Basic Information

Symbol
EIF4A1
RNA class
mRNA
Alias
Eukaryotic Translation Initiation Factor 4A1 DDX2A EIF-4A EIF4A ATP-Dependent RNA Helicase EIF4A-1 Eukaryotic Initiation Factor 4A-I EIF-4A-I EIF4A-I Eukaryotic Translation Initiation Factor 4A, Isoform 1 Eukaryotic Translation Initiation Factor 4A Eukaryotic Initiation Factor 4AI EC 3.6.4.13 EC 3.6.1
Location (GRCh38)
17:7572760-7579006
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001416.4
Sequence length
1758.0 nt
GC content
0.4966

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-578.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -608.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 537.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001204510.2 NCBI
CCUAGUUUCUAAGGAUCAUGUCUGCGAGCCAGGAUUCCCGAUCCAGAGA… 1696 nt 0.4971
NM_001416.4 NCBI
CCUAGUUUCUAAGGAUCAUGUCUGCGAGCCAGGAUUCCCGAUCCAGAGA… 1758 nt 0.4966
Summary

Enables double-stranded RNA binding activity and translation initiation factor activity. Involved in cytoplasmic translational initiation and positive regulation of transcription by RNA polymerase II. Located in nuclear stress granule; perinuclear region of cytoplasm; and plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025] CIViC Summary for EIF4A1 Gene

Forensic Context

A study in rhesus macaques demonstrated that the EIF4A1 was significantly upregulated in left ventricular tissue from animals with hypertrophic cardiomyopathy compared to healthy controls, identified as a differentially expressed gene through RNA-Seq analysis [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].