Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_022073.4

Sequence Length

2706 nt

GC Content

0.4634

CUGGCCGCAGUCGCGGCAGUGGUGGCUUCCCAUCCCCAAAAGGCGCCCUCCGACUCCUUGCGCCGCACUGCUCGCCGGGCCAGUCCGGAAACGGGUCGUGGAGCUCCGCACCACUCCCGCUGGUUCCCGAAGGCAGAUCCCUUCUCCCGAGAGUUGCGAGAAACUUUCCCUUGUCCCCGACGCUGCAGCGGCUCGGGUACCGUGGCAGCCGCAGGUUUCUGAACCCCGGGCCACGCUCCCCGCGCCUCGGCUUCGCGCUCGUGUAGAUCGUUCCCUCUCUGGUUGCACGCUGGGGAUCCCGGACCUCGAUUCUGCGGGCGAGAUGCCCCUGGGACACAUCAUGAGGCUGGACCUGGAGAAAAUUGCCCUGGAGUACAUCGUGCCCUGUCUGCACGAGGUGGGCUUCUGCUACCUGGACAACUUCCUGGGCGAGGUGGUGGGCGACUGCGUCCUGGAGCGCGUCAAGCAGCUGCACUGCACCGGGGCCCUGCGGGACGGCCAGCUGGCGGGGCCGCGCGCCGGCGUCUCCAAGCGACACCUGCGGGGCGACCAGAUCACGUGGAUCGGGGGCAACGAGGAGGGCUGCGAGGCCAUCAGCUUCCUCCUGUCCCUCAUCGACAGGCUGGUCCUCUACUGCGGGAGCCGGCUGGGCAAAUACUACGUCAAGGAGAGGUCUAAGGCAAUGGUGGCUUGCUAUCCGGGAAAUGGAACAGGUUAUGUUCGCCACGUGGACAACCCCAACGGUGAUGGUCGCUGCAUCACCUGCAUCUACUAUCUGAACAAGAAUUGGGAUGCCAAGCUACAUGGUGGGAUCCUGCGGAUAUUUCCAGAGGGGAAAUCAUUCAUAGCAGAUGUGGAGCCCAUUUUUGACAGACUCCUGUUCUUCUGGUCAGAUCGUAGGAACCCACACGAAGUGCAGCCCUCUUACGCAACCAGAUAUGCUAUGACUGUCUGGUACUUUGAUGCUGAAGAAAGGGCAGAAGCCAAAAAGAAAUUCAGGAAUUUAACUAGGAAAACUGAAUCUGCCCUCACUGAAGACUGACCGUGCUCUGAAAUCUGCUGGCCUUGUUCAUUUUAGUAACGGUUCCUGAAUUCUCUUAAAUUCUUUGAGAUCCAAAGAUGGCCUCUUCAGUGACAACAAUCUCCCUGCUACUUCUUGCAUCCUUCACAUCCCUGUCUUGUGUGUGGUACUUCAUGUUUUCUUGCCAAGACUGUGUUGAUCUUCAGAUACUCUCUUUGCCAGAUGAAGUUACUUGCUAACUCCAGAAAUUCCUGCAGACAUCCUACUCGGCCAGCGGUUUACCUGAUAGAUUCGGUAAUACUAUCAAGAGAAGAGCCUAGGAGCACAGCGAGGGAAUGAACCUUACUUGCACUUUAUGUAUACUUCCUGAUUUGAAAGGAGGAGGUUUGAAAAGAAAAAAAUGGAGGUGGUAGAUGCCACAGAGAGGCAUCACGGAAGCCUUAACAGCAGGAAACAGAGAAAUUUGUGUCAUCUGAACAAUUUCCAGAUGUUCUUAAUCCAGGGCUGUUGGGGUUUCUGGAGAAUUAUCACAACCUAAUGACAUUAAUACCUCUAGAAAGGGCUGCUGUCAUAGUGAACAAUUUAUAAGUGUCCCAUGGGGCAGACACUCCUUUUUUCCCAGUCCUGCAACCUGGAUUUUCUGCCUCAGCCCCAUUUUGCUGAAAAUAAUGACUUUCUGAAUAAAGAUGGCAACACAAUUUUUUCUCCAUUUUCAGUUCUUACCUGGGAACCUAAUUCCCCAGAAGCUAAAAAACUAGACAUUAGUUGUUUUGGUUGCUUUGUUGGAAUGGAAUUUAAAUUUAAAUGAAAGGAAAAAUAUAUCCCUGGUAGUUUUGUGUUAACCACUGAUAACUGUGGAAAGAGCUAGGUCUACUGAUAUACAAUAAACAUGUGUGCAUCUUGAACAAUUUGAGAGGGGAGGUGGAGUUGGAAAUGUGGGUGUUCCUGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUAGUUUUCCUUUUUAAUGAGCUCACCCUUUAACACAAAAAAAGCAAGGUGAUGUAUUUUAAAAAAGGAAGUGGAAAUAAAAAAAUCUCAAAGCUAUUUGAGUUCUCGUCUGUCCCUAGCAGUCUUUCUUCAGCUCACUUGGCUCUCUAGAUCCACUGUGGUUGGCAGUAUGACCAGAAUCAUGGAAUUUGCUAGAACUGUGGAAGCUUCUACUCCUGCAGUAAGCACAGAUCGCACUGCCUCAAUAACUUGGUAUUGAGCACGUAUUUUGCAAAAGCUACUUUUCCUAGUUUUCAGUAUUACUUUCAUGUUUUAAAAAUCCCUUUAAUUUCUUGCUUGAAAAUCCCAUGAACAUUAAAGAGCCAGAAAUAUUUUCCUUUGUUAUGUACGGAUAUAUAUAUAUAUAGUCUUCCAAGAUAGAAGUUUACUUUUUCCUCUUCUGGUUUUGGAAAAUUUCCAGAUAAGACAUGUCACCAUUAAUUCUCAACGACUGCUCUAUUUUGUUGUACGGUAAUAGUUAUCACCUUCUAAAUUACUAUGUAAUUUAUUCACUUAUUAUGUUUAUUGUCUUGUAUCCUUUCUCUGGAGUGUAAGCACAAUGAAGACAGGAAUUUUGUAUAUUUUUAACCAAUGCAACAUACUCUCAGCACCUAAAAUAGUGCCGGGAACAUAGUAAGGGCUCAGUAAAUACUUGUUGAAUAAACUCAGUCUCCUACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-834.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -887.87

