Basic Information

Symbol
EGLN2
RNA class
mRNA
Alias
Egl-9 Family Hypoxia Inducible Factor 2 PHD1 HIFPH1 Prolyl Hydroxylase Domain-Containing Protein 1 Hypoxia-Inducible Factor Prolyl Hydroxylase 1 Prolyl Hydroxylase EGLN2 HIF-Prolyl Hydroxylase 1 Estrogen-Induced Tag 6 Egl Nine Homolog 2 HIF-PH1 EIT-6 HPH-1 HPH-3 EIT6 Egl Nine Homolog 2 (C. Elegans) HIF Prolyl Hydroxylase 1 EC 1.14.11.29 EC 1.14.11.- EC 1.14.11
Location (GRCh38)
19:40798996-40808444
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_080732.4
Sequence length
2100.0 nt
GC content
0.6376

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-972.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1002.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 523.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_053046.4 NCBI
CCUUAGGCCCUGCCCCUGUCGCCUACUGCGCUCAGAAGGGGCCUCAGGG… 2145 nt 0.6368
NM_080732.4 NCBI
GGGGUAUGGCGCGCUGUGCGGCGCAGGGCGGCUGGCACAAACGGCGGCG… 2100 nt 0.6376
Summary

The hypoxia inducible factor (HIF) is a transcriptional complex that is involved in oxygen homeostasis. At normal oxygen levels, the alpha subunit of HIF is targeted for degration by prolyl hydroxylation. This gene encodes an enzyme responsible for this post-translational modification. Alternative splicing results in multiple transcript variants. Read-through transcription also exists between this gene and the upstream RAB4B (RAB4B, member RAS oncogene family) gene. [provided by RefSeq, Feb 2011]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.