Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001324217.2

Sequence Length

2234 nt

GC Content

0.4091

GCUUCCUUCUCUGGGCAGCAGCUCUGUAAGAAGGAAUGUCAGCUUUUACAUAACGUUCCUUUCCGCUUUUGACACACUGUGUGAGGGUCCAUCUUCUUCUGAUCACAGAUGGAGUGGAAUGGCUUGAAGAUGAUAAUUAGCACCAUGGAGCCUCAGGUGUCAAAUGGUCCGACAUCCAAUACAAGCAAUGGACCCUCCAGCAACAACAGAAACUGUCCUUCUCCCAUGCAAACAGGGGCAACCACAGAUGACAGCAAAACCAACCUCAUCGUCAACUAUUUACCCCAGAAUAUGACCCAAGAAGAAUUCAGGAGUCUCUUCGGGAGCAUUGGUGAAAUAGAAUCCUGCAAACUUGUGAGAGACAAAAUUACAGGACAGAGUUUAGGGUAUGGAUUUGUUAACUAUAUUGAUCCAAAGGAUGCAGAGAAAGCCAUCAACACUUUAAAUGGACUCAGACUCCAGACCAAAACCAUAAAGGCCACUGUUUACCUCUGCUUCAGUUUGCUUUGAUAAGUGACAUGAGAUCUAUCUCUUUGCUCUGACUCCCAUGAAGGAAUAGUUAACUUGCCUAUCUGGAAAAAAACCAAGUAUCUUCUUUGGAAGCGUACAUUACAGAGGUCUCAGGACCAUCUAGUACAUGUUUGUGAACUUUGGUCAAAUUUCCCCCUCCUUUUCAAAUUUCUGGAGUGCAAAACACUCUACUUUAAAUGUUAUGCACAAAGUAGGUUCAGGCAAAUCAAUAGUUAAUUCCAAAGCUGUGAAGGUUAAUGAUUAACAGCUGGAUUCAGGGAAGGUUCUGGAAAGCUCUAAGGCAUCGGUGGAGACUGUAGUGAGCUGUAAAGAAGACAGCUAUUCUGCUGCUGCUGCUAACUGUUUAAACCCAGAUUGUUGCCAGAUCUACCAGUUGUCCAAUACACAUGAAAAUCUAGAUUUUUUUCCUGCCAAUCUCCCAAUUUUUAAAAGCUAGAAAAUAACUCAAAGAAUUUUAAGAAUUAUGUAGGUGGGCCAAACAGAACUUAAUAGUUGACCUUUUGACAGGCAGUUUGCAAACCACCCCCCAACCCACCCCCACCAAAAAAAAAAUGAACUCAAAUUUAAAUAUGAAAACAUCGUUUUGCCAAUUGGUAGUGAAUGGCUCAUUACAGGUCCACUACAGGCUGAGCAUCCCAAAUUGGAAAAUCUGAAACCCAAAAUGCUCCAAAAUUUGAAACUUUUUGAGCACCUACAUGACACUCAAAGGAAAUGCUCAUUGGUGCAUUUUAGAUUUCAAGUUUUUGGAUUAAGGAUGUUGAAUCAGUAUAAUGCAAAUAUUCCAAAAUCUAAAAUUUGUGGUCCCAUUUCUGAUAAGGGAUACUCAACCUGUACUAGGAGGUACCCACAAAUGAUGGUUCCCAGUCAACAAAUAUCCAUUUCCCUUUUAUUAGGGGCAGUGUUACAUGACUCUGUGUGAAUACUGACAGCAUUCAGAGAGCAAUCUGACCUCUGUUCUCCAGAAGCAUGCAAUCUAGGCAUCGGCACAGCACCAAAGCAGAGAAAGAGCAUGAUGUGUAAUUAAGCUUCCAAUGCAUAGUGUGGAUGGUGACUCCAGGGGAAUUGUUCUUUGGGUUAUAACUUCUUUAGUGGGAGAAAGUUCCCACCACACAUCUUGGAGAUCAGGCUCAGAGACACUAAGUGACUUGUCCAAAGCCAUACAACAGGCCAGCAGUGGAGCUCAAGUUAGCUUCAAAAGGGCCUCUGAAGGAUUCUGCCAGAAGAGGAGCUGCUUAAUAUGUUAGCAUGAGCUUGAAAUAAUAAUAAUAAAGAUUAAUAGUAAUGCUAAUUUAUAGUGAGUAUUCACUCUGUAUCCAAUACUAUUAUAACCCUUUUACAUGCUUAAUAUCAUUUCAUCUUUGAAAUAUCCCUGGAGCUAGGUGCUUUACACACAUCAACUCUAAUUCUUAAAAUAGCCCUGUCAGGAGGUACUAUUACCUCCUUUAUACAGGUGAGGAAACUGAGGCCCAAGGAGGCUUAGAGACACACCCAGGAUGACACAAUUGAUAAGCAAGACUUGGAGUAAGAAAAAAUGUUCUAAAAAUAACUCUCUGGCAGUAGGUCGUAAGUGUUGGAAUGUCACACUGCCUGCUUGCUCAGCAACACGUGCAUUCUGUGAGGGUGUGUGGGUGUGUAUUUGGCUCUGUGCACACAUGGGUUAUACUCUCUGGCAUGGGAAGGAGAAUAAAAAGCAAACAAAUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-601.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -645.15

