Basic Information
Symbol
EEF1G
RNA class
mRNA
Alias
Eukaryotic Translation Elongation Factor 1 Gamma
EF1G
Elongation Factor 1-Gamma
EEF-1B Gamma
EF-1-Gamma
Translation Elongation Factor EEF-1 Gamma Chain
Pancreatic Tumor-Related Protein
PRO1608
GIG35
Location (GRCh38)
11:62559595-62574086
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
MANE select
Transcript ID
NM_001404.5
Sequence length
1446.0 nt
GC content
0.5450
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-518.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-545.01 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
370.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| ACUUUGCGGCAGCGCCGAGAACCCCACCCCCUUUCUUUGCGGAAUCACC… | 1446 nt | 0.5450 |
Summary
This gene encodes a subunit of the elongation factor-1 complex, which is responsible for the enzymatic delivery of aminoacyl tRNAs to the ribosome. This subunit contains an N-terminal glutathione transferase domain, which may be involved in regulating the assembly of multisubunit complexes containing this elongation factor and aminoacyl-tRNA synthetases. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A study in rats demonstrated that the EEF1G (Eukaryotic translation elongation factor 1 gamma) was identified as a potential regulator of methamphetamine reward and addiction through transcriptome profiling of whisker follicles, showing a down-down regulated expression pattern (0.77 at MASA, 0.33 at WD) and a betweenness centrality score of 0.0197 [Song et al. DOI:10.1038/s41598-018-29772-1].