Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001964.3
Sequence Length
3137 nt
GC Content
0.5531
GAGAGAUCCCAGCGCGCAGAACUUGGGGAGCCGCCGCCGCCAUCCGCCGCCGCAGCCAGCUUCCGCCGCCGCAGGACCGGCCCCUGCCCCAGCCUCCGCAGCCGCGGCGCGUCCACGCCCGCCCGCGCCCAGGGCGAGUCGGGGUCGCCGCCUGCACGCUUCUCAGUGUUCCCCGCGCCCCGCAUGUAACCCGGCCAGGCCCCCGCAACUGUGUCCCCUGCAGCUCCAGCCCCGGGCUGCACCCCCCCGCCCCGACACCAGCUCUCCAGCCUGCUCGUCCAGGAUGGCCGCGGCCAAGGCCGAGAUGCAGCUGAUGUCCCCGCUGCAGAUCUCUGACCCGUUCGGAUCCUUUCCUCACUCGCCCACCAUGGACAACUACCCUAAGCUGGAGGAGAUGAUGCUGCUGAGCAACGGGGCUCCCCAGUUCCUCGGCGCCGCCGGGGCCCCAGAGGGCAGCGGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCGGGGGCGGUGGAGGCGGCGGGGGCGGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCACCUUCAACCCUCAGGCGGACACGGGCGAGCAGCCCUACGAGCACCUGACCGCAGAGUCUUUUCCUGACAUCUCUCUGAACAACGAGAAGGUGCUGGUGGAGACCAGUUACCCCAGCCAAACCACUCGACUGCCCCCCAUCACCUAUACUGGCCGCUUUUCCCUGGAGCCUGCACCCAACAGUGGCAACACCUUGUGGCCCGAGCCCCUCUUCAGCUUGGUCAGUGGCCUAGUGAGCAUGACCAACCCACCGGCCUCCUCGUCCUCAGCACCAUCUCCAGCGGCCUCCUCCGCCUCCGCCUCCCAGAGCCCACCCCUGAGCUGCGCAGUGCCAUCCAACGACAGCAGUCCCAUUUACUCAGCGGCACCCACCUUCCCCACGCCGAACACUGACAUUUUCCCUGAGCCACAAAGCCAGGCCUUCCCGGGCUCGGCAGGGACAGCGCUCCAGUACCCGCCUCCUGCCUACCCUGCCGCCAAGGGUGGCUUCCAGGUUCCCAUGAUCCCCGACUACCUGUUUCCACAGCAGCAGGGGGAUCUGGGCCUGGGCACCCCAGACCAGAAGCCCUUCCAGGGCCUGGAGAGCCGCACCCAGCAGCCUUCGCUAACCCCUCUGUCUACUAUUAAGGCCUUUGCCACUCAGUCGGGCUCCCAGGACCUGAAGGCCCUCAAUACCAGCUACCAGUCCCAGCUCAUCAAACCCAGCCGCAUGCGCAAGUACCCCAACCGGCCCAGCAAGACGCCCCCCCACGAACGCCCUUACGCUUGCCCAGUGGAGUCCUGUGAUCGCCGCUUCUCCCGCUCCGACGAGCUCACCCGCCACAUCCGCAUCCACACAGGCCAGAAGCCCUUCCAGUGCCGCAUCUGCAUGCGCAACUUCAGCCGCAGCGACCACCUCACCACCCACAUCCGCACCCACACAGGCGAAAAGCCCUUCGCCUGCGACAUCUGUGGAAGAAAGUUUGCCAGGAGCGAUGAACGCAAGAGGCAUACCAAGAUCCACUUGCGGCAGAAGGACAAGAAAGCAGACAAAAGUGUUGUGGCCUCUUCGGCCACCUCCUCUCUCUCUUCCUACCCGUCCCCGGUUGCUACCUCUUACCCGUCCCCGGUUACUACCUCUUAUCCAUCCCCGGCCACCACCUCAUACCCAUCCCCUGUGCCCACCUCCUUCUCCUCUCCCGGCUCCUCGACCUACCCAUCCCCUGUGCACAGUGGCUUCCCCUCCCCGUCGGUGGCCACCACGUACUCCUCUGUUCCCCCUGCUUUCCCGGCCCAGGUCAGCAGCUUCCCUUCCUCAGCUGUCACCAACUCCUUCAGCGCCUCCACAGGGCUUUCGGACAUGACAGCAACCUUUUCUCCCAGGACAAUUGAAAUUUGCUAAAGGGAAAGGGGAAAGAAAGGGAAAAGGGAGAAAAAGAAACACAAGAGACUUAAAGGACAGGAGGAGGAGAUGGCCAUAGGAGAGGAGGGUUCCUCUUAGGUCAGAUGGAGGUUCUCAGAGCCAAGUCCUCCCUCUCUACUGGAGUGGAAGGUCUAUUGGCCAACAAUCCUUUCUGCCCACUUCCCCUUCCCCAAUUACUAUUCCCUUUGACUUCAGCUGCCUGAAACAGCCAUGUCCAAGUUCUUCACCUCUAUCCAAAGAACUUGAUUUGCAUGGAUUUUGGAUAAAUCAUUUCAGUAUCAUCUCCAUCAUAUGCCUGACCCCUUGCUCCCUUCAAUGCUAGAAAAUCGAGUUGGCAAAAUGGGGUUUGGGCCCCUCAGAGCCCUGCCCUGCACCCUUGUACAGUGUCUGUGCCAUGGAUUUCGUUUUUCUUGGGGUACUCUUGAUGUGAAGAUAAUUUGCAUAUUCUAUUGUAUUAUUUGGAGUUAGGUCCUCACUUGGGGGAAAAAAAAAAAAGAAAAGCCAAGCAAACCAAUGGUGAUCCUCUAUUUUGUGAUGAUGCUGUGACAAUAAGUUUGAACCUUUUUUUUUGAAACAGCAGUCCCAGUAUUCUCAGAGCAUGUGUCAGAGUGUUGUUCCGUUAACCUUUUUGUAAAUACUGCUUGACCGUACUCUCACAUGUGGCAAAAUAUGGUUUGGUUUUUCUUUUUUUUUUUUUUUGAAAGUGUUUUUUCUUCGUCCUUUUGGUUUAAAAAGUUUCACGUCUUGGUGCCUUUUGUGUGAUGCGCCUUGCUGAUGGCUUGACAUGUGCAAUUGUGAGGGACAUGCUCACCUCUAGCCUUAAGGGGGGCAGGGAGUGAUGAUUUGGGGGAGGCUUUGGGAGCAAAAUAAGGAAGAGGGCUGAGCUGAGCUUCGGUUCUCCAGAAUGUAAGAAAACAAAAUCUAAAACAAAAUCUGAACUCUCAAAAGUCUAUUUUUUUAACUGAAAAUGUAAAUUUAUAAAUAUAUUCAGGAGUUGGAAUGUUGUAGUUACCUACUGAGUAGGCGGCGAUUUUUGUAUGUUAUGAACAUGCAGUUCAUUAUUUUGUGGUUCUAUUUUACUUUGUACUUGUGUUUGCUUAAACAAAGUGACUGUUUGGCUUAUAAACACAUUGAAUGCGCUUUAUUGCCCAUGGGAUAUGUGGUGUAUAUCCUUCCAAAAAAUUAAAACGAAAAUAAAGUA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1037.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1091.05
Frequency: 0.0000
Diversity: 821.97
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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