Basic Information

Symbol
ELAVL4
RNA class
mRNA
Alias
ELAV Like RNA Binding Protein 4 PNEM HUD ELAV (Embryonic Lethal, Abnormal Vision, Drosophila)-Like 4 (Hu Antigen D) ELAV Like Neuron-Specific RNA Binding Protein 4 Paraneoplastic Encephalomyelitis Antigen HuD ELAV-Like Protein 4 Hu Antigen D ELAV (Embryonic Lethal, Abnormal Vision, Drosophila)-Like 4 Hu-Antigen D HuD
Location (GRCh38)
1:50024029-50203772
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden death from CNS diseases
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001144774.3
Sequence length
3965.0 nt
GC content
0.3695

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-963.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1045.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1117.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((..((((..((.(((((....(((((((...(((((((((((((..((((((...........)))))).))))..............((((((((((.((.((((.........(((((........))))).......((((((((((..........(((((((((....((((((............(((((((((........((((((.........(((((....)))))............))))))......(((((((((((((.....(((((.(((....)))))))).....(((((...................)))))..................(((((..((((((.((....)).))).......))).))))).............))))).))))))))....)))))))))....((((((((((((((((((((((((((.(((..(((........))).)))...)))).)))))))........(((.((((((((.(((((((((((.((.......)).)))))...(((..(.(((....((((...........)))).))).)..)))(((((...........)))))...))))))....)))))))))))..(((((((((((((((......))))))((.....)).....(((..((((.((((....((((.(((((((..(((.(((.((((((((((((.(((((((..(((((..((((...))))))))).)))...))))))))((.(((.((.((((((((......)))))))).)).))).))......(((.((..((((...((((...((((((.(.((....))).))))))...)))))))).)).))).(((.....((((((((.(((((((.......((((..............(((((......)).)))..............))))))).))))..)))))))).....)))..))))))))))).)))...)))))))))))........((((.....)))).....)))).)))).)))...)))))))))..((..((((.((((.((.(((...(((....)))..))))))))).))))..))...(.((((.((.(((.((..((((.....((((((((.((((..((......))..)))))).))))))..))))..))))).)))))).)((((((((...((((......)))).(((((((((..........))).)))))).(((((...)))))((((((............))))))..........))))))))......))))))))))....)))))..))))))...)))))))))............))))))))))..............(((((....((((((((((((((......))))..((((((((((((....))))...))))))))........((((((((((.((.(((......(((((.(.....))))))...))).)).))))))))))..............................(((((((....((((......))))..((((((..(((............)))..))))))..((((..(((.((((((((...(((....(((((.((((((((...)))))))).(((((((.((((((........)))))).))))))).......................(((((((......))))))).)))))..)))(((...((((((((((((.....)))))))))))))))........((((......)))))))))))).)))..)))).)))))))(((((.((((((((((((((((............))))))))...)))))))).))))))))))))))).....)))))......(((((....))))).))))..))))))..))))))...((((((((..((((((((((((...))))).)))))))......((.(.(((((((((((.....(((((((....((((((...((((((((...))))))))))))))......((((((((.(((((((.....((((((((((((((((...(((..(((..(((((....)))))..)))...)))...)))).......)))...)))))))))...)))))))))))))))...((((((..............(((((.((.(((((.......))))).)).)))))..((((((((((((.......))))))).)))))..((((((.(..((((((..........))))))..)..)))))))))))).)))))))..))))))))))).).))((((((...)))))).....))))))))...))))))).)).))))))).........(((((((........))))))).(((((.....)))))...(((((((.