin Receptor Type A HET-AR ETA-R ET-A Endothelin-1 Receptor ETRA ETA Endothelin-1-Specific Receptor Endothelin Receptor Subtype A G Protein-Coupled Receptor ETAR MFDA
Location (GRCh38)
4:147480917-147544954
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001957.4
Sequence length
3970.0 nt
GC content
0.4091

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1063.72 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1135.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 967.55
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001166055.2 NCBI
AGUCAUCCCGCUGGUCUGACGAUUGUGGAGAGGCGGUGGAGAGGCUUCA… 3643 nt 0.4019
NM_001957.4 NCBI
AGUCAUCCCGCUGGUCUGACGAUUGUGGAGAGGCGGUGGAGAGGCUUCA… 3970 nt 0.4091
Summary

This gene encodes the receptor for endothelin-1, a peptide that plays a role in potent and long-lasting vasoconstriction. This receptor associates with guanine-nucleotide-binding (G) proteins, and this coupling activates a phosphatidylinositol-calcium second messenger system. Polymorphisms in this gene have been linked to migraine headache resistance. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2009]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the EDNRA is highly expressed in pericytes of the corpus cavernosum and its expression is downregulated in patients with erectile dysfunction [Zhao et al. DOI:10.1038/s41467-022-31950-9]. In rats, a study of liver gene expression following burn injury found that the EDNRA was significantly altered in expression on day 7 post-injury [Jayaraman et al. DOI:10.1016/j.jss.2007.05.025].