Frequency: 0.0000

Diversity: 716.11

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((....)))))...(((((....))))).......(((((.(((((((.(....((((.(((((((((((((((((((..(((....(((.((((....)))))))..))).)))))..))))..((((((.(((.......(((((((......)))))))((..(((((((.((.(((((((((.((((...((((((..(((..((((....)))).)))))))))...)))).))).(((((.(((....))).)).)))...........)))))))).)))))))...))((((((.....(((((((.((((.(((.(((.((..((.(.(((.....))).).))....))))).)).)..)))).))))).)).....)))))))))..)))))).((.(((.....))).)))))).))))))))))...).)))..)))).))))).....((((((((....((.((((((((.((.(.....))).)))))))).)).((((((.(((((....(((.(((((((((.((((((.((..((.(((.(((((((..(((((((.(((.........)))))))))).))))))).))).)).))))))))))))...))))).(((.....))).........)))..))))).)))...)))....((((((((...((((.....))))...(((..(((((((...)))))))))).....(((((((.......))))))).((((((....(((.....)))....))))))))))))))...(((((.((((((((......(((((((((((....)))....((((.((((...)))).))))((((....)))))))))))).....)))))))).)))))....)))))))).(((((((...((((((((.(......))))))))).....((((.(((((..((((((((.............(((((.................)))))))))))))(((((((((..((((((...(((((((..((.......))..)))))))..)))))).................((((((.....)))))).....))))))))).............(((........)))..)))))))))((((((((...((((..((((((.....(((.((.((((..(((((........)))))..)))).)).)))))))))..(((((..((((((((......((((((((((((((((..((...((((((((.((.....))))))).))).....).)..)))..)))))(((.((.((((.......)))).))))).((((...((.(((((((...........))))))).)).))))........((((((((((((((((.......)))))).((((((((((((((((.(((....(((((........((((((.........)))))))))))..)))...))))))))))))))))((((((((..........((((((......(((......))).....)))))).((((.((......(((((.....(((((((((...(((......................)))...)))))))))....))))).(((((((((...((((.(((......))).)).............))...)))))))))(((((.(((((((((..(((((...(((((.....(((((((((.....)).))))))))))))...))))))).(((((....))))).((((((((...((((..(((((..(((.(((((....(((((.(((((.(((((((((((((..((((.((((.((((...(((.(.(.(.(((((((...)))))))).).).)))..))))...)))).))))..)))..........(((((((.((((((..((((((((((((...(((((((((((.........))))...))))).))...)).)))))))))))))))).))))))).((((((....))))))...(((((((((....(((((...(((..((((.....))))....)))...)))))....))))).))))(((......)))....((((...(((((((.((......)).))))))).))))((((..((..(((.((((((......))))))))).))..))))....)))).)))))).))))).))))).....(((((.((.......................)).)))))........))))).)))..)))))..))))))))))))..((((((......)))))).........((((((((((((((.............))))).)))))))))..))))))).)))))..))))))...)))))))).(((((...........)))))...........))))))))))((((((((...))))))))..................)))).)))).......)))))))))))))))))...))))))))....((((((...........)))))).....((((.((((........)))).)))).....))))))).(((((((....))))))).......))).........

