Basic Information

Symbol
EGR1
RNA class
mRNA
Alias
Early Growth Response 1 NGFI-A AT225 Nerve Growth Factor-Induced Protein A Early Growth Response Protein 1 Transcription Factor ETR103 KROX-24 ZIF-268 ZIF268 G0S30 TIS8 Transcription Factor Zif268 Zinc Finger Protein Krox-24 Zinc Finger Protein 225 Zinc Finger Gene 225 ZNF225 EGR-1 225 KROX24
Location (GRCh38)
5:138465479-138469303
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses Chronological age estimation Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001964.3
Sequence length
3137.0 nt
GC content
0.5531

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1037.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1091.05 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 821.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001964.3 NCBI
GAGAGAUCCCAGCGCGCAGAACUUGGGGAGCCGCCGCCGCCAUCCGCCG… 3137 nt 0.5531
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the EGR family of C2H2-type zinc-finger proteins. It is a nuclear protein and functions as a transcriptional regulator. The products of target genes it activates are required for differentitation and mitogenesis. Studies suggest this is a cancer suppressor gene. [provided by RefSeq, Dec 2014]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the EGR1 is downregulated in the dorsolateral prefrontal cortex of individuals with Opioid Use Disorder, where it regulates angiogenesis via modulation of pro-angiogenic FGF2 signaling [Mendez et al. DOI:10.1038/s41380-021-01259-y]. Separately, research in human peripheral blood identified the EGR1 as a differentially expressed gene exhibiting a consistent expression trend from young adulthood to later life, and it was incorporated into a validated age prediction model using machine learning algorithms [Liao et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2025.103373]. A study in humans demonstrated that the EGR1 was significantly upregulated in pericontusional brain tissue from patients free of alcohol following traumatic brain injury [Michael et al. DOI:10.1016/j.jocn.2004.11.003].