((((((((...((((.....(((((((.......(((((.(((((((((((................))))))).)))))))))....))))))).......))))....)))))))))).)))))))))).))..)))).)))))).(((((...((((((((((((((((.((((....(((((((((.(((.((.((.((((((((((((..(((((((((......((((((((((((((((......((.((((((.((...(((..(((((((.(((((((.((((((..((.((((.(((.(((((((((((((.........))))))))))))).(((((((((((((.((...(((((((...)))))))...))(((((((.(((((((((......((((..(((((((.......)))))))..((((((((.......(((((((((......((.....))....)))))))))))))))))....(((((......(((((((.(((....)))))))))).....))))).((((...(((......)))))))))))......)))))))))..))))))))))).)))))))))..(((((....))))).(((.(((.((((.((.(((......))))).)))).))).)))(((.((....)).)))....))).)))).))..)))))).)))..)))))))))))..)))...)))))))).))....))).)).)))))))))))...(((....(((((((((((...(((((.(((................))).)))))...)))...))))))))...)))(((((((....))))))).(((((.......)))))((((((((((((((...((((((((.(((..((((((.((..((((((.((((.((((((((((((..(((((..(((.(((((((..((.....)).))))))).)))))))).)))...(((((....................)))))...........)))))))))..)))).))))))))........((((...))))...((((((.(((.((((((............)).))))..)))..))))))..))))))(((((((((......)).))))))).)))))))))))...))))))........(((((((..((.......))..)))))))........)))))))).))))).)).))))))).)))).))).)).)).)))))))))))).)))).))....((((..((((.....))))..))))(((.((((..(((...((..(((...((((((...))))))...)))..))...)))..)).)).))).))).))))))...)))))...)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((...........)))))...........{({..((((((({((......|||({{..(((((..(((.((((....((((((((((((...(((((({((((((((..,.........||{,({({,....,,,,(((((((........)))))))...,,,,{(({((({.....,{,....,,,....,}}}}}},{{{{|{{,....|,,,||,,...,,},{((((....))))}{{({{{.....,|||,||{{.......}))),,,}}}},||.(((((.(({....})))))))....,(({{{,....,.......,},,.|||||,(((({{.....,{({...}))|{{{((({((.((....}}||}|........(((((..............}}))){{{{.,(((((...,,.|}}}}}|}|{{..({{,,.,||.||.|||||||||||.{,|,|{({||..,.,..||{|{|....{((({|||||,........{((.((((((({.(((((((((((.({.......},.))))),..(((.,(.(((....((({...........}))).))).}..)))(((((...........)))))...})))))....}))))))))))......((({(((((((......))))))).,,,)))).......||..{{||,,,,..)))),},,...,}))))))}|,,,.},.}}}},,||,,|||,||,.|{|||,,|{{{...))}})})))},))},,}.))))))))....{{(({..{(((.{((((((..(((((((((((({.....(((((((((...(((.....)))))))(({.{,...|.}}|(((((((({((((((((((.........,(({.{..{,,,,{,..|}}.,||{{.....})}.....((((((........((((((((((({(.((.(((.((((.((((((((.(((...((..(((,,{({{,(({..{{{,{({...))))))}))))))).}})}}....))).))),,{......,.})))).))))))))).}}...((((......))))..))))))))))).....((((((({..,{((({{{{{...{{{..{(({(((((,...))}},)))}}|||,,,,,((((((((.((((..((......))..)))))).)))))}{{|......))),.,|||||{,{(({{{(({{.{{{{......}}}}.||{{{((({,,((({.,,.))),|}|||,.{((({...))))){|||{|.|{{{{{,.{{{||,,,,......{{{{|||,||||{,...,|||((({..((((((,,{{,,,,.......{{(((((....})))))}.{,,,,...,,,,,{,{,(((,((,,..............,.{,((({,......)))))..((((((((((({....})))...)))))))).)))))))((((((((((.{{.{{{.,.{{.(((((.{.....}))))).,.))).}}.))))))))))....................,,,,.......}}}}.,||,.||{{,|}}}|}}||,.((((((..(((.........,..)))..))))))..||,{{.(((.......||}.||||,.........((((((((...)))))))).(((((((.((((((.,....}.)))))).))))))).......................(((((((......)))))))..}))}}})))}}}}},.(((((((((((,....}))))))))))).......((((((((......))))))))