Frequency: 0.0000

Diversity: 488.90

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((..((((((((((((....(((((..((((((((((.............))))))))))...............(((..((((((((((((((.((((....)))).))))......(((((.(.(.((........)).).).)))))...((((((.........))))))...........))))))))))..)))...)))))..))))))...((((((((.....((((.......((.((((..................)))).)).....))))(((.(((((((((........((..(((((((((.(((.((.((((((........(((((.((..((((.....))))..)).)))))((((((..((((.((((((((((((.((.((((((..((((.((.((((((.((((........(((((..((((.......))))...........)))))......))))..)))))).))..))))..)))))))))))))...)))))))))))..))))))..((((.(((((((...(((((((((((((((((((((...(((((((((((((....)))).)))).....(((((((....)))).)))(((.(((....))).))))))))....)))))...(((.............)))(((((.((((............)))).))))).....))))..))))).......))))))))))..((((((...............))))))...)))))))).(.(((((((..(((....)))...((((((..((((((((((((((.....((.((((......)))))).(((.((((.((((......)))).)))).)))..((((((((((.........((.(((((.........))))).))..........(((((((((((.((.((.......))..))..))))))))))).....(((((..(((((..((((....))))..(((......)))..)))))....)))))........................(((((((..(((..........))).....)))))))..))))))))))...)))))))))))))).))))))(((((.((((.(((((..((((((((...........(((((((.((((..............(((((((((...(((...))).)))...)))))))))).))))))).((((.((((((((.(((((..(((((((....((......))..)))).)))..))))))))))))).))))...))))))))..))))).)))).)))))(((.((((....((((....).))))))).)))...............(((((......)))))(((((((((((......))))).))))))((((...(((((......)))))...))))..))))))).)((((.......))))........)))))).)).(((((((((..((((((((.(((((((((((((.(.((.((((((...(((((.((((((((....))))))))))))).(((.....)))(((((....))))).))))))))))))))).(((((((((..((((.((((((.(((.((...............((((.....(((((((......)))))))....))))((((..((...))..)))).)).))).))))))...))))....)))))))))..................((((((((.((...((.((.(((((....))))).)).)).)).))))))))..............)))))))...((((((....)))))).....((((((.....)))))).)))))))).))))..)))))........(((((.((((((((....))))))))....)))))(.((....)).)..))).))))))))).)).((((((((((((((.(((..(((...((((((....(((((.((((......)))).......)))))..((((((..(.(((..........))).)..))))))..))))))...)))...)))))))))....))))))))..((((((((........)))))))).))))))))).)))...)))))))).))))))....))))...........

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((,,(((({,(((({{....||{{{..{(((((((((..,..........)))))))))}..,,....,,,,...{((|,((((((((((((((.((((....)))).))))......,(((((..{,((....,,.{|(((.{{|,|||,},)))|}|..,}}}}..,,}))).....}}}}}.))))))))))..}},...})))}..)))))|,,,((((((((.....((((.......,({((({................}})))}.,,.....))))(((.(((((((((.......,{{..(((((((((.(((.((.((((((........(((((.{{..((((.....))))..}}.)))))((((((..((((.(((((((((((,{((.((((((..((((.((.((((((.{(((,.......{{{{,..(((,.......,,}}........,,.}}}})}.....)})}..)))))).))..))))..)))))))))))))...)))))))))))..))))))..((((.((({{{{...{(((((((((((,,,{(((({...{((({(({(((((....)))},|}||,,{(((((((((....)))).))).}||,|},,.}))}.,},}))))....}))))..,{((.............))}|(({,.,,|{,,{{{,,,,...|||,.}))),}}}},)))}..))))).......}))))))|||..((((((............},.)))))),,,}))))))).{.(((((((..(((....)))...((((((..((((((((((((((.....((.((((......)))))).(((.{(((.((({......)))).)))).)))..((((((((((..,,,.,,,((,(({{{,...,,,,,|||||.,|..........{{((({{{{{{.|,.||.......,,..})..))))))))})).||,.((((((.{{{{...((((....))))..,{,,,,}..,||,.|||}}....,..,,......}}}}}}..}},,......,{{(({,..,,,.,|.......}}}.....)}))}))}.))))))))))...)))))))))))))).))))))(((((.((((.(((((..((((((((...,{..,.,.(((((((.((((..............(((((((((...(({...})).)))...)))))))))).))))))).{{{|,{{(({{{{((((((..(((((((....{{......}}..))))}})}..))))))))))))).}))}.,.})))))))..))))).)))).))))){{{.(({{,.{,||,,....|.|)|}}}).}}}...............{((((......))))}(((((((((((,....,)))))}})))))((((...(((((......)))))...))))..))))))).}{(((.......)))}..,,....)))))).)).(((((((((..((((((((....((((.{(({{{,{{{.||||||}|,|,{,(((((((({,..,{|,,,,,|||{{{{{{..,,....(((((({....}))))))......,,|||||},,,.((((..(.((((...,,...,,})))}..)))).......{((((.....(((((((......)))))))....))))|(((.,({...))..)))}(((((((.((((({.{{|((((((((..(((,....,.............,,},..))).)))))))}.}}}|.})))))})).))))|{||.,,,)))..))))}}}})....}},.,,,,......((((((....))))))..}}}}})))|.....))))...)))))))).))))..)))))........(((((.((((((((....))))))))....))))),.((....)).,..))).))))))))).}}.((((((((((((((.(((..{((...{{{{,,..,,(((((.{({{......}))).......}}))}{{((((((((((....((((,.{,....,)))))))))))))))),}}}}},...)))))))))....))))))))..((((((((........)))))))).))))))))).))).,.)))))))).))))},..,,))))...........