Basic Information

Symbol
EGLN3
RNA class
mRNA
Alias
Egl-9 Family Hypoxia Inducible Factor 3 PHD3 HIFPH3 Prolyl Hydroxylase Domain-Containing Protein 3 Hypoxia-Inducible Factor Prolyl Hydroxylase 3 Prolyl Hydroxylase EGLN3 HIF-Prolyl Hydroxylase 3 HIF-PH3 HPH-1 HPH-3 Egl Nine Homolog 3 (C. Elegans) HIF Prolyl Hydroxylase 3 Egl Nine Homolog 3 EC 1.14.11.29 EC 1.14.11.- EC 1.14.11 HIFP4H3
Location (GRCh38)
14:33924227-34462774
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022073.4
Sequence length
2706.0 nt
GC content
0.4634

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-834.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -887.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 716.11
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001308103.2 NCBI
CUGGCCGCAGUCGCGGCAGUGGUGGCUUCCCAUCCCCAAAAGGCGCCCU… 2424 nt 0.4385
NM_022073.4 NCBI
CUGGCCGCAGUCGCGGCAGUGGUGGCUUCCCAUCCCCAAAAGGCGCCCU… 2706 nt 0.4634
Summary

Enables peptidyl-proline 4-dioxygenase activity. Involved in protein hydroxylation. Located in cytosol and nucleus. Implicated in renal cell carcinoma. Biomarker of clear cell renal cell carcinoma. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that acute alcohol exposure during neurulation induces rapid transcriptomic changes in the rostroventral neural tube, with EGLN3 being significantly up-regulated (+0.87 Log2FC) 2 hours post-exposure, indicating its role in the DNA damage and hypoxia response pathways associated with developmental disruption [Boschen et al. DOI:10.1016/J.Alcohol.2022.09.001].