Thermodynamic Ensemble Prediction

,,{(((((....))))).({(((((,..,|||,,.......(({((,{{(({,(,{,,,{(({{,{{{(((((,(((({{{{{|{|||,..,{((,.((((.{{.,,)),))}).))}|{{{{{{{{{(.,((,({,.,||||||,,.(((((((......)))))))...,{{(((((.,(({(({({(((.((((.,.((((((..(((..((((....)))).))))))))).,.)))).)))..,(({,{{({{((|{{{{({{{{,{{({{{(({(({,,,.,)}}))))),.{{|||{{{{||||||||(((({.|,||}}|{.|||},,..||.,,|||}}}}.))},).)}...,|||||.||{|,.,,||{|||,,.....)))))||||{{{{....}))}})},,...,,,})).)))))))))))}))))),},}})}}..})))})))},.,||,|}}}}}}}))..||,|(((((((,((.,.....|||,|||}|}}}.)},||||||{{{.,,..,,}}}.|||||||||,((((((.{{..((.(((.(((((((..((((({{{(((.,.......)))))))))).))))))).))).)).)))))))),}}..}}}))))})))))),))),.....,..}},,.|||||{,|||...}}|....((((((((...((((.....))))...(({..{((((((...)))))))}}}.....(((((((.......))))))).((((((....(((.....)))....))))))))))))))..,(((((.((((((((,{....((((((((({,....|||....((((.((((...)))).))))((((....))))))))))))....})))))))).))))).,..|,||,((((((.,(((...((((((((.,......,)))))))).....((((.(((((..{(((((((.............(((((...{{{......}}...))))))))))))|(((((((((..((((((...(((((((..((.......))..)))))))..)))))).........{{,,{,...,||||}}}.{||,,,.,}}..))))))))),............(((........)))..)))))))))((((((((...((((..((((((.....(((.((.((((..(((((........)))))..)))).)).)))))))))..|((((..((((((((.,....((((((({(((((,,,{{(,...{,{(({({,((,,,..}}}}}))..)},}},.,.}..),)}})))))(((.((.((((.......)))).))))).{{,,...,,.,((((((........}}})))}})).},.,,,}........((((((((((((((((.......)))))).((((((((((((((((.(((.,,{(({,,.,,,,,..((((((,......,.))))))}}}},..)))...))))))))))))))))((((((((,,........{(((((.,,...(((......))),.}|.)))))),|||{,,,......{((((.....(((((((((...{{{.........,,,,,........))),,.))))))))),...}}}},.(((((((((...({,,.,{{,,...,|||{|}.....,..,,,.,}}.,.)))))))))(((((.(((((({.{..{((((.,,(((((,,,,,(((((({{,.,,,,)}))))))))}))))...))))))).{{{{{....}}}}}.(((((((({.,(({(..(((((..(((.(((({....(((((.(((((.((((((((((,{({,,,{{|||{{.({,,...,,||||{{{,((({{,....,}}}||||{|.|{|||,{{|||{{,|,,|{{|....))),.........{((((((.((((({..{(((((((((((...(((((((((((.........))))...))))).))...))})))))))))}}))))).))))))}.((((((....)))))).....(.((((,....}))}.}..,,|,}|||}}}},},,))}}},})}|{{||,||..{{|||||.||},(((......)))...,||||},.||{||||},(,,,,,.}}.},}}))}.))),,|||,.||}}(({{((((((......))))))))}.}}..,,}),...)))).)))))),))))).)))))......,{((,(,.,{{{{......,}},,{{{{.....,))))....,,,,))))).)))..)))))..)))))))))))),,{{{{{{.,,,{{|||,,..}}}},,,,((((((((((((((.............))))),}))))))))..})))))).)))))..,},,,....)))))))).{({{{,{,..,,,...}},)),,}},,...,,))))))))))((((((((...))))))))...,,.......,,....)))),,)))....,}.)))))))))))))))))...))))))))....((((((...........)))))).....((((.((((........)))).)))).....)))))))))}},|.....,},||{,,...,,,,})}}}}}}}...