Basic Information

Symbol
ELL3
RNA class
mRNA
Alias
Elongation Factor For RNA Polymerase II 3 Elongation Factor RNA Polymerase II-Like 3 RNA Polymerase II Elongation Factor ELL3 FLJ22637
Location (GRCh38)
15:43772605-43777315
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_025165.3
Sequence length
1755.0 nt
GC content
0.4934

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-579.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -612.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 437.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_025165.3 NCBI
AGAGGAGGUGGCGGUGGUGGCCCUCGCCUGUGGCCCCCGUGCUGCUUGC… 1755 nt 0.4934
Summary

Predicted to enable cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Involved in positive regulation of DNA-templated transcription and transcription by RNA polymerase II. Located in several cellular components, including chromosome; cytosol; and nuclear lumen. Part of transcription elongation factor complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans characterized the platelet transcriptome in patients with acute myocardial infarction (MI) and identified the ELL3 as having increased expression in platelets from patients with ST-segment elevation MI (STEMI) compared to non-STEMI (NSTEMI) [Eicher et al. DOI:10.3109/09537104.2015.1083543].