....{(((({,,{,,,..(((((((((.((((((((((((((((............))))))))...)))))))).))))}}))))..}||,,....}}}),.,,..{((((....))))).)})}.})))))|{,|||||}|{{(({,{{{{..{(((((((((((...))))).))))))},{....||}|,{||||||||{(,,,,,(((((((...,,.||||}},||||||{,...,}}}}}}},}}}}}....,.{{{{{{{{.{(({{{{.....{{{{{{{{{||,|||{....{||,{{{..,((((....))))}..)))...||},,.,))),.||,.,}}),,.)))))}))),,.))))}}}})))}))),}.((((((..............(((((.((.(((((.......})))).)).)))))..((((((((((((.......)))))))},))))..((((((.,,.(((,{{.,..,.....}))})},.}..)))))))))))).,}}}||}..}}}}}))}|||{{.{{((((((.......)))))}},)))))}},||||||.|||||{{|{{..{{{{{{{,..,,,||||}}}}..,})))}}||.,{{{{..,,.}||||.,,(((((((.((((((((...((((..,,.(((((((.....,,{((((,((({{{(((((.........,,,},..}}}))))))))))}}}}....))))))).,,....})))....)))))))))).)))))...}},,)))))),})))))).,,|,,}||{{,..,,,,,|||,})}}}.}))))},.......,.(({({....)))}},|||{|.||))),|,,}}}}..,.(((((((((({(({((.,....,{.((((((.((...{((..((((((,,((((((,.((((((..{{.((((,((((((((((({(((((....}}}}.))))))))))))}.(((((((((((((.,{...(((((((...}))))))...),(((((((.(((((((((......{(({,.(((((((.......)))))}),.(((((((({{{{{{,(({{((((,...}}}|......}}...}))))))),,,}))))))....{((((...{{{((((((,{(((....))))))))))}}...))))|(((((...(({......)}}))))))}),.....)))))))))..))))))))))).)))))))))..(((((....))))).(((.(((.((((.{{.(((......))),}.)))).})).)))(((.{{....}}.}}}....,},.}))).}}..)))))).,)}..))))))))))),,)}}...)))))))).}}...}))).)).))))))))))},},|||....{((((((((((...(((((.(((..,..........,..))).)))))...))}...))))))))...,,,(((((({....})))))).{((((,,,....|}|||{....,,.,}})),},,,,,..,,}}}))})))))))))))))).,,{(((({...}))))}))))))))))}))))))))|.{(({((((((..{.......}..)))),..}))))}.,...,.....,))))).....}))))))))))))....))))))}.)))}..,|||}}......},,|},,,,.{,{{.,,||||(((((((((.(((.(((({,..,.........}}.))))..)))..)))))).))).{(((((((((((......)).))))))},))|{{{.,((({{,{{..,.......,})))))..}}))))}}},.....,)))))).....})))))))))))}....)))).)))..))))).}.|}}},(((((((....})))))){{{{.|,|,.(({{..||{|,,,}}))}|,,|,}}||||{(((,.{{(,{,(,.,({{...((((((...))))))...))).,)),,,))),,)},}},}}}..,,,.....,,,.}).)))))))..)),

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001324215.2 NCBI
GCUUCCUUCUCUGGGCAGCAGCUCUGUAAGAAGGAAUGUCAGCUUUUAC… 3779 nt 0.3723
NM_001324216.1 NCBI
GAGCCAAUUUCAGCAAGGCUCUGUUCAGUUGUUCUUAUCUACAUCCUAG… 2381 nt 0.4011
NM_001324217.2 NCBI
GCUUCCUUCUCUGGGCAGCAGCUCUGUAAGAAGGAAUGUCAGCUUUUAC… 2234 nt 0.4091
NM_001410787.1 NCBI
GAGCCAAUUUCAGCAAGGCUCUGUUCAGUUGUUCUUAUCUACAUCCUAG… 3926 nt 0.3688
NM_021952.5 NCBI
GAGCCAAUUUCAGCAAGGCUCUGUUCAGUUGUUCUUAUCUACAUCCUAG… 4007 nt 0.3721
Showing 11 to 15 of 15 entries
Summary

Enables mRNA 3'-UTR AU-rich region binding activity; poly(A) binding activity; and pre-mRNA intronic pyrimidine-rich binding activity. Involved in 3'-UTR-mediated mRNA stabilization; RNA processing; and positive regulation of 3'-UTR-mediated mRNA stabilization. Predicted to be located in axon; cytoplasm; and dendrite. Predicted to be part of ribonucleoprotein complex. Predicted to be active in glutamatergic synapse. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the ELAVL4, a neuronal-specific RNA binding protein, was part of a cluster of genes whose expression was inversely correlated with injury severity following experimental contusive spinal cord injury [De Biase et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00